在陆中天和昆金的努力之下，新生的防卫军正在重建之中；同时，茉莉她们一直在努力寻找散落在各地的防卫军成员们，一同对抗百特星人！！
这天深夜，在小光的梦境中，正发生着她最不想看见的事情：这是三个巨人之间的战斗！一方是百特星人，另一方则是她的父亲————风狄奥特曼，以及母亲————风娜！就在一瞬间，风狄与风娜使用了生命爆炸，与百特星人同归于尽了………… 就在这时，小光被惊醒了，猛地坐了起来大叫：“父亲！？”
随着小光的惊醒，其他人赶紧赶了过来；小利问道：“梦见父亲了？”见小光点点头后，昆金叹了口气，说道：“小光，不仅仅只有你想着你父亲，我们每个人都很希望你父母能够回来。不过现在着急也不是办法，只能静静地等待才行啊！或许，防卫军重建之后就会回来也不一定哦。”
小光看了看昆金后，吁了口气后笑了笑：“知道了，叔叔。”想了一下后说道：“最近比较心烦，老哥，陪我出去走走，行吗？”小利笑了：“方正最近学校放假，我没意见啊！只不过，我觉得有一个人若知道了，铁定会跟你去的。”
小光一愣之后，笑了一下：“那就去蒙古的戈壁滩，借用死亡之虫的传说吓死他。怎么样？”
茉莉听后乐了：“的确。这种虫子是可以吓到陆毅的。据说是出生在茫茫的戈壁沙丘中，拥有着巨大的血红色身体的虫子，它们形状十分怪异，会喷射出强腐蚀性的剧毒液体。此外，这些巨大的虫子还可从眼睛中放射出一股强电流，让数米之外的人或动物顷刻毙命，然后，将猎物慢慢地吞噬……因此，大家把它称为‘死亡之虫’。这种虫大多有1.5米多长，长得如牛肠一般。它通常是红色，身体两端有时会探出犄角。这种蠕虫极为危险，它喷射的致命毒液和释放的电流能击中数英尺外的目标。
“据说，曾经捷克共和国研究小组的负责人伊凡.迈克勒，他曾三次搜寻这种蠕虫。迈克勒在第二次探险中试图用高能炸药引诱蠕虫露出沙漠，但未能成功。2004年，他重返戈壁滩，这次他采用低飞技术来拍摄广袤的沙漠。但在这次探险中，他未能用相机捕获到蠕虫的任何踪影。据说，此蠕虫要用散弹枪才能将其击毙，这也是恐怖之处。因此要去的话，要小心为妙。”
小光笑了：“阿胜哥哥陪我去就行了嘛。”于是，大家回各自的房间继续睡觉了。
第二日，小利，小光和阿胜启程前往蒙古的戈壁滩了，进行为期十日的旅程；这次的蒙古之行，对小利、小光以及阿胜来说，是命中注定的行程，对各自的人生有着很大的影响意义！
另一方面，陆毅听说小利、小光要去蒙古的戈壁滩，而且是下午的飞机，瞬间就坐不住了，冲到陆中天的书房里对陆中天说：“老爸，赶紧的，帮我订一张下午三点的飞机去蒙古！”
陆中天微微一愣后说着：“就知道你肯定会去，而且非常急，小利昨晚就跟我说了一声后，让我叫你只要去飞机场用身份证去，就能领到和他们同一架飞机的飞机票了。”
陆毅一听乐了，抱着老爸狂亲了一口，边往外面跑边说：“老爸！多谢了！”见陆毅几秒钟就消失在了房门口，陆中天无奈得笑了笑：“唉…………这孩子真是的。很担心以后会怎么样。”
这时候，从一边的房间中走出了一个少女，与陆毅、小利、小光一般年纪；这个少女发出了银铃一般的笑容说着：“真不知道小利、阿胜哥哥和小光姐姐会怎么想呢？！我也去看看。”陆中天见这个少女出来，立刻迎了上去：“这样做，真的好吗？琪琪，你父亲为什么会这么安排呢？”
这个少女，正是由大艾制造而出的生化少女——琪琪。
琪琪说：“他并没有因为我是机器人而对我冷漠过，反而还是想对待小利哥哥和小光姐姐一样的，对我照顾的无微不至，使我几乎都要忘却自己只是一个生化人类。如若当初没有将我从残次品里面弄出来，我也没有今天。陆大叔，我们不都是一样的吗？”
陆中天笑了笑：“没错啊！琪琪，准备什么时候动身？”琪琪想了想后说：“和陆毅他们一架飞机吧。之后，这边就拜托您咯！”陆中天点了点头。
第二天，小利、小光、阿胜、陆毅、琪琪先后登上了前往蒙古的飞机了。不过，琪琪坐在了豪华单人间中，暂时不与小利等人见面；不过，小利他们却和陆毅见到了，问明原由之后，调整了位置后，他们几个坐到了同一包间之内了。
小利开玩笑的说：“没行到陆大少爷也会有勇气去蒙古哦。长大了哦！”陆毅自信的点了点头，瞬间坚决不对：“不对啊，小利。你又不是我爸，为什么说我长大了？瞧不起我啊。”随后的旅程上，他们几个有说有笑的。
另一边，琪琪打开随身电脑看着屏幕上的一切，默默地说着：“拉斐尔，还没好吗？”
拉斐尔到底是什么呢？究竟对琪琪来说，这意味着什么呢？在基督教、犹太教及伊斯兰教的信仰里面，这是一位天使长的名字。据传他行使一切治愈的神迹。由于拉斐尔是操治愈术的天使，和蛇的形象便有了牵连。拉斐尔为第二天的支配天使、力天使的君主、伊甸园生命之树的守护者、经常站之在神的御座前的七名天使之一。拉斐尔的传说极其纷乱，他既是大天使，又是力天使，却有炽天使的六翼，又同时属于智天使、主天使、能天使三位阶。拉斐尔的形象一直都是愉快的，除了治愈人的疾苦，还传授诺亚建造方舟的知识与技巧。旧约记载与雅各摔角、解除亚伯拉罕老年行割礼的痛苦的天使亦相传是拉斐尔。他治疗的不仅是人的身体，还包括人的信仰。 在诺亚奥特曼被封印大部分力量之时，所治愈第三位适能者之缺陷的，也是拉斐尔的药物。
琪琪和拉斐尔，究竟是什么关系呢？莫非，琪琪也能够成为真正的人类吗？还是，拉斐尔是能够让所有勇士回来的关键所在吗？
一切，都是谜底啊。