傍晚时分，天京城里残阳如血，街道两旁不时见到倒下的尸体，有些人是缺粮饿死的，天京城里的大锅饭，导致粮食奇缺。更多的人，是被杀的。
翼王石达开和随员曾锦谦、张遂谋进天王府见洪秀全，他带回五千精兵都驻扎在城外。一路上，他们都感觉到天京城里的气氛有一些不对劲。
曾锦谦上前悄声对石达开说：“城里很诡异，比以前多了许多童子军。原来的军士到哪里去了？”
石达开点点头，说：“本王知道你要说什么。我们先去见天王，看看他的态度。”
石达开等人到了金龙殿，没想到北王韦昌辉也在。
韦昌辉杀了东王杨秀清之后，北王就是除了天王之外最大的王，他便取代了杨秀清的位置。
但当时的南京城里，流言四起，说北王韦昌辉屠杀东王府的人，是出于私仇，是为了夺权，韦昌辉感觉自己有点委屈，掌权也有点名不正言不顺，就请求天王洪秀全将杨秀清的首级标为“老奸头”，挂到城头示众，并对杨秀清进行鞭尸，昭告天下北王是奉旨杀逆。
洪秀全有点不乐意，韦昌辉当政的这些天，他明显感觉到，韦昌辉比杨秀清更专权、更残忍，心胸更是狭隘，一言不合北王就对朝中大臣大肆杀戮!
洪秀全对北王的印象分急剧下降，于是他故意问翼王石达开的意见：“杨逆窃据神器，妄称万岁，已遭天谴，但朕念及他过去有功于天国，不忍再行屠戮。翼王意下如何？”
石达开说：“东王伏诛，确实不应该再乱杀无辜。请天王下旨，立即制止天京城内的杀戮行为。臣走到天王府，一路所闻，都是兄弟家属的痛哭声，撕心裂肺，整个天京城里现在人人自危。”
北王韦昌辉听了天王洪秀全和翼王石达开的对话，十分愤怒，感觉自己被天王耍了，而且翼王话中有话，在批评自己，他坚持要天王洪秀全下诏公布东王杨秀清为“东孽”。
最终，天王洪秀全变了脸，满足了韦昌辉的要求，下诏说杨秀清为“东孽”。
石达开却又站出来，说“此事万万不可”，并痛斥韦昌辉乱杀无辜，“那些被你杀掉的兄弟，他们真的都是反贼吗？他们的命就像是蚂蚁一样吗？他们没死在和清妖作战的战场，却死在了自己的家中，这是为什么？”他要求洪秀全下诏让北王停止天京城里的杀戮：“东王这些年来劳苦功高，一旦被指东孽，天国的军民之心必乱。现在天王宜葬了东王，安抚人心。”
令石达开意想不到的是，洪秀全竟然拒绝了他的这个提议。为什么呢？因为洪秀全也想彻底清除东王杨秀清对他的威胁，他是在利用韦昌辉这把嗜血的刀子，清除东王部下。
石达开有点愕然，他原以为洪秀全会支持自己，所以没带兵就进城了。当他和洪秀全、韦昌辉都见面后，一番交流，他才发现自己的处境危险。
于是，石达开趁天王洪秀全和北王韦昌辉还在议事，找了个借口，说自己已经多日没有见到家人，想先回翼王府和家人团聚。
天王洪秀全说：“这样也好，翼王你先回府休息。天国遭此巨变，以后很多事还少不了你。”
翼王石达开便和随员曾锦谦、张遂谋出了天王府。
曾景谦和张遂谋让翼王赶紧出城：“北王对你已经不满，再晚就来不及了。”
石达开有点着急，说：“我的家眷都在天京城内，怎么办？”
张遂谋说：“我们现在手中得有兵，支持我们的人越多，翼王府才越安全！”
于是，三人急急忙忙准备逃出城。太平军建都天京后，是石达开负责天京城的卫戍工作，建立起严密的防御、警戒体系。石达开对天京的城防比较熟悉，便假装奉天王之命巡察，然后支开了守城的兵士，悄悄开缒城而逃，一路狂奔到了自己的营地，立即集合了上万支持他的队伍，对城里发出通牒：天王必须立即下诏停止北王的杀戮，否则就攻进城清君侧。
那天韦昌辉见石达开回天京后，偏袒杨秀清，于是对天王洪秀全说：“石达开和东王交往甚密，奉召诛杀杨秀清也是姗姗来迟。不得不防。”
洪秀全问道：“他也是东党余孽？如何是好？”
韦昌辉这时信奉简单粗暴的方法最能解决问题，他对天王洪秀全说：“杀！斩草务必除根！”
洪秀全想了想，石达开一向得军心民心，如若不除，他可能要为东王翻案，威胁自己，于是天王又欲杀石达开，让韦昌辉去翼王府抓石达开。
当夜，韦昌辉率部包围了翼王府，却发现石达开等人根本没有回府，他预感大事不妙，问身边的陈承容：“翼王肯定有所察觉，我们怎么办？”
“我刚收到密报，石达开已经出城了，集合了一万余人，要清君侧。”陈承容回答韦昌辉说：“以天王的性格，他八成会妥协。一旦天王和翼王妥协，我们就会成为人人唾弃的牺牲品。”
