崇祯八年，战争的阴云终于逼近了西藏，黄教与红教、苯教、白教之争似乎已经到了决出胜负之时。
顿月多吉此时在康区的世俗权力到达了顶峰，原本对辖区内各教佛教徒宽容的政策开始有了转变，因为佛教徒教义不同的而相争，顿月多吉严厉斥责了佛教僧人，尤其是噶玛丹培的信徒。但这些斥责未导致顿月多吉与佛教的公开决裂。
顾实汗见明廷展现强势实力，但似乎并没有介入青海、西藏之争，最多军队出边境剿匪，与青海、西藏各土司、土王们也没有太多解除，最多就是边贸官员之间才有些来往，想来明廷见这里地区宗教斗争太复杂，想隔岸观火，或者等鹤蚌相争，渔翁得利，因此他悄悄的派出了使者前往西宁来见左良玉，想先试探一下明廷的态度。
来使以通商的名义来见西宁地区最高军事长官的，和硕特部愿意跟大明进行贸易来往，左良玉自然表示欢迎，但是他是军事长官，贸易经济上的事情不归他关，自有朝廷工商部下设有茶马司来管，因此不痛不痒的几句话就把来使给打发了。
虽然应付的将来使对付过去，但是左良玉这三年来可是一直对青海、西藏以及漠西蒙古各部的动向是异常的关注，虽说不能是了如指掌，但基本上各部的动向还是非常清楚的，并且军情司也在这些地区以行脚商人为脉络，建立了一个辐射大西北的情报网络，黄教班禅罗桑却告坚赞，前藏哲蚌寺、色拉寺主持派遣心腹喇嘛僧侣与顾实汗之间的密切来往，更是在军情司的严密监控之下，黄教虽然有些实力，在普通百姓中也确实有些号召力，但是西藏掌权的却是信仰红教的藏巴汗，仇视黄教，占据拉萨世俗政权，令黄教在前藏的生存环境越来越艰难，这就迫使的他们不得不向外寻找外援，漠西蒙古部和硕特部顾实汗是黄教的忠实信徒，而且有勇有谋，实力雄厚，好不容易说服顾实汗出兵帮助黄教重新夺回西藏的控制政权，而黄教的这一系列秘密谋划自然令藏巴汗警觉起来，对黄教的压迫力度顿时加强了起来，不但看是限制黄教僧侣的自由，而且班禅自己和达赖五世都被秘密的监控起来，又派人去联合土谢图汗，请他出兵拉萨，帮助他一举灭掉黄教。
而这个时候顾实汗也同意当这个黄教护教法王，为了解实际情况，一方面他先命商使刺探明廷的态度，一面乔装改扮成朝佛的香客，从新疆途经青海进藏作实地调查，侦知敌情。
土谢图图汗之子阿尔斯兰此时也率领的一万蒙古骑兵向西藏进发，准备去援助藏巴汗，消灭黄教格鲁派。
两支队伍骤然相遇，顾实汗虽然身边就只有一百多名护卫，两方又都是没有挑明的对手，顾实汗以朝圣香客的身份觐见了阿尔斯兰。
阿尔斯兰也不是笨蛋，一个香客身边跟着一百多位彪悍的护卫，这是寻常人能拥有的吗？顾实汗没有立即表明身份，但阿尔斯兰却不敢怠慢，言谈之下，甚是欢心，遂邀请顾实汗一道同路去拉萨。
土谢图汗虽然是丧家之犬，但实力大半犹存，因此率军驰援察哈尔蒙古部的缘故，与明廷有了点关系，进入青海后，明廷也暗地里给予不少照顾，让其得以在青海迅速的站稳脚跟，毕竟这一路势力还是有收服的可能，后金也是大明的敌人，敌人的敌人就是朋友嘛！
一路上，顾实汗说服阿尔斯兰不要敌视黄教，阿尔斯兰毕竟年轻，经受不住顾实汗花言巧语的蛊惑，不知道随意更改信仰的后果，立刻改变了态度。他还率领的蒙古骑兵聆听了五世达赖喇嘛阿旺罗桑嘉措的讲经说法。
阿尔斯兰的行为被噶玛噶举派告到土谢图汗处，土谢图汗恼怒不已，遂命部将暗杀了阿尔斯兰。
左良玉将西藏、青海发生的着一系列值得关注的事情都一一写成详细的奏折，上奏给了朝廷。
左良玉的奏折引起了军机阁的重视，朱影龙对西藏的重视军机阁的几位大臣都是知道了，朝廷迟早有一天会介入西藏的斗争的，只是这个时间随着左良玉的奏折可能提前了。
