尽管奢祟明之乱是九个月后的事，米柱在初掌东厂之时就己进行了布署，往永宁和水西派遣了密探，从密探反馈回来的信息。
形势依旧不容乐观，原版的奢安之乱，是在大明丢失了沈阳辽阳，辽镇全境沦陷之时，斯时天下震动，民心士气跌到了冰点，朝廷焦手烂额，拆东墙补西墙，顾头不顾腚，这才给野心家有了可乘之机。
而现在，米柱可以骄傲的说道，因为本官执掌厂卫，形势一片大好，狼子野心的建奴被打断了爪子，退回去舐弄伤口了，而这些西南的野心家们，还有没有可能叛乱？
虽然密探反馈的消息不容乐观，鱼肉百姓，拥兵自重，独霸一方，但那一个土司不是这样的土皇帝？
现对于明朝的灭亡，很多人都认为是大明朝军队无法对抗建奴和流寇，导致最后败亡，其实以大明朝当时的国力，这两方还是可以应对的，当时明朝不只有这两方敌对势力，还有第三条战线，这条战线牵制和分散了大明朝军队的主力军，这一方是持续了长达二十多年的西南土司叛乱。
这条战线对大明朝最后的灭亡命运和之后西南各族的影响可谓巨大且深远。明朝对于云南、贵州和四川三省的少数民族一直是采取以夷制夷的策略，即世袭土官的制度，让当地少数民族首领担任当地长官，负责管辖当地。
朝廷不做干涉该地的长官选拔，只负责税收和边防等事宜。当时西南地区有不少的行政单位，很多地方还有武装力量，这种特别的地方自治模式也就是土司制度。土司官员们在这三个省经营了很长时间，他们的势力可谓根深蒂固，人称流水的朝廷，铁打的土司。
所以有些土司就觉得天高皇帝远，在当地横征暴敛，作威作福，还对抗朝廷，大明朝时西南地区经常发生或大或小的叛乱，其中最有名的是万历年间爆发的杨应龙叛乱，明朝军队花费了一万兵力，和他们激战一年才平定此次叛乱，之后朝廷在当地推行改土归流的政策，因为受到的阻力不小，进展很慢。
西南地区依然半土半流，万历后期明朝廷腐败现象频发，建奴势力崛起，朝廷为了筹集军饷选择大增赋税，土司官员趁机横征暴敛，百姓民不聊生，苦不堪言。
四川永宁慰使奢崇明趁机起兵反明，朝廷好不容易派兵平定了奢崇明叛乱，贵州宣慰同知安邦彦又发动了叛乱，安邦彦家族可谓是西南地区自古就有的家族势力了，安邦彦叛军很快占领了贵州的大部分地区，还打败过贵州总兵带领的主力军，围攻贵阳，威胁湖广等地。明朝扫平奢氏后集中了七个省的兵马围剿安邦彦。因为贵州地形复杂，几年里，双方都拉锯作战，不分输赢。
直到崇祯元年，曾经平定奢崇明叛乱的朱燮元担任兵部尚书后，朱燮元带领西南军务采取步步蚕食的策略才最终在崇祯二年八月，斩杀了安邦彦和依附于安邦彦的奢崇明，在第二年春天，明朝军队彻底扫平了叛军的余力。
但是这场战争历经了十几年，明军用了十多万兵马，耗费了几百万两白银才平定了此次叛乱，可谓元气大伤。这个时候，李自成等农民起义军也崛起。之后明朝经历了沙普之乱这最后一击，明朝灭亡。
所以，这也是心腹之患呀！这西南的土司势力，比之建奴一样难以对付，像建奴才崛起几十年，而水西安氏，己在一千四百五十年了，比大明长久近五倍，他们割据一方，拥兵自重，朝廷是一点办法也没有。
而且他们不反，就是大明朝的臣子，一旦反了，就造成深重的灾难，不可收拾，元气大伤。
米柱怎么做？迫他们反不成？这是不可能的，而且米柱也希望这为祸一方十几年的灾难化解于无形，在不断的派出密探，去调查消息之后，米柱决定，自行化解这危机，而不是任其癌症化。
也不是所有的土司都是奸的，都是对抗朝廷的，像石柱土司的秦良玉、秦邦屏，秦民屏兄妹等就是忠于大明的，他们的白杆兵一部更是编入了天子亲军，这是无上的荣耀。
而且按约定，秦良玉及其子马千乘会率六千白杆兵出川，驰援辽东，原版正是白杆兵出川，战局又崩坏，这才给了奢崇明等可乘之机，攻下了重庆，围攻成都。半个四川，陷入战乱之中。
