刘钧已经移到改名伏波号的西班牙盖伦大帆船新旗舰上，许多投降后的西班牙人选择为刘钧工作，以换取生命和财产安全保障。⊙，
伏波号原来的船员水手们也基本回来了，这艘大战舰原有军官三十名，八十名水手、八十名名见习水手，五十名杂役以及一百多名炮手。这艘船的甲板上，还配备了一个连三百人的士兵，这并没有算上指挥舰队的司令官，以及随舰队的官员们，以及那些搭乘船上的商人、平民以及运送的士兵。
这艘拥有火炮八十四门火炮。
战舰上除了指挥官、税务官以及随军牧师和外科医生，以及少数的专业人员外，伏波号上原来的西班牙水手大致分为四类，全职海员，见习海员，少年海员，炮手。
那些没有军衔的岗位，统被称为技工，包括木工、潜水员、修理师、塞缝工和号手等。在这些船员里面，炮手们通常都自认为高水手们一等，他们严格的按照规章维护火炮，并在战斗中操纵它们，同时还负责一名非专业的水手。
那些见习水手都是从十几岁开始就上船在海上学习技术，等到他们成为全职水手时经验已经丰富无比。不过在成为全职水手前，这些船上官员亲戚朋友，或者来自于流浪儿的见习水手们，在见习期间，得包下所有仆役的工作，擦桌子洗甲板，协助水手，由那些全职水手们安排，还要负责值夜班，保证船只在夜间也能航行。
船上的士兵，则有着自己的组织，舰队中所有的士兵都归总司令指挥。船上的步兵有着和西班牙陆军一样的组织结构。由一个负责士兵训练和食宿的陆军指挥官来协助舰长完成指挥工作，由士官来负责管理士兵们的一些日常活动。
和陆军“排”的编制相似，每25名士兵被分为一个中队，由一名士官担任中队长。和海员一样，士兵也被按照其经验划分等级，经验丰富的老兵拿着最丰厚的薪水。这包括一名旗手、两名鼓手和一名风笛手，火绳枪兵的待遇会比其他士兵更好一些。
盖伦船上的士兵，一半装备长矛一半装备火枪。
盖伦船上的八十四门大炮，都放在极为实用的四轮炮架上，它使用的是滑轮，这种炮架式样十分的有效。
这艘战舰上大量的火炮，每门大炮由一名炮手负责，交战的时候，还有一名水手和一名见习水手协助。船上的士兵连队则并不负责火炮。他们主要负责接舷作战。
在战斗的时候，步兵站到属于自己的位置上执行命令。在中队长的带领下，一个最有经验的中队被安排到前船楼，其他几个中队则聚焦在船中部、后甲板和船尾。如果有足够的人手，他们还会安排一支预备队呆在甲板下面，用于接舷作战。
每次接舷点，都将依靠战士中的火枪中率先打响，火枪兵分作两队。一队士兵在船舷处射击，另一队退到后面集中上膛。
装备了近战武器的士兵集中在甲板的另一侧。只等下令行动，一旦攻击的命令下达后，准备进攻的士兵将集中在前船楼，按照平时的训练进行近身战。
刘钧在仔细的看过伏波号上的人员搭配，以及他们传统的作战方式之后，大为感叹。不愧是曾经的海洋霸主。哪怕如今渐渐没落了，可西班牙人的战舰还是无比强大，他们的战舰上水手和陆战队的配合也是极成熟的。
刘钧甚至能看的出来，这些人比郑家的船员更厉害。
“好好对待这些西班牙船员战士，把他们的本领都给学过来。”刘钧特别交待自己的手下。不要把这些人当成俘虏，而是要把他们当成老师。
俘虏中最后有近一半都成了刘钧的雇佣兵，剩下的一半有些是如波提罗一样的官员，还有一些则是些妇女孩童或者是些仆役。
“侯爷，这些人你打算怎么处置？”熊文灿问。这次刘钧夺取取鸡笼港，缴获了大量的钱粮货物，刘钧得了战舰船只和火炮武器后，也没真把郑芝龙熊文灿他们忘记，最后还是把所有的货物交给了郑芝龙，然后郑芝龙折合成银，一分为四，郑家、刘钧和熊文灿各一份，还留了一大份给皇帝。
