孙立人第二天早上。再一次来到明阳山草山行宫的废区，他命令第四军官训练班从新一军调来的一百多名参加缅甸过作战时期的训练班的教员。他命令自己的这些老部下，再认真清理一遍废区，一定要查明蒋介石的下落，尤其是要注意总统行宫中到底有没有地下通道，他告诉自己几个绝对亲信，如果有地道，在地道中要发现“可疑的人”不用请示，予以击毙，然后毁尸灭迹。
在中午时，搜查终于有了结果，在草山行宫原来中庭的小花圃旁边，发现了一个设计的很隐蔽，但已被炸塌了的一条地道。孙立人的这些亲信随后钻了进去，在这条长达280多米的地道里没有发现任何人，只是发现了几箱故宫博物馆的文物和一吨左右的黄金，320多万美元现金。最后在阳明山上的宪兵大队队部的废区中好不容易的钻了出来，在宪兵大队队部的废区中除了找到了12具尸体和部分人体的残骸外，在没发现什么有价值的线索。
孙立人不甘心的命令第四军官训练班的学员队，在明阳山周围的山上进行地毯式搜查，绝不放过任何一个角落。对于蒋介石一定要活见人，死见尸。
孙立人随后以国民党陆军总司令的名义，调集了自己能信得过的190师火速进入台北。21日晚8点，在陆军总部小礼堂，召集了台湾岛上的陆海空师以上的将领开会。在会上他宣布，昨晚总统官邸遭遇空袭，蒋介石总统在空袭中身亡。为了不使台湾发生动乱，自己身为陆军总司令，在此时必须承担起对国家的责任来。现在他决定对整个台湾进行军管。并成立了以自己为首和各军种的参谋长为副的台湾军事管制委员会。
会议开了三个多小时，与会的有些将领表示一定服从军管会的领导，共赴国难；也有些将领对军管会的合法性表示质疑，但真正表态的人并不多，绝大部分人持着观望的心态。但不管怎么说，孙立人是国民党陆军总司令，是现在露脸的军方最高领导人，出来主持大局也是理所当然的。对于他的命令在没有更高层的人物和组织出来之前绝大多数的将领还是表示服从的。
不管是什么人总是怀有有一定的野心，有些野心就是自己在客观条件不具备的情况下都不知道，但当外界条件适宜时，这种野心就会显露出来，就会膨胀。孙立人从未担任过任何行政职务，在党务和财经系统也无亲信干部，在国民党内军内人脉也不是很旺，对那些老资格资历的将领相比也只是平平，他本人在台湾并不具备号令四方的个人威望，而对军队也只是控制其中一极少部分。但他此时他感到台湾就在自己的掌控之中了。在洋洋得意之时，难免会有些忘乎所以自我膨胀。山中无老虎猴子称大王，他也不免做起了在台湾称大王的美梦来了。本来和解放军粤闽前线指挥部约定好了。除掉蒋介石及国民党军政要员后，由他掌握台湾军权后宣布起义，迎接解放军进岛。可是当他真的掌握了台湾的权利后，就又想为自己争取更多的权利和利益。
会后他致电解放军粤闽前线指挥部，表示愿意以周恩来提出的和平解决台湾问题的十条方针，进行和中共进行谈判。对解放军进入台湾岛的问题只字不提。对解放军粤闽前线指挥部进岛的要求也是以各种借口一拖再拖。9月25日粤闽前线指挥部致电孙立人，让他在27日前，派台湾高层人士前来澎湖岛洽谈解放军进岛问题。
孙立人上台第一件事就是从监狱中把被蒋介石关押近三年的原新七军军长李鸿和夫人马真和原新七军将校级军官陈鸣人，彭克立，等人放了出来委以重任。
27日孙立人派李鸿，陈鸣人代表自己前来澎湖岛想就周恩来提出的和平解决台湾问题的十条方针和我军进行谈判。到了澎湖岛后，他们事先会见了，先期到达的国天亮和陈光。当国天亮听了李鸿，陈鸣人等人说明了孙立人的想法后，摇了摇头说：“这事恐怕没有总座想的那么简单。当初我和总座研究时，想能不能象张学良西安事变那样，先把蒋家父子先抓起来，然后和中共谈判接受周恩来得和平解决台湾十条方针。但算来算去我们没有那个力量。台湾没有一支我们自己能真正掌握的部队。兵临城下要想弟兄们能有个好的前途，只有反蒋起义这一条路可走。我来到澎湖后，解放军制定了斩首行动计划，在打掉国民党首脑后。让总座借此机会控制台湾的军事指挥权，随后撤出沿海前沿滩头阵地，迎接解放军进军台湾。如果总座不能控制台湾的全部军事指挥权，则令能控制的部队撤出滩头阵地，迎接解放军进岛。由解放军自行解决台湾岛内敢于顽抗的部队。对于总座和我们这些人，中共方面也都做了具体的安排，原则是愿意留在军队的可以继续留在军队；不愿意留在军队的可以在中央和地方安排新的工作，总之时官阶和待遇比在国民党只高不低。但现在总座想按周十条来处理台湾问题，中共恐怕不会答应。另外，我还要告诉你们，解放军粤闽前线指挥部，对于总座出尔反尔很不满。你们谈时要注意态度。”国天亮想了想又说“要依我的意见，我们还是按事先和中共约定的办，这样对谁都好，免得双方军队骨肉相煎，台湾百姓生灵涂炭。据我这几天所了解，中共决心已定，军力强大，现在没有谁能挡住解放军进军台湾。”接着国天亮讲了这几天在澎湖岛的所见所闻。
接待李鸿，陈鸣人一行的是解放军海军陆战一师师长万均和政委肖强。说实话对于象李鸿，陈鸣人这样的人在万均和肖强这样和国民党厮杀多年的共产党员的眼里是很不受待见的，在他们的思想中被我军释放又重新跑到台湾的人能有什么好人，绝对是国民党顽固分子。这次谈判本来应该是朱少青和28军政委和孙立人的代表谈，可是这个朱大胡子先是推拖他28军的事情太多。这儿忙那儿忙的，后来干脆说：“谈，我和他们谈个吊毛！谈有什么还不是说变就变。我可没闲心和他们扯皮，要谈等我们到台北后再谈吧。”
双方一见面，李鸿就认出了肖强，1948年肖强当时在东北军区政治部当政工科科长。在长春和平解放后，曾多次找过解放的李鸿谈话，劝他不要对蒋介石政权报有什么幻想，打倒蒋介石，解放全中国，以是不可阻挡的历史潮流，顺者昌，逆者亡。可是李鸿表面哼哼哈哈的答应，心里不为所动里，最后还是跑到台湾来了，只是让他没想到的是，到台湾让老蒋关进了监狱。更没想到今天又在这里再次的见到肖强。
寒暄了几句落座后，李鸿率先说：“我们奉孙立人总司令的命令，前来就周恩来提出的和平解决台湾问题的十条方针和你们进行谈判，我们想......”