不过孙承宗等人还有一个担忧，那就是大明潜在的大敌后金实力这两年增长太快，并且还拥有了攻城利器——火炮，虽然威力不能跟大明的比，但已经有了一丝威胁，而且军力号称八十万。
早在努尔哈赤时期，在满洲八旗中就有16个汉人牛录。皇太极即位后，天聪三年即崇祯二年正月，将汉人牛录拨出2000多人，正式成为一个汉军旗，命汉官佟养性统辖。天聪五年即崇祯四年五月，皇太极正式将“旧汉兵”定名为汉军，以黑旗为标志。因当时铸造火炮者基本是汉人，而使用这些火器、大炮者也基本是汉人，得了毛文龙从冻僵岛上裹挟的几十万军民后，皇太极正是将汉军扩充为八旗，得步军十余万，加上蒙古军、朝鲜军，皇太极这两年大肆扩军，共足见四族三十二旗，得军队约六十万余，对外号称八十万，其中后金、蒙古各约二十万铁骑，汉军十二万，还包括毛文龙手下三万精锐，水师约三千，朝鲜军八万。
有这样一个强邻在，而且已经迫不及待的张开獠牙，疯狂的吞噬着周围的弱小势力，壮大着自己的力量，眼见对手一天天强大，朝廷虽然采取了一些列措施抑制后金的步伐，但鞭长莫及，而且朝廷把精力放在了国内，军费虽然每年都在增长，但防御有余，进攻却不足，朝廷如果这个时候介入西藏的战争，能够迅速平定战局还好，如果不能迅速解决战端，而陷入泥潭的话，如果是一拖几年的话，恐怕东北这一只恶狼就会再一步强大起来，一旦战事开启，恐怕难以兼顾。
“告诉左良玉，让他维持西藏现状五年。”朱影龙看了左良玉的奏折，什么也没有说，直接给了军机阁这么一个交代。
左良玉接到军机阁的命令，唯有苦笑，这仗都快要打起来了，还要维持现状五年，怎么维持？
装扮成香客的顾实汗一行平安抵拉萨。达赖赠给顾实汗“丹增却杰”（意为持教法王）称号。顾实汗与五世达赖、四世班禅秘密商议，决定由顾实汗率大军从新疆前来青海，称消灭白利土司顿月多吉，继而进军西藏消灭第悉藏巴。
阿尔斯兰被杀后，他手下的一万蒙古铁骑部分跟随顾实汗和硕特部，他们大多是阿尔斯兰的心腹，就算回去之后，也会被清洗，自然不会傻到回去等这被砍头，还有一部分是土谢图汗的部将，这一部分是土谢图汗的人自留在拉萨，被藏巴汗待为上宾。
由于左良玉的有些介入，甚至隐晦的告诫土谢图汗不要介入西藏宗教之争，土谢图汗似乎有些悔悟，与顿月多吉和第悉藏巴有了些疏远，只不过那支被派往拉萨的军队也没有召回，只是保持克制了许多。
加上土谢图汗亲自去西宁拜见了左良玉，得到左良玉的亲自接见，这就使得顾实汗有些顾虑，原本打算连土谢图汗一起灭掉的，形势逆转之下，顾实汗不敢轻易出兵，害怕明廷会和土谢图联合起来，到时候就非他所能敌。
而左良玉再上书朝廷，让额璘臣以迈达哩活佛的名义邀请四世班禅和五世达赖访问青城，额璘臣的背后是大明朝廷，班禅和达赖访问青城显然如果没有大明朝廷的允许是不可能成行的，这一次访问意义重大，黄教为此得了一点喘息之机，藏巴汗也不敢在黄教两位教宗大人出访之机在背后搞什么小动作，若是惹起大明来，对顿月多吉和藏巴汗来说都没有好处，因此西藏地区战争的阴云很快就消散不少，左良玉成功的稳定了西藏地区目前的格局，双方暂时相安无事。
宗教之间的战争是最狂热，最疯狂，最没有理性的战争，但是矛盾的是，人活着如果没有一份信仰，没有一份追求，那就跟行尸走肉一般，所以西藏问题根本就是一场长期的战争，短期的征服只是对肉体的一种消灭，对精神和文化的征服却是一场持久战，后金则不同，没有狂热的宗教信仰，只是一个十分野蛮的民族，虽然自谤也有千年的传承，对于一个野蛮的民族，肉体的征服是最直接的，西藏比后金更落后，更野蛮，但是条件跟落后，百姓更愚昧，因此需要更长的时间才梳理，而且更复杂，因此对于西藏，朱影龙决定还是将其放在解决后金皇太极之后来解决。