小五郎推理，那天雅美用吃午饭当借口离开银行，绕到门后，也加入了抢劫之中。小兰问，“为什么银行职员要抢钱？”小五郎也感到很奇怪，不明白为什么。以雅美和千钧的关系，真要需要钱，大可去找千钧借。在案件发生后，雅美就主动辞去了银行的工作，而且是早上递出的辞呈。让警方更怀疑的是，雅美到这家银行上班也不过才半年的时间，柯南道，“如此说来，她是为了犯案先去打探状况的，这么想比较自然吧。”小五郎点头，“就是这么回事。”
柯南认为毛利和目暮的推理大致没有问题，但其中还有几个疑点。而千钧在这天也不知道跑到哪里去了，很可能是去找雅美求证了。柯南思索，一个缜密的歹徒会把自己的口红丢到案发现场吗？花了半年的时间打探银行的状况会败在这一举动上吗？而且面罩上沾到口红的位置不对，似乎太低了。那里不是嘴巴，反而像是下巴的位置。
如果雅美戴过那个面罩，上面应该有雅美的化妆品味道，可是上面根本没有。柯南觉得千钧应该也发现了这两个破绽，独自去找雅美求证了。换句话说，犯下这个案子的歹徒另有其人，想把所有的罪名都推到有前科的雅美身上。柯南觉得不妙，隐约觉得要出事，匆匆离开侦探事务所。小兰惊叫，“你要去哪里啊？”小五郎不屑，“不用管，这个小鬼又要去胡闹！”
柯南很快用毛利的声音打电话到警视厅，从目暮警官那里要来了广田雅美的住址。目暮说他们已经搜查过了，但还是告诉了地址。柯南很快来到雅美所住的公寓，503号房间。柯南听千钧提到过，雅美的钥匙放在门前不远处的花盆下面。柯南找了一下，顺利找到了那把钥匙。柯南进入后，发现雅美的房间非常整洁干净。柯南有些着急，他认为雅美可能已经危在旦夕了，偏偏千钧突然联系不上了。柯南从雅美家的插座后面找出了一把保管箱的钥匙，“这恐怕是雅美藏被抢现金的地方。”柯南发觉不对劲，后面突然出现一个靓丽的人影，将柯南打倒在地。
雅美低身捡起钥匙，转身向外走，柯南努力想爬起来，“不可以去，雅美小姐！”雅美转过头来，柯南这才发现雅美的真实容貌，是那样的美丽漂亮、气质俱佳，难怪千钧那么喜欢她。柯南忍着痛，“去了的话，会被杀的。你如果出事，千钧一定会非常难过的。”雅美露出凄然的表情，“我知道，对不起了，柯南。见到千钧，替我说声对不起，我辜负了他的一番情意，如果真的有来生，我愿意用一切来报答他。”说完话，雅美走了出去，柯南想要阻止，却是动不了了。等柯南恢复过来，追出门口，已经失去了雅美的踪迹。
柯南趴在5楼的楼梯栏杆上，看见雅美上了一辆红色的汽车。柯南急忙用弹弓将信号器射了出去，粘在车后，柯南大喜，打开追踪眼镜利用滑板进行追逐。柯南觉得雅美好像又被什么人给利用了，“不过，后面的黑幕到底是谁？”黄昏时分，雅美将车开到一间仓库附近，周围好像也没什么人。雅美下车，掏出一把手枪，毅然走进了前面的仓库，“你们在哪里，快点给我出来！”
琴酒的声音从门口传来，“辛苦了，广田雅美！不，宫野明美！”他的身边站着的赫然是狞笑的伏特加。明美咬牙，“我可以问一个问题吗？你们为什么要杀他们？”二人一起大笑，琴酒哼了一声，“这就是我们一贯的作风。好了，你可以把钱交过来了。”雅美道，“钱不在这里，我把它放到另外的地方了。”伏特加大怒，明美提出要求，“在这之前，我的妹妹，先把我的妹妹带过来。我们是事先约好的，这工作结束后，你说过让我们姐妹脱离组织的。”
