轩辕本来就是圣父门下，并且得到神农丹道传承，虽然神农临走之时并没有明言，但是人族大部分部落都把轩辕当成了人族下一个人族共主，只不过没有谁明确说出来，大家也都想看看轩辕的本事。
有一次，有熊部落捕获了一匹野马，每当人们接近它时，它就前蹄腾空，昂头嘶鸣，或把后腿崩起，但它并不伤害人和其它动物，只以草为食。当时人们都还不认识这种动物，便把轩辕请来辨认。轩辕观察很长时间，也未能认出是什么动物，只让大家不要杀掉，派驯养动物的能手王亥用木栏先把它圈起来。
过了一段时间，王亥发现栏杆外边又来了几匹这种红色的野马，它们对着栏杆内的那匹野马叫个不停，不肯离开。过了一天，王亥把木栏门打开，不料外边的好几匹野马一下子都冲进木栏，和圈在栏内的野马混在一起，互相嘶叫了一阵，然后又都卧了下来。王亥把栏杆门关住，用割来的草喂它们。过了不长时间，其中一匹马突然生下了一只小马驹。王亥高兴极了。消息传开，人们也都纷纷前来观看。这些野马和人接触的时间一长，好像发现人类并不想伤害它们，所以在人面前也不惊慌，变得十分温顺。特别是小马驹，很喜欢和人在一起玩耍。
有一天，王亥喂过马后，牵出一匹性格温顺的马，纵身跳上马背。马一受惊，猛地四蹄腾空飞奔起来，把毫无精神准备的王亥一下子抛下来跌了个仰面朝天。等王亥从地上爬起来，马已跑得很远了。王亥站起来望着越跑越远的马，心里十分着急，以为它再也不会回来了。正要往回走，不料，这跑得很远的马，又扭头跑回来了。王亥高兴极了，忙把马引进栏杆内圈好。后来他想出了一个办法，用桑树皮拧成一条绳子，把马头绑好，慢慢牵出来。然后又跳上马背。马仍像头一次一样，四蹄腾空，飞奔起来。这回王亥吸取了上次教训，一只手紧紧抓住绑在马头上的绳子，另一只手又紧马鬃，任凭马怎么飞跑，王亥总是不松手。跑了一阵后，马的速度减慢下来，直到马不再跑时，王亥这才勒过马头，缓缓地骑着回去。
在后来一次常先骑着马射死一直鹿以后，大家认识到了马的巨大作用，不仅可以用来驮东西，还可以骑着战斗。
后来有一天，山洪突然暴发。洪水像一头猛兽，横冲直撞，滚滚而下，把半山坡上群民的房屋、生产工具和食物冲得一干二净，连正在山上伐木造房的共鼓，也被洪水卷走了。
却说共鼓和朋友狄货被洪水一直冲下山，卷进一条大河里。他们两人抓住漂浮在水面上的一棵大树，始终没有放开。当他两缓过气来发现洪水不论怎样上涨，这棵大树始终浮在水面上沉不下去。原来，这棵大树半面子都是空的。大浪击来，只把大树翻个过，仍照样地浮在水面上，始终没沉下水去。
共鼓和狄货坐在空心树的两端，把树身稳住，就这样听天由命地漂，由于没有东西吃，他两饿得昏了过去。当他们苏醒过来时，洪水不知啥时候已经退了，他们乘坐的大树已被夹在河边一块巨石缝里，他两又饥饿又疲劳，连说话的力气都没有了。这时幸亏有一个部落打猎的队伍经过这里把他两救了出来。得救之后，共鼓和狄货问起那些当地人，才知道离开有熊部落已经不知多远了，两人也不知道回去的路。沉默了很长一段时间，共鼓突然对狄货说：“咱两既然能扒着大树漂流到这里，难道就不能扒着这棵树再漂去?”
狄货觉得他说的话很有道理。于是，他两便动手把夹在石缝里的大树使劲拖出来，又用树皮拧了一条长绳，先把大树一头拴住，然后把大树使劲拖出来，又用树皮拧了一条长绳，先把大树一头拴住，然后把大树推进河里，共鼓牵着绳子的另一头往前走，大树也顺水移动，共鼓又让狄货坐上去，自己牵着绳子走了一段路，同样证明大树在水里不会沉下去。两人这才借来了刀、斧等工具，把大树两头修理了一番，又从当地群民那里讨了一些吃的东西带在身边。一切准备停当，他们便告别了当地人，冒着生命危险，登上了这棵空心大树，费了九牛二虎之力，经历千辛万苦，终于回到了有熊部落。
从此，人类就有了船，以前不能到达的江河现在也不再成为人类的阻碍。
有了马与船之后，有熊部落就比别的部落多了两种交通工具，在以后的狩猎以及与外族的争端中占了很大优势，渐渐周围的部落都愿意归附到有熊部落。等马和船传到别的部落以后，那些观望的部落也都逐渐与有熊结盟。有熊氏的实力一天比一天大起来。
轩辕在得到神农的丹道之法后，又结合自己从玄天道学到的炼丹术，总结出一整套适合人类的医药宝典，作《黄帝内经》。并定下历数、天文、阴阳五行、十二生肖、甲子纪年等等规矩。
神农虽然教会了人族种植，灌溉等，让人族不在收到饥饿的威胁，但是那都只是一些简单的方法。
而轩辕不同，他从老师那里学到的是完整、系统的农林牧耕之术，两者之间的差别还是相当大的。轩辕在自己的部族中运用了老师教的方法之后，发现比起以前的收获不知大了多少。等到轩辕把这些东西传到各个部族之后，所有的人类都承认了轩辕的地位，便是有史以来，第三位人族共主。
成为人族之主后，轩辕开始了一系列的动作。他划野分疆，八家为一井，三井为一邻，三邻为一朋，三朋为一里，五里为一邑，十邑为都，十都为一师，十师为州，并全国共分九州。
他在部落内部提出“六禁重”，“重”是过分的意思，即“声禁重、色禁重、衣禁重、香禁重、味禁重、室禁重”，要求所有人节简朴素，反对奢靡。提出以德治理部族，“修德振兵”，以“德”施天下，一道修德，惟仁是行，修德立义，教养百姓九行，即孝、慈、文、信、言、恭、忠、勇、义。在使用人才上，访贤、选贤、任能，因才使用。实行以法治理，设“礼文法度”、“治法而不变”，命力墨主管刑罚，对犯罪重者判处流失，罪大罪极者判处斩首等。