永宁奢家，水西安家，是剿是灭，这是朝廷大事，必须朝中诸公和地方商量决定，米柱现在就是告诉内阁，这永宁奢家、水西安家有不臣之心，谋反之志，内阁一定会说，澳州伯请慎言慎行，大明己经不起折腾，切勿做出官迫民反之事。
在土司和厂卫之间，内阁更愿意相信，臣服朝廷几百年的土司家族。
明知如此，米柱还是往兵部、内阁发了备忘录，指出了奢安二家不臣之心，且有造反的可能。
这就令内阁头疼了，你东厂两嘴一张，就说西南有大事，这是要人命吗？永宁土司属于四川，水西属于贵州，干系极大，发一牵动全身，难道出兵剿平？
且水西安氏，乃贵州四大土司之一，与水东的宋氏，思州的田氏和播州的杨氏合称四大土司，思州土司以田氏为主，统治时间长达831年，田氏土司是黔中最著名的土司之一，千年的世袭，它与播州杨氏并称为思播田杨，所以播州是杨氏的天下。播州土司从唐朝世袭至明朝万历年间，经历了二十九代，725年之久，最后一代土司杨应龙因叛逆造反被杀，所以播州杨氏土司也停止世袭。
四大土司灭其一，播州改为遵义，但这播州之战乃是万历三十年，损耗钱粮无数才拿下的，难道现在又来一场播州之战什么的？
土司乃国中之国，省内藩镇，历代皇帝和巡抚，无不有改土归流之心，但终因抯力极大而终止，但是朝廷一有机会，觑上了空子，就会扑上去，改土归流，平定地方之乱肇。
特别严重的是，贵州一带唐、宋、元诸朝均以土司羁縻，未置郡县（土府、土县亦是土司管辖），太祖洪武五年，贵州安、宋、田、杨四大土司内附，朝廷仍元旧例，封宣慰使，令其自领其土，自管其民。
虽然大明初中央权力尚不足以直接控制贵州，但朝廷从未放弃改土归流的努力，太祖洪武初，蒙元残余势力盘踞云南，仍欲负隅顽抗。而要征云南，最便捷、安全的一条路需经过贵州，这使得朱元璋动意经略贵州。他先是开辟自中原通往黔、滇的驿道，以加强对这一地区的控制。
洪武十五年，更是将凯旋的伐滇军队三十万余人，分散安置在贵州一带驻守，这些军队成为贵州卫所的基础。与此同时，朝廷又将军人家属自中原迁入贵州，划归卫所管理，与本地原有的土官管理体系分开。虽然没有直接改土归流，但是相当于将一颗钉子楔入贵州，通过移民动摇了土官的统治基础。
同时，依靠这些卫所，朱元璋在贵州建立了都指挥使司，这是贵州三司建立的开端。
成祖永乐年间，思州、思南两宣慰司发生冲突，这两个宣慰司的首领都是黔南田氏家族的族人，不过分属于两支（两家在宋元之际就已经分家），他们因为丹砂矿的归属权大打出手，给了永乐皇帝出面干涉的借口。
最终，思州、思南两个宣慰司均被革除，宣慰使被收执，明廷采纳了夏元吉的意见，于永乐十一年，将原来的两个宣慰司共计三十三个长官司的辖地划分为八个府，并据此设立贵州承宣布政使司，这是贵州建省的重要一步，永乐十五年，为健全三司体制，建立贵州按察提刑使司，至此贵州省制完备。
但值得一提的是，贵州虽然仿照其他省份建立了三司体制，但是实际的权力很多还掌握在大大小小数百个土司手中，安、宋、田、杨四大土司仍具有影响力，比如播州杨氏在，曾在明中后期掀起叛乱，而大大小小的苗乱则与明廷相始终。除此之外，贵州的流官一般只设到府一级，县级设置很少，大部分府下设置长官司，实际权力还是掌握在土司手中。总而言之，明代贵州的改土归流虽然一直在推进，但是缓慢而艰难，并且存在一些改流复土的议论。
这是大明内部最复杂，最令人烦恼头痛之事，米柱却不合时宜的提出，令内阁相当头痛。
这永宁奢家、水西安家，拥兵上万，辖地数府，有造反的本钱和能力，但他们己臣服几百年了呀！俨如国中之王，土皇帝，何必造反？况且东厂的证据也不足，于是他们将备忘录转回四川布政使司、贵州布政使司，让他们多加注意，同时回复东厂，让他们找更多的证据。