几分钟后，李晓、碇司令、冬月，三个人来到了停放初号机的舱室。冬月命令所有工作人员全部离开这里，并且掐断了监控录像。一会儿后，偌大的舱室里就只剩下了他们三个人。
李晓站在浮桥上，仰着脑袋看着初号机那张沉默的蓝色大脸，这时候他忽然意识到一个非常重要的问题——如果他真的救出了碇唯的话，失去了碇唯的灵魂，初号机会怎么样？
显然意识到这个问题的不止李晓自己，冬月也在后面小声对碇司令说:“如果他真的救出碇唯，初号机该怎么办？”
碇司令没有丝毫犹豫，立即斩钉截铁的回答:“即使失去初号机也无妨。”
碇司令之所以会愿意放弃初号机，一是因为碇唯对他来说远比初号机重要，之前他对初号机格外的重视，也是因为初号机里面有碇唯的灵魂；二是因为碇司令的成神计划其实已经算是流产了，拜李晓所赐，碇唯没有成神，李晓反而阴差阳错的成神了。这种情况下，如果能救回碇唯的话，那么碇司令当然愿意放弃初号机。
其实碇司令还有第三条路可走，如果让初号机吃掉李晓的话，也应该可以获得S2机关，事实上碇司令之前也有过这种考虑，他一直在犹豫。
这是碇司令的考虑，而李晓还有自己的考虑。他之前想着救碇唯完全是头脑一热，现在想想他觉得自己似乎有些心急了。别人不知道，但是他知道，接下来SEELE和NERV将有一场大战，初号机也是重要的战力之一，现在救出碇唯的话初号机肯定无法再继续使用了。但是，既然李晓都已经来到了这里，他也不好意思再反悔对碇司令说你再等两天，只好走一步看一步了，而且李晓也没把握一次就能救出碇唯。
“开始吧，你要怎么做？”碇司令看向李晓，虽然依旧是一副冷漠脸，但是他的眼睛里却透着强烈的期冀。
“好，那就开始吧。”李晓的表情渐渐严肃起来，他深吸一口气，低声喝道。“AT力场，全开！”
话音落下，李晓的身体立刻放出夺目的金色光芒，李晓就如同一轮冉冉升起的金色太阳慢慢漂浮到半空中。没有人告诉李晓他应该怎么做，但是李晓就好像本能的知道应该这样做，直到这时李晓才恍惚的想起来，在之前那个奇怪的梦境中，碇唯似乎给了他某种指引，他慢慢闭上了双眼，让自己的精神化作娟娟的细流，逶迤的涌入初号机的体内。很快，李晓的意识就沉浸了无限的黑暗之中……
当李晓再次睁开双眼，他发现自己站在一片金色的海滩上，天空澄澈蔚蓝，明媚又温暖的阳光从四面八方扑面而来，在阳光的反射下，沙滩上的沙砾就好像黄金一样闪烁着夺目的光辉，远处是一片比天空更加蔚蓝的大海，一望无际的蔓延至世界的尽头，翻滚的白色浪花调皮的拍打着海岸，仿佛带着某种沁人心脾的节奏，若是仔细听一会儿的话，会让人舒服的昏昏欲睡。
在海岸的边上，站着一个一袭白裙的女人，她背对着李晓，安静淡然，似乎正在静静的聆听世界的声音。
即使没有看见这个女人的容貌，李晓也猜到她是谁了。李晓立刻快步走过去，刚想要打招呼，女人却率先转过了头。
“你来了，李君。”碇唯的脸上带着温柔的笑容，竟比阳光还要明媚。
李晓顿时微微一惊，在碇唯身边站定:“你认识我？唯阿姨。”
碇唯温柔的笑着:“我当然认得你，你是真嗣的好朋友，我一直看着你呢。”
李晓细一想还真是，碇唯就是初号机，的确总能看见他。
“那个，唯阿姨，我是来接你回去的，跟我走吧，你儿子和孩子他爸都等着你回家呢。”李晓说完就满脸希望的看着碇唯，他以为碇唯会非常高兴跟他回去，但是出乎他意料的是，碇唯竟然摇了摇头——她拒绝了李晓。
“为什么？待在初号机里面有什么好的吗？”李晓不敢相信的瞪大眼睛。
“当然不是。”碇唯语气温柔的慢慢解释。“只是，第三次冲击的预言还没有结束，悬在人类头上的达摩利斯之剑还没有消失，我还不能离开初号机。”
李晓立马明白了碇唯的意思:“那如果我阻止了第三次冲击呢？”
碇唯露出微微惊讶的表情，她没有想到这个奇怪的少年竟拥有这样的勇气。接着，她微微弯下身子，伸出温暖的手，轻轻地拂过李晓的脸颊，脸上的笑容像阳光一般温柔:“如果真到了那一天，当一切结束，人类迎来了新的未来的那一天，那个时候，麻烦你再来接我吧。”
李晓的视野渐渐变得模糊起来，明明近在咫尺，他却越来越看不清碇唯的容貌了。最后的最后，他听见碇唯对他说:“麻烦你代我向真嗣和源堂问好，让他们照顾好自己。”
再次睁开双眼，李晓又回到了NERV，AT力场迅速散去，李晓还没反应过来就直接从天上掉了下来，一屁股坐在了浮桥上。
“喂，你没事吧。”冬月好心的上来扶李晓，但却被李晓挡住了。
“先别动，磕到尾巴骨了，下半身麻了。”
碇司令面色阴沉的看了看初号机，然后又看向李晓:“失败了吗？”
李晓在冬月的搀扶下龇牙咧嘴的慢慢站起来，点点头:“失败了，唯阿姨她不愿意出来，当初她就是为了阻止SEELE和人类补完计划才自愿留在了初号机体内，她说当一切结束，人类迎来新的未来的那一天，再让我去接她。另外她还说，让你和真嗣照顾好自己。”
李晓说完，碇源堂的脸上立马露出无比落寞的神情，他像是丢了魂一样整个人僵在原地好久，然后他沉默着转过身，独自一人慢慢离开了。他离去的背影就像一只无家可归的断脊之犬，透着数不尽的心酸和痛苦。
李晓看着碇源堂的背影，也忍不住心有所感，不禁叹息一声：“碇司令也挺不容易的，老婆老婆没了，跟儿子的关系也不好。”
冬月神色复杂的看了李晓一眼：“你似乎很了解碇，我越来越好奇了，你究竟是什么人？李君。”
李晓摊开双手，耸了耸肩：“我之前也说了，我什么人都不是，我自己单干。”
冬月警惕的眯起锐利的双眼：“那么你的目的是什么？”
李晓想了想，忽然乐了出来：“说起来，我和你的目的高度一致，我也想摧毁SEELE的阴谋，也就是人类补完计划，对政治有洁癖的你，之所以会帮助碇司令，也是为了这个吧，冬月老师。”
冬月微微露出吃惊的表情，随后又颇为怀念的自言自语道：“冬月老师……很久没有人这么叫我了。”
“话说，我接下来该去哪？还回去那个牢房里？”李晓一指自己的鼻子问。
冬月也不禁犯了难，他稍稍犹豫了一下，然后对李晓说：“你还是……”