琴酒冷笑，“你真是个白痴女人，这是根本不可能的。怪不得找个男朋友，都是fbi的人，那些虚情假意竟然把你迷倒了。”明美也隐约知道这件事情，眼里都悲伤，“他至少不是个坏人。”伏特加大笑，“那个家伙本来就是有女人的，为了接近组织才刻意跟你交往的。”琴酒打断伏特加，“不要跟她说这些废话了。你妹妹在组织里算是头脑顶尖的人，她跟你完全不一样，组织非常需要她这样的人。”
明美这才知道，她又被骗了，“那你们一开始就……”二人一起大笑，琴酒掏出手枪，“快点，这是最后的机会。快说钱在哪里？”明美也举起手枪，“你太天真了。杀了我，你永远别想知道钱在哪里。”琴酒冷笑，“我看天真的是你吧！我早就猜到你把钱放入了托管保险箱。而且，我也说过，这是你最后的机会。”“砰”枪响了，明美倒在血泊中。伏特加低身从明美身上取出钥匙，可是外面也传来惨叫声和枪声。琴酒和伏特加都是一愣，“怎么回事？”二人来到外面，一个黑衣手下跑过来，“不好了，龙魂使者突然杀过来了，大家抵挡不住了。”
伏特加大怒，“你们不是警戒了很远的距离吗？”手下惊骇，“最外面的人都突然无声无息地被做掉了。”琴酒立刻明白了，“他听到枪声，所以改偷袭潜入为强攻了！”伏特加火大，“对方只有一个人，难道你们都是纸糊的吗？”话音刚落，就传来清脆的枪声和嘎然而止惨叫声，潜伏的2个狙击手一个头部开花，一个头颅飞到空中，血溅三尺。死神贴飞速而至，情人枪响，刚才报告的黑衣人无声无息倒在地上。琴酒和伏特加依靠本能，立即感觉到危险，一起开枪的同时，向两边闪避，“砰”地一声伏特加倒在血泊中。琴酒大骇，急忙随手扔出一个闪光弹和烟雾弹，扶起伏特加向后避去。
龙魂使者的视线受到了影响，追来的子弹打掉了琴酒的帽子，另一发子弹击中了琴酒的大腿，一向杀人如麻的琴酒第一次感觉到了死神的逼近。手持红色沥血剑的千钧刚刚越过烟雾，就感觉到危险，2个狙击手出现在附近，一男一女，黄色头发的女子是基安蒂（基安蒂是一种意大利基安蒂地区的世界驰名的红葡萄酒），蘑菇头，左眼下画着一只蝴蝶翅膀。戴帽子的男子是科恩，脸色阴沉。二人同时在远处开枪，千钧闪身躲过子弹，沥血剑弹飞另一颗子弹，并用特制的手枪开枪反击。基安蒂和科恩的狙击镜被瞬间击碎，二人大惊，如果不是他们的镜子是特制，刚才的子弹就会打入眼里丢掉性命。二人立即分别扶着琴酒和伏特加退入密道。
千钧心里充满怒火，这次他没有保留实力，快速追至，但是一些喽啰拼命阻挡，耽误了一点时间。琴酒咬牙，发动了遥控爆炸装置，这是用来在紧急时刻彻底摧毁秘密联络站的办法。整个仓库周围的建筑都发出惊天动地的爆炸，火焰熊熊燃烧。四人惊魂未定，沿密道逃了出来，刚出密道，伏特加大吼，“快炸掉密道！”轰地一声，整个密道也被摧毁，四人一起躺在地上喘气。基安蒂惊骇，“那人还是人吗？怎么可能做到？”科恩也后怕不已，“要不是有这条密道，我们早就被他杀死了。”伏特加哀叹，“我们那些身经百战的部下全都完了！”琴酒忍住腿上疼痛，“我们必须马上转移，龙魂使者如果没被炸死，肯定会追来。”
伏特加有些不信，“这么巨大的爆炸，怎么可能不死？”基安蒂和科恩也赞成伏特加的看法，琴酒摇头，“如果是普通人，自然是必死无疑。但对方是超级战士，被炸死的可能最多只有50%。再说，这么大动静，秘密调查局的人肯定会被惊动。”三人都明白了，“可恶的山本一夫，怎么总是阴魂不散地追着我们！”黑暗组织最近已经很久没有这样的大行动了，就是被秘密调查局打压的结果，没想到这次刚刚开始有所动作，就出了这么大的事情。组织恐怕又不得不潜伏很长一段时间了。