听了这话，韦昌辉气得咬牙切齿，浑身发抖，对陈承容说：“你的意思是现在我们没有退路，如果翼王和天王勾结，我们就会成为第二个杨秀清？”
陈承容说：“是的，我们现在只能逼反石达开，才有活路。”
“老子已经杀了这么多人，也不差翼王府这几个，那就杀！”韦昌辉于是一不做，二不休，连夜血洗翼王府，将石达开家眷及翼王府内人员全部赶尽杀绝，还把他们的尸体扔到城外。
石达开闻讯，赶去收拾了家人的尸体，彻底愤怒了，他失声痛哭，对天发誓：“不见到韦昌辉的人头，誓不罢休！”
洪秀全听说韦昌辉又屠杀了翼王府，惊得出了一身冷汗，连声叫道“韦昌辉这个疯子，这个疯子”。
韦昌辉也很快来见天王，要求洪秀全下旨杀叛逆石达开：“翼王也谋逆！”
洪秀全不傻，一边是杀红眼了的北王部在城内，一边是城外石达开部一万人。他便选了一个折中的方案，以“反顾偏心罪”下诏通缉石达开。
洪秀全心想，假如石达开真的被谁取了首级来领赏，自己就可把杀石达开的责任和杀杨秀清的责任一样推给韦昌辉，说自己是在韦昌辉的胁迫下下旨杀石达开的。那么石达开的“英灵”将为他顺理成章地诛杀韦昌辉作最后一次贡献。到时候，只要表现自己不忘功臣功绩，把自己的某个儿子过继给石达开，再弄个“翼升节”什么的。于是乎，大家都会说天王英明，翼王可惜，最后的赢家还是自己。
石达开出城后，手握一万兵马，愤怒地要求洪秀全诛杀韦昌辉以谢国人，可洪秀全拒绝了他的要求。与此同时，以“反顾偏心罪”悬赏捉拿石达开的天王诏旨却传遍天国各地。
洪秀全对付石达开与诛灭杨秀清的手段如出一辙——他想利用自己的圣旨加上韦昌辉的势力，一举除去石达开的威胁。
然而，石达开在天国军民中的极高威望，是洪秀全没料到的：石达开军功高：1851年金田起义时，石达开率众四千余人赴金田团营，战斗中屡立战功，被封为太平军左军主将、永安封王时受封为翼王五千岁。在太平天国首义诸王中，石达开年纪最轻，也最具军事才能，太平军从广西向金陵进军，途经湖南、湖北、江西、安徽、江苏等省，石达开均为开路先锋，攻城夺镇，所向无敌。尤其是1852年西王萧朝贵在湖南长沙阵亡后，太平军在长沙城下陷入清军反包围，形势万分危急，石达开率部西渡湘江，开辟河西基地，缓解了太平军的缺粮之危，又多次击败进犯之敌，取得“水陆洲大捷”，重挫清军士气，其后，为全军先导，经河西安全撤军，跳出反包围圈，夺岳阳，占武汉，自武昌东下金陵，二十八天挺进一千二百里，战无不胜，攻无不克，令清军闻风丧胆，号之曰“石敢当”。
1854年夏秋，太平军在西征战场遭遇湘军的凶狠反扑，节节败退，失地千里。石达开看出两军之差距在于水师，便命人仿照湘军的船式来造舰，加紧操练水师。在湘军兵锋直逼九江的危急时刻，石达开再度出任西征军主帅，亲赴前敌指挥，在湖口、九江大败湘军，湘军水师溃不成军，气得湘军主帅曾国藩要投水自尽。石达开被调回天京参加解围战，又大破江南大营，解除了清军对天京三年的包围。
并且定都之后，诸王广选美女，为修王府而毁民宅，据国库财富为己有，唯石达开洁身自好，从不参与，品质非常之难能可贵。
另外，石达开展现出了超人的政治才能。1853年秋，石达开奉命出镇安庆。过去，太平天国没有基层政府，地方行政一片空白，石达开到安徽后，很快组织各地人民登记户口，选举基层官吏，又开科举试，招揽人才，建立起省、郡、县三级地方行政体系，使太平天国真正具备了国家的规模；与此同时，整肃军纪，恢复治安，赈济贫困，慰问疾苦，使士农工商各安其业，并制定税法，征收税赋，为太平天国的政治、军事活动提供所需物资。
当天王洪秀全下令捉拿石达开时，他给自己留了一条后路，暗中派人四处散布消息，说这圣旨是韦昌辉逼迫天王下的。
于是，天国举国军民拿着捉拿悬赏石达开的圣旨当草纸，以为天王也是受了北王的蒙蔽。太平军各地的高级军队将领，比如陈玉成，李秀成也纷纷表态支持翼王石达开。
就在这时，清军进攻宁国，陈玉成部十分危急，石达开以大局为重，先去退清兵，他的威望在天国达到最高点。
而也就在石达开率部赶赴宁国援助陈玉成部的前后，石达开再次向天王洪秀全发出通牒，再次公开要求天王杀韦昌辉这个刽子手，以顺民心，并称如若不然，将提靖难之师打回天京以清君侧。