浙直总督宋应昌指挥浙直各路大军围剿倭寇，在陈瀚协助下自宁波、绍兴、松江、嘉兴四府县逐步向杭州湾围剿收网。王安海陆启航率南洋水师主力在杭州湾沿海配合陆路大军进剿逃窜的倭军倭寇。
大批倭军倭寇被赶着朝杭州府逃去，陈瀚率两万义军沿着浙东运河南北进剿，浙江参将骆尚志率万余官兵乡勇向南越过会稽山进入诸暨县一带阻截倭军倭寇流窜其余府县。
宋应昌从苏州府率五千京营赶到嘉兴府指挥各路大军进剿，命浙江总兵侯继高出兵湖州府德清县一带，又命浙江巡抚常居敬率杭州府官兵乡勇阻截倭军倭寇继续流窜，宋应昌亲率五千京营兵马沿杭州湾北岸围堵倭军倭寇登陆流窜。
在舟山海战中北逃流窜到杭州湾一带的三千余倭军倭寇被王安海指挥南洋水师一路追杀落荒而逃，以大村纯宜为侍大将的倭军倭寇纷纷向绍兴府萧山县杭州府之间钱塘江入海口逃去。
随毛利胜信浮海伐明的九州筑后国上妻郡大名筑紫广门率六百家臣武士深入湖州府一带劫掠，没有接到毛利胜信撤军令，筑紫广门得知浙江总兵侯继高率万余明军杀来，慌忙带着两千余倭军倭寇贼寇向西窜逃进天目山中躲避。
浙江官军大多被派到嘉兴府宁波府两线作战，省城杭州府守军兵力单薄，浙江巡抚常居敬临时组织起三千官兵乡勇巡防。
常居敬吸取杭州府于万历十年三月至五月接连爆发兵变民变‘浙二乱’前车之鉴，没有从杭州城中招募游手好闲之辈，而是从杭州府各县招募猎户及乡勇巡防，已先支付一半粮饷，避免多事之秋再次发生变故。
万历九年三月，大明朝廷开始定各省兵马钱量数减饷引发矛盾重重，积怨已久的杭州防汛（倭寇秋汛来袭）募兵不满，募兵聚众讨要说法得到杭州官员接见安抚，但并没有解决问题。
杭州衙差经常盘剥勒索贫民小商贩，缙绅大户勾结官府免去徭役，社会贫富等级差距加大，募兵中多是依附市井恶少（黑社会）游手好闲之辈。
激进愤青生员丁仕卿等人商议趁机以变防汛火甲法，杭州百姓都恨严苛的防汛火甲法，丁仕卿进京上访被安抚回杭州，刚回杭州就被抓捕下狱施以酷刑成为杭州兵变民变导火索。
募兵最先哗变造反，混乱之中，数百名游手、贫民、小商贩纷纷在丁仕卿等激进份子领导下趁着兵变之际袭击杭州城中缙绅四十户，杭州府兵变民兵演化成暴乱，虽被迅速镇压下去，朝廷地方政府也开始实施缓和社会矛盾措施。
万历十九年（1591年）十月初一，京营各武官听信流言误以为朝廷欲减其俸粮，纷纷聚众冲入长安门，欲向内阁控诉。
正好遇上疏请裁冗员以裕经费的监察御史曾乾享兄长工部尚书曾同亨下朝到长安门，义愤填膺的京营武官们纷纷大声嚷嚷大哗，对曾同亨围而辱之。
眼看着大明天子脚下京营武官就要哗变，刚执掌兵部的兵部尚书石星闻讯火速请旨赶来，传旨解散京营武官。掌后府定国公徐文璧被夺俸半年，守门官由法司提审问罪。
明朝中后期时常发生兵变，原因大多都是粮饷不能按时发放被克扣。大明财政一向拮据，加上吃空饷，上下盘剥压榨，底下兵士所得钱粮勉强够维持生计。如今的大明就处在火山口之上，底下尖锐的矛盾随时都会爆发。