千钧根本不惧怕那些爆炸，他完全可以顺着密道以土系力量追上黑暗二人组，但他更担心雅美的安全。他的记忆碎片没有基安蒂和科恩的印象，因为他们在原著剧情里出场次数较少，千钧只是觉得这个两个狙击手比较厉害些罢了。在火中千钧闯入仓库，发现雅美已经被烧伤，身体也中枪了。千钧大惊失色，上前仔细查看，还好，还有一丝微弱的气息。千钧立即将生命原力打入雅美体内，然后飞速撤退。没有什么事情，比朋友的生命更重要，千钧暗道，“琴酒、伏特加，我就先留着你们这2条小命，下次绝对让你们下地狱！”不过，走的时候，千钧将雅美身上的衣服和东西都扔到了仓库里，他要让所有人都认为雅美已经葬身在这里。
柯南追到不远处时，突然发现发信器失去讯号了，紧接着就听到远处传来的爆炸声，熊熊的烈火在黄昏下格外耀眼。柯南整个惊呆了，这么大的手笔，难道是自己一直追寻的黑暗组织吗？秘密调查局的人马率先赶到，随后警方、消防队的各路人也陆续来到。连毛利父女也闻讯赶来，所有人都被爆炸和大火吓住了。等到烈火扑灭，拆弹组确认没有危险后，大家才进去开始调查取证。
很快，大家一致认为，广田雅美卷入了地下组织的暗战，被炸得粉身碎骨，连衣服都被烧得只有一点痕迹。经过最后见过她的柯南辨认，的确是雅美身上的衣服。警方又找到了一些雅美的其他物品，其中有她房间的钥匙。但是，雅美带走的那个托管钥匙却不见了。柯南还记得那个钥匙号，警方立即派人去那里埋伏，但始终没有等到人来取。后来，发现箱子里面是空的。
山本一夫这次没有亲自来，原来他有任务去广岛调查另外一个地下组织了。秘密调查局的临时负责人就跟目暮警官商量，调查火并组织的事情转交给调查局，警方负责追缴银行失窃的钱币。目暮警官犹豫一下，答应下来。这时，千钧开车从远处赶到现场，“目暮警官，我找到那些钱了，雅美小姐是清白的！”目暮警官等人询问，千钧声称自己在米花车站的保险箱里找到那笔钱，现在就放在自己车上。柯南也说出了嫁祸雅美的破绽，目暮和毛利等人这才明白过来，“看来，他们是想嫁祸给有前科的广田雅美，在这里杀她灭口。不过，好像随后，发生了火并……”
最后，警方以歹徒火并中杀死了无辜的雅美结案，被抢的现金也安全收回。整件案子看上去结束了，但柯南认为事情绝没有那么简单，秘密调查局涉及到的案子都是那种非常恐怖的惊天大案，弄不好就与黑暗组织有关。千钧坐在地上，放声大哭，小兰在旁边低声安慰，心里也充满了伤感。大家的心里也都不好受，千钧刚刚与雅美重逢，紧接着就是生离死别。后来，还是佐藤通知了由美，由美开车将失魂落魄的千钧送回了家里。
当天晚上，秘密调查局就开始代号为“追兔”的行动，琴酒的那些死去的手下还是留下了一些蛛丝马迹。这天晚上，整个东京很多地方都发生了激战，黑暗组织的部分秘密联络站和据点被彻底摧毁。琴酒反应很快，大部分人员顺利撤离了，也有部分情报人员被击毙和捕获，不过，那些人都知道的有限。对于这些损失琴酒虽然觉得有些可惜，但并不在乎，真正让他心疼的是，是被龙魂使者杀死的那些直系部下，他们可都是百战精英，那不是一朝一夕能再补充上来的。这些人的损失，也直接影响到琴酒在组织中的地位，组织的boss对琴酒这次的失败非常恼火，勒令他反省，这几个月都不准有任何行动。
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