熊文灿拿的这份虽不如刘钧郑芝龙他们多，但也价值好几万两之多。
刘钧则收入是最丰盛的，他的那一份有二十多万两，另外还有许多金银都被他一人独享了。
对于波提罗等一众人，刘钧想了想道，“波提罗等官员随军带走，其余的妇孺等暂时先留在这里。我们也得在这里留下些兵马，继续控制这里的城堡和港口。就交由郑提督派人接管吧，以后可以充做大明与日本之间的贸易转口港。”
大明和日本那是敌对关系，就算朝廷愿意放开海禁，肯定也不会与日本放开贸易的，这样一来日本与中国之间的贸易就得有一个第三方中转，台湾正是一个很适合的中转港。郑家占据此地，两边收货，转卖给两国，坐收其利。
郑芝龙听到这个安排，呵呵的笑着答应。
“多谢侯爷。”然后背着熊文灿就对着刘钧伸了一个巴掌，刘钧摇了摇头，郑芝龙比了一个六，刘钧向他伸了两个指头。
“以后这里就交给郑提督，甚至等我们打下大员的时候，那里也要由提督来负责。本侯督察完东南军务后还是得回去的，并不能过多参与此间之事。”
郑芝龙忙道，“不劳侯爷操心此处，由我负责就好了，以后对日贸易，侯爷每年拿三成，你不要再推辞了。”
这个时候，刘钧已经打算离开继续扬帆南下了。台湾的西班牙人实力极弱，这次刘钧的主要对手还是荷兰人。
不过在走之前，有些事情还是得要安排一下的。
由于新任的台湾巡抚是先走陆路往福建去的，因此刘钧这个钦差就下令，派人往台湾北部各地的土著村社传达如今的最新局势。宣告大明朝廷收复了台湾，以后在此设官驻军，让各村社的首领前来议事。
为了表达善意，刘钧让去传令的士兵，给每个村社都带去了不少见面礼，还有对各村社长老们的任命书。
刘钧任命这些长老们为官。十户为甲设甲长，百户为保，设保长。每村设一村长，五村设一社长，还让这些土著们编设乡兵队和民防团。所有的这些土官，都会有薪俸，另外每村社有一定量的乡兵民团，这些土著兵编入名册之后，也会有一定薪水。
收到刘钧的礼物后。那些土著村社的蕃人也同时知道了大明官军庞大舰队的到来，以及西班牙人被城堡被夺取，人马被俘虏等震惊消息。听说大明数万大军登陆，取代了西班牙人，如今大明的侯爷要邀请各村社长老们前往议事，给他们授官送礼，各村社基本上都来了人。
数天后，以金民里社、大鸡笼社、三貂社三大社为主的巴赛族一百余个社。以及还保留着母系氏族的打马烟社、抵美简社、奇立丹社等七十余个社的噶玛兰族的两个大族群共近两百个村社的上千土著蕃人到来。
刘钧让人热情招待这些人，不断派人向他们宣传大明。以及大明将要在这里建立基隆府，派官驻军等等。
每个到来的蕃人，都会被官兵热情迎接，引他们过去登记，把他们的村社驻地、人口数量等情况登记起来，然后给每个人先发上一个包括布匹、盐巴、书本、银子在内的大礼包。再给他们引入早搭建好的帐篷区，为他们安排住所。
同时，在等待更多蕃人前来的同时，刘钧也划了一大块地区设立为交易区，让那些前来的各部落村社土人可以交易。出售他们带来的土产皮货，购买交换其它货物。
刘钧还特别派出许多士兵站岗值哨，设立仲裁处，维持治安，解决纠纷。
其实许多蕃人前来，固然是因为得了礼物，但也未偿不是因为准备借机前来做交易的。特别是噶玛兰族，在西班牙占据北台湾时，他们与之交战多次。得知西班牙的城堡被夺取，她们便应邀而来。
多日之后，大会终于召开。
刘钧也没多说什么太多废话，而是拿出很多实际的行动来，以把这些蕃入纳入朝廷的控制之中。
刘钧册封各部族村社的头领，把本来就属于他们自己的治理权，再经由朝廷之手正式授予他们，让他们代朝廷治理，刘钧向他们颁授官印，发给官袍，还赐予代表着首领的藤杖与长剑。
