南华联邦共和国经过多次调整现在已经有一个很严密的国家机制，国家机器的各部门都有着明确的分工。
联邦的战略核力量不论何时都由联邦总统指挥和控制。
联邦国家安全委员会是国家最高防务决策咨询机构。
其法定成员包括总统、副总统、总理，外长和国防部长，总参谋长是其法定军事顾问，联邦安全总局和军事情报总局的局长是其法定情报顾问。
该委员会的日常工作由联邦安全总局局长负责。
国防部是总统领导与指挥武装力量的最高军事机关，负责防务政策、计划的制定和实施，以及所有国防事务管理，并通过总参谋部对全军实施作战指挥。
它由国防部本部系统、军事系统和作战指挥系统三部分组成。
国防部本部系统主要负责政策、财政、军务等全军性事务，以及各军事部间的协调。
下设政策、采购与技术、人事与战备、审计与财务、指挥通信控制与情报、立法、后勤事务、情报监督、行政管理、公共事务、监察、作战试验与评估等部门，分别由副国防部长、助理国防部长、主任、局长或部门长等主管。
军事系统包括陆军、空军，海军，特殊作战，战略力量共五个军种的军事作战司令部。
各军种司令部负责本军种的行政管理、教育训练、武器装备研制和采购及后勤保障等事务，并有责任在战时向各联合作战司令部提供作战部队及相应的勤务和后勤支援，但无作战指挥权。
各司令部总司令是本军种最高军事长官。
作战指挥系统指总参谋部和国家指挥中心。
总参谋长既是总统、国防部长、国家安全委员会的军事咨询顾问，也是总统和国防部长向联合司令部和特种司令部发布作战命令的军事指挥机关的长官。
从某种意义上讲，国防部是总统的军政部门，而总参谋长是总统的军令部门。
参谋部成员包括总参谋长，副总参谋长，五大军种总司令和参谋长，军事情报总局局长。
总参谋长是南华联邦最高军事长官，是总统和国防部长的首席军事顾问。
总参谋部下设的联邦军事指挥中心，负责处理日常事务，作战指挥及情报业务，是真正的军事大脑。
南华联邦设9个军区司令部和首都特别军区司令部，它们是属于国防部指挥的非战时高级作战指挥机构。
南华联邦的部队除执行特别勤务者外，均编人某一司令部，一旦发生重大紧急情况，各司令部即可对编人本司令部的部队实施作战指挥。
必要时，也可根据总统指示由总参谋部将其他司令部的部队临时划归处于紧急情况的联合司令部指挥。
南华联邦武装力量由现役部队、后备役部队和军内文职人员三部分组成。
现役部队分属陆军、空军，海军，特殊作战和战略力量五大军事司令部领导。
后备役人员按动员程度分为三类：
第一类为待命后备役人员，即编人后备役部队的精选后备役人员，可立即用于增援正规部队。
第二类为待编后备役人员，即动员时可征召的参训个人。
第三类为退役后备役人员，必要时可应召增补负责作战支援和训练的部队。
文职人员是华夏联邦政府雇员的一部分，本国雇佣的称直接雇员，由住在国政府雇佣的称间接雇员。
从事的工作种类有科学家与工程师、行政管理人员、技术员、秘书和办事员、服务员、勤杂工等。