陈瀚率水陆大军直奔向绍兴府萧山县赶来，命陈冲率五千陆师经湘湖以东赶到渔浦（义桥镇），堵截大村纯宜一伙倭军倭寇沿富春江西窜作乱。
王安海陆启航两人率南洋水师从杭州湾一路追杀着倭军倭寇逃进绍兴府萧山县龛山与杭州府仁和县赭山镇之间的钱塘江口，（钱塘江入海口杭州湾一带沧海桑田不断变迁），松田一郎率一万陆师在南岸对江中倭军倭寇发起进攻。
大村纯宜正被南洋水师一路炮轰追杀着向西逃来，见钱塘江南岸上出现大批东番守备府、陈字旗号大军，大村纯宜慌忙高呼下令道：“忒带”
大大小小二十几艘倭军倭寇船只纷纷朝着钱塘江北岸的杭州府仁和县一侧撤退，避开南岸的松田一郎发炮轰炸，北岸的京营行军速度很慢，正从海宁县城尾随赶来。
夕阳西下，霞光万丈，一身银白铠甲的陈瀚骑着一匹枣红大马率数千大军刚从萧山县西兴镇穿街而过赶来，一名传令兵跑来禀报道：“报，启禀主公大人，倭军倭寇正向杭州府城方向逃去。”
“命王安海率水师给我追上去”陈瀚当即下令道：“命松田一郎马上赶来汇合，命陈冲分兵渡江在钱塘县拦截倭军倭寇向西逃窜。”
“是”三名传令兵领命而去
骆尚志在诸暨县北部一带剿灭不少零星的倭军倭寇以及趁机作乱的贼寇，得知陈瀚正率大军围剿大批倭军倭寇向杭州省城杀去，骆尚志忙率军北上直奔渔铺赶来。
次日一大早，王安海率南洋水师衔尾直追大村纯宜，大村纯宜带着三千残兵败将不断遭到南洋水师发炮轰炸，倭军倭寇船毁人亡，死伤不少，倭军倭寇纷纷朝着杭州城东南逃来。
一身鬼头狮面具足的大村纯宜指挥着倭军倭寇高呼鸟叫下令道：“快快赶到前面码头，通通弃船上岸。”
“嗨”使番传令兵立即高呼传达军令：“侍大将有令：快快赶到前面码头，通通弃船上岸。”
倭军倭寇将领纷纷高呼下令道：“快快赶到前面码头，通通放弃战船上岸。”
杭州城东南的侯潮门城楼上，一袭绯袍官服上绣锦鸡补子年近六旬，身形略微发福的浙江巡抚常居敬带着一众浙江三司官员正在观战，见大批东番守备府水师战船从钱塘江下游追杀着不下两三千倭寇朝着杭州城东侯潮门外江面逃来。
常居敬见倭军倭寇被东番兵追杀得落荒而逃，更是慌不择路，向杭州城东南侯潮门逃来，已是穷途末路，当即下令道：“传令开城门出战”
“是”棋牌官领命高呼下令道：“军门大人有令，开城门出战。”
侯潮门城门突然打开，吊桥放下，三千杭州官兵乡勇纷纷冲杀出城来。
倭军倭寇船队纷纷在侯潮门外江北岸弃船登岸，大村纯宜刚率着两千余倭军倭寇登岸，一见杭州城中突然杀出三千明军，大村纯宜狂呼鸟叫道：“醒过（进攻）”
“醒过”倭军倭寇将领纷纷拔出武士刀一片叫嚣
面对前堵后追的明国大军围攻，大村纯宜疾呼下令道：“驼子你给（冲锋）”随即带着家臣武士冲杀上去
“驼子你给”两千余倭军倭寇纷纷跟着大村纯宜朝着杭州官兵乡勇冲杀上去