刘钧还让跟各部族村社的首领长老们商定，朝廷以后向各村社派出老师和医生，设立学校和医馆，帮助他们的孩子读书以及替他们治病。另外还将在各村设立一个商铺，负责收购各村社的各种货物土产，同时也直接把盐巴布匹药物等一些商品从港口运到各村社商铺中，方便他们交易。
这种确实可见的方便也好处，都打消了那些首领长老们的警惕。而刘钧肯这样送温暖，也自然是为了深入各族群村社，掌握他们清爽的虚实底细。刘钧还让各村社设立保甲，建立乡兵民团，让他们每年在空闲时期到鸡笼港集训。
另外刘钧还拿出钱粮来，让各部族村社出人力，准备修建鸡笼港和淡水城到各部落之间的道路。
当然，这次大会最重要的一件事情，还是编户。把各部族村社界线议定后划界各族签字画押，然后把各村社的人口登记在册，授任土官，编立乡兵。
如此一来，这些土著蕃民，就算是大明正式的编户齐民，真正的大明百姓，而不是化外野民。
“有必要如此麻烦吗？”熊文灿道，“一群蕃民野人而已。”
刘钧摇头道，“如果我们只是想和西班牙人一样在这里建个临时的商港，那么自然怎么办都无所谓。可我们是要把台湾纳入大明帝国的实际统治，那么自然要与这些蕃民处好，尤其是以后我们还要往这里移民屯田，就更需要与他们提前弄好关系了。”
“更何况，咱们这样做也是有好处的，台湾可不是一个荒岛，而是一个宝岛。出产黄金、硫磺、鹿皮等等，台湾的蕃人还是有很多的，仅这次受邀而来的村社就多达两百多个，足有不下十万人口。而人口，本身就是一大笔财富。”
刘钧这次把鸡笼港为中心的台湾北部设立了基隆府，下设淡水、基隆、宜兰三个县，三县下共编有十五个乡，乡下有社、社下有村，层层划分。
大会过后，刘钧留下一个营驻守改名为基隆和淡水的两座原西班牙城，并让他们继续加固港口炮台工事，而郑芝龙也留了五百人驻守，他们将在此等候朝廷派驻文官充任地方官员。
补充好淡水和食物火药等后，刘钧留下了一千余西班牙人交给留守兵马看管，然后正式扬帆离港。
舰队继续南下，向着澎湖前进。
而此时的台南，也就是荷兰人的据点大员岛上热摭兰城。
荷兰台湾长官德包尔已经知道了大明派舰队进攻台湾北，并已经夺下了西班牙人的堡垒据点，西班牙人已经不战而降。
据说进攻北台湾的大明舰队，多达三百余艘，他们自北南下，实力强劲。
当得知曾经两败打败他们的郑芝龙也率战舰在那支舰队里，而且那支舰队还是由一位大明的皇帝义子统领时，德包尔极为震动。
“马上如今大员会议！”
在荷兰人占据台南后，便以大员为其中心，最高长官为大员长官，掌握台湾的最高行政。大员的荷兰人定期召开大员会议，成员由东印度公司的高级职员，高级军官担任，并由台湾长官担任会议主席。
临时召开的大员会议上，德包尔把最新军情通报给众人。
“大家议一下，该如何应对？”
“这有什么好商议的，打就是了。若是明人以为我们跟西班牙一样软弱，那我们就让他们尝尝我们的厉害。”
荷兰东印度公司派驻大员负责军事的保罗.杜拉弟纽司拍着桌子叫嚣道，“尼古拉一官原来不过是我们的一个翻译，侥幸用诡计赢了我们一两次，还真就以为他比我们强了。海上侥幸赢一两次还罢了，居然还想要来攻打大员，难道他以为我们大员的堡垒要塞是摆着看的？”
“还有我们的舰队呢，正好上次与郑一官交战失利后，巴达维亚又调了一支分舰队过来，另外附近还有十艘我们和英国人封锁南中国海的联合舰队，把他们调过来，我们就有十艘盖伦战舰，另外武装商船也有十艘，加上轻快船有五十多艘。尼古拉一官敢来，正是找死！”
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