在这次珍珠港袭击中，美国太平洋舰队被击沉、击伤军舰3艘，其中有战列舰艘，巡洋舰4艘被击沉，被击毁飞机37架，太平洋舰队主力几乎全被消灭，死伤4多人。最要命的是，欧胡岛上的船坞和油库、弹药库几乎都被摧毁，山姆大叔的太平洋舰队唯一没有被打击的就是出海训练的几艘航母，这些航母现在也失去的母港，成为了无处安家的流浪儿。
同时，由寺内寿一指挥的日本南方军4余万人，分兵数路进攻香港、马来西亚、菲律宾、印度尼西亚和缅甸。日本出动以航空母舰为核心的第一机动部队向印度洋进军，准备挑战英国在印度洋的霸权。
原本这次行动，日本的主要目标是美国航空母舰，但空袭时没有一艘停在港内。日军对其他舰只攻击，彻底瘫痪了美国太平洋舰队，以极小代价获得极大成功，短期内美国海军无法干涉日本在太平洋的行动，与历史上不同的是，这次行动还彻底摧毁岛上的维修设备、油库和其基地功能，并且被击沉的军舰数量要多得多，这大概是由于1式攻击机的出现，导致战果发生了变化。日本只损失了21架飞机和2名飞行员以及几艘袖珍潜艇。
珍珠港已经成为一片废墟，等到下午，几艘美国航母回到这里的时候，看到的是仍然浓烟滚滚的基地，到处是受伤的美国大兵痛苦的嚎叫声，以及海面上漂浮着的无数尸体。美国航母上起飞了几架侦察机飞向岛北但未能发现任何敌机或敌舰。
赤城号航空母舰指挥室里，南云忠一正在和几名参谋人员，第一驱逐舰战队司令大森仙太郎海军少将、第三战队司令三川军一海军中将，以及吉田正一、友永浩二等几名航空队长商量下一步行动。
南云忠一皱着眉头听完了第二波攻击编队指挥官友永浩二的报告，目中精芒隐现，大声道：“诸位，这次袭击美畜珍珠港的目标，主要是太平洋舰队的航空母舰，但是从前面两个波次的攻击来看，美国人的太平洋舰队已经被我军打得快要全军覆没，最令我担忧的是，没有找到美国人的航母啊！不把美国人的航母干掉，咱们日本就有如芒刺在背，随时可能遭到美军的反攻！”
三川军一点点头道：“不错，山本五十六将军认为战舰的实用性已成过去，战场决胜武力应是航空母舰，且美国工业能力远胜日本，若持续消耗战日本必败，同时，为了保证取得南进资源的顺利，日本必须要迅速而主动地消灭美英在远东的主力海军舰队，分别是美国驻于菲律宾的舰队、太平洋舰队和英国远东舰队。而这次咱们袭击美军太平洋舰队将会成为整个战役的关键，现在美国太平洋舰队虽然几近瘫痪，但是战斗力最强大的航空母舰却在，对于咱们日本舰队来说，美国人的航母才是最大的威胁，如果不把这几颗钉子拔掉，咱们这次行动就不能算是达到目的。”
南云忠一沉吟道：“大本营对美国的作战方针，那就是以突袭手段一举全歼或重创美国太平洋舰队，确立起日本的军事优势，并不断对美国实施主动进攻，使其无法积蓄起足够与日本对抗的力量，从而赢得战争的胜利。而这一战略的关键就是对美国太平洋舰队的突袭。而击沉三艘航空母舰，则是关键中的关键，可是现在看来咱们的主要目标，美国太平洋舰队的三艘航空母舰及二十二艘其他军舰不在珍珠港。如果就此收兵，那咱们这次行动的任务就没有完成，但是如果继续在这里搜寻美国航母，已经失去了突然袭击的效果，必须要和美国航母正面对战，以咱们日本舰队的实力，跟美国人的航母舰队正面作战，胜负只是五五之数！各位有什么好的建议没有？”
吉田正一小心地道：“将军阁下，我认为咱们应该继续进攻！美国人大概想不到咱们还会对他们的航母发起攻击，按照常理来说，咱们是应该撤退了，不过咱们就是要不按常理出牌，再打美国人的一个措手不及。况且，我相信咱们的航空兵并不比美国舰载航空兵差，现在咱们有三十几架零战，还有数十架1式攻击机，都可以承担制空作战任务，而其余的99舰爆和97式舰攻则可以分别使用航空炸弹和重型鱼雷对敌舰队实施攻击。只要让美国航母上的舰载机飞不起来，咱们就稳操胜券了！”
大森仙太郎点点头道：“吉田君说得没错！斩草要除根，否则等美国人缓过劲儿来，倒霉的就是咱们了！我想美国人大概想不到咱们会再次对他们发起攻击，我第一驱逐舰战队可以为打击美国航母提供支援！”
南云忠一看了看三川军一道：“三川君，你认为咱们是否有必要进行第三个波次的攻击？”
三川军一握紧了拳头，大声道：“大日本帝国成败在此一举，咱们必须把美国航母炸沉，才可以放手去占领整个太平洋东部，进而正面抗衡美国，同样才有足够的资源支撑对华战争，帝国必须尽早把华夏拿下，才能成就不世霸业！”
南云忠一沉吟道：“只是现在美国航母在哪里，我们必须要查探清楚才行。这样吧，既然大家都认为应该继续行动，我就先给山本五十六将军报告下一步行动计划，先进行大范围侦察，一旦发现美国航母编队，立即起飞第三个波次飞机进行攻击，不打掉美国航母誓不罢休！”
说完，南云忠一又朝吉田正一道：“吉田，你马上派出侦察机，向各个方向进行侦察，重点是珍珠港，我相信美国航母一定会回去。”
吉田正一立即站了起来，大声道：“哈依！”
很快，就有十几架侦察机从6艘航母上起飞，朝各个方向飞去。同时，南云忠一也通过无线电向山本五十六报告了前两个波次的战果，以及下一步的行动计划。山本五十六也赞成继续寻歼美国航母，于是又一场激烈的海空大战即将上演！