“杀”三千杭州官兵乡勇面对慌不择路弃船逃上岸的倭军倭寇纷纷奋勇冲杀，痛打落水狗的大好机会岂能不抓住，杭州官兵乡勇一片士气高涨，纷纷高呼着冲杀上去：“冲啊，杀光倭寇。”
冲杀在前的浙兵将领不断高呼下令道：“放铳……”
‘砰砰……’三四百鸟铳手纷纷端着长长的鸟铳朝着冲上来的倭军倭寇点火放铳，一阵枪声过后，时隔很久才听见稀疏的枪声响起。
大明南方浙兵大批量装备火器鸟铳，辽东明军还未大量装备鸟铳，明军中普遍使用落后的三眼铳。鸟铳放火药铅弹也很费时，操作更是多有不便，性能与脱胎自葡萄牙人火绳枪的倭军倭寇铁炮相对较高，铁炮枪管较短，射程也相对较短。
大村纯宜高呼鸟叫下令道：“杀给给”
‘砰砰……’五六百倭军倭寇铁炮手纷纷朝着冲杀上来的杭州乡勇官兵点火射击，倭军倭寇阵前枪声大作，硝烟弥漫开来。
冲锋在前的杭州官兵乡勇顿时死伤惨重，尤其是临时组织起来的乡勇纷纷冲杀在前更是伤亡惨重，惨叫声一片：“啊啊……”
一名三十来岁身形高大威猛的乡勇将领身穿锁子甲左手臂中弹流血不止，咬牙忍痛带着数百乡勇与倭军倭寇挥刀奋勇砍杀，身边着两员身穿锁子甲的小将与冲杀上来的倭军倭寇拼杀在一起：“杀，杀光倭寇。”
数百乡勇手中刀弓不断朝着倭军倭寇砍杀放箭，给予倭军倭寇不小杀伤，两员的小将同那员乡勇猛将所向披靡，带着数百乡勇杀得倭军倭寇尽招架不住，纷纷朝后退去。
只见那员乡勇猛将手中大刀上下翻飞砍杀着左右杀伤来的倭军倭寇，朝着身边两员小将叮嘱道：“当心倭寇鸟铳”
“是，爹”父子三人带着数百乡勇越战越勇，一路所过杀得倭军倭寇纷纷退避。
“八嘎”大村纯宜见数百甲胄不全的明军在一员猛将率领下所向披靡，杀得手下死伤惨重，气愤不已怒喝下令道：“干掉那员明国将领”
“嗨”一众倭军倭寇将领带着数百倭军倭寇直奔向数百乡勇杀来，沿途官兵被来势汹汹的倭军倭寇杀得纷纷退避三舍，倭军倭寇所向披靡，直奔向父子三人率领的乡勇杀来。
“爹，倭寇冲我们杀来了。”身形高瘦，一身锁子甲罩着曳撒的小将挽着高髻见来势汹汹倭军倭寇疾呼道：“官兵都抵挡不住，我们快撤吧。”
“撤什么撤”那员猛将挥着大刀疾呼道：“都跟我陈大虎冲上去，杀光倭寇。”
“冲啊”数百乡勇跟着陈大虎父子三人挥着大刀冲杀上去
“驼子你给”倭军倭寇纷纷鸟叫着手握寒光闪闪的武士刀冲杀过来
杭州官兵遇到被陈瀚追杀得疯狂的倭军倭寇悍不畏死进攻，大部分纷纷朝着侯潮门城门败退，只剩下不到一千余乡勇官兵被倭军倭寇缠住脱不得身，拼死抵抗。
正在城楼上观战的常居敬见官兵不敌纷纷败退下来，文官出身的常居敬那会领兵打仗，慌忙疾呼下令道：“快发炮助威，不能让倭寇杀到城下。”
棋牌官忙传令：“军门大人有令，发炮助威。”
城墙上的炮兵忙操作佛朗机炮装填火药炮弹，炮兵将领高呼下令道：“放”
“九州义统”大村纯宜一见陈瀚大纛上的陳字图腾旗号，惊得不轻，疾呼下令道：“忒带”
“忒带”倭军倭寇纷纷跟着大村纯宜撤退出侯潮门外战场朝着西边的玉皇山逃过去