“停，停，停！”万均毫不客气的打断了李鸿话说：“你要谈的内容，你是来错了地方，到我们这儿来，我们只谈我军何时进驻台湾，以何种方式进驻台湾的问题。”
“这两点并不矛盾，”李鸿说“你们按着你们总理说的十条方针办，宣布孙立人为台湾特别行政区行政长官。在台湾实施一国两制，你们就可以马上进岛。”
“周恩来提出的和平解决台湾问题的十条方针，是有着时间限制的，是指在1951年8月31日前，这一点我们早在8月15日就正式通知了国民党当局。”肖强说“所以现在已不存在这个条件了。现在和谈只能参照执行1949年4月15日中国共产党和平协议最后修正案。”
“那样我们要回去和孙总商量才行，恐怕贵军就很难马上进驻台湾岛了”李鸿也有些无奈的说。
“进不进岛，何时进岛那不是你们孙总说的算的事，”万钧很不耐烦的说：“我们现在找你们来，只是给你们一个重新作人的机会。如果你们不知道珍惜那就怪不得我们了。”
“万长官，我们是你们请来谈关于贵军进驻台湾问题，”李鸿感到面子上很过不去。他很不满意的说道：“你这话说的就有点过份了，”
“不过份，一点都不过份，‘万均摇着手说：“你们回去告诉孙立人，他言而无信，已经违反了我们之间的协定，他说好了起义，可是到现在玩起什么谈判来了。我们现在很怀疑他的诚意。如果他感到他比蒋介石强，比蒋介石有办法。那他也可以试一试。我这个人不是谈判的料，喜欢直来直去，我就和你们直说了吧，9月30前我们一定要进军台湾，至于怎么进就看你们的了，总而言之我们是要进军台湾的。”
“我们都是军人，都枪林弹雨几十年”李鸿也硬了起来说“谁也不是几句话就可以吓回去的。”
“好啊，”肖强笑着对李鸿说：“李军长，我们没有丝毫吓唬你的意思，只是通知你们一声，如果你们还想打一打也好。毛主席说过：扫帚不到灰尘照例不会自己跑掉。现在看孙立人也不会甘心自己退出历史的舞台。”他停了一下，看了看李鸿说：“李军长，我们是老朋友了。我可以告诉你，你上次可以从长春跑来台湾，这次恐怕就不会像在长春那样轻松了，你也没地方再去了。”
国天亮看谈的如此这样僵，知道如果这样谈下去不会有什么好结果，连忙说：“万师长，肖政委，李长官也是奉命行事。他刚刚从国民党的监狱才出来。对有些情况也不是很了解。”
肖强说：“天亮，我们和孙立人之间的事情，前前后后都是你一手经办的，怎么回事你是最清楚不过了。现在我们解放台湾的时间一拖再拖。已经给你们留足了时间，我现在可以告诉你们，9月29日是你们起义的最后的期限。我们不能在等了”说着把最高首长的《向台湾进军的命令》拿了出来交给了国天亮。说：“，这是我们的进军命令，你们再讨论一下。给孙立人取个电报。”
休会后，国天亮说：“大家都看到了毛主席，向台湾进军的命令。解放台湾已成定局。现在的局势十分严峻了。我认为，是战是和对于台湾最后的结果是一样。但对我们这些人就不一样了。战，到最后我们这些人就是战犯；和，我们就是解放台湾的功臣。现在68师师长王绍辉被任命为解放军澎湖警备一师师长兼解放军澎湖前线指挥部副参谋长，官职副军级。前天下的任命，晚上兴高采烈的请我和解放军前指的几个领导一起喝酒。哎，想当初我们没有谈判的本钱时想起义，现在有了点本钱又想和共产党讨价还价。我看总座在这个问题上是聪明一世糊涂一时啊。”
军事上的威慑，国天亮的劝说，使李鸿等人一行都低下了头，他们不得不考虑自己今后的前途和出路问题。最后大家一致，决定回去一起劝说孙立人放弃不适合实际的想法，尽快迎接解放军进岛。以免夜长梦多，再节外生枝得搞出点什么事来，绝了自己的后路。至于哪支部队想进行抵抗，让解放军自己解决好了。
他们和解放军粤闽前线说明了情况后，马上乘飞机赶回了台北。就在他们在国防部向孙立人汇报澎湖岛之行和解放军洽谈情况一及他们的想法时。台湾的局势发生了让他们意想不到的激烈的变化。