随着烟雾的散去，卷轴上竟然堆满了各种奇形怪状的大蛇尸体，其中有长着四只脚的大蛇，有长着多个脑袋的大蛇，也有全身布满木质鳞片长着翅膀的大蛇，还有形状类似传说中神龙的巨蛇等等，总之这些大蛇的尸体就没有一个正常的。
“这...这是什么？”团藏惊疑不定的问道。
“这些都是我实验的产物，我想通过将一代的细胞植入动物体内，看看动物能否以此来掌控一代曾经拥有的力量，但可惜的是，一代细胞的力量实在太过强大，这些用来做实验的大蛇都承受不住其中的力量，最终爆体而亡。”大蛇丸略有遗憾的解释道。
“你只是用动物做过实验吗？”团藏眼睛微眯的看着大蛇丸，然后试探着问道。
“这项实验我才刚进行不久，所以还没有找到其他适合的实验体，而且你觉得我如果用其他实验体，那个老头子还会任由我这么做实验吗？”大蛇丸淡淡的回道。
“那你觉得如果将这个细胞植入人体之内，会发生怎样的变化？”团藏继续问道。
“根据我的推算，就算是人体，能够承受初代细胞力量的实验体应该也是百里...哦不，千里挑一，不过，相对于初代那令人向往的力量，这种赌博值得一试！”大蛇丸如实回道。
“千里挑一么...”听完大蛇丸的话，团藏不禁陷入了沉思，似乎在思考着这种实验的可能性。
“确实值得一试！”
片刻之后，团藏对力量的渴望终于战胜了自己的理智，然后他立马抬头看向大蛇丸，然后说道：“如果我能够给你提供所有理想的实验环境和实验材料，你可否愿意与我合作？”
“呵呵，如果不跟你合作的话，我怕是不但不能继续进行实验，就连木叶也肯定待下去了吧？”大蛇丸淡笑着问道。
对此团藏却没有进行任何回答，只是不置可否的一笑。
“不过我如今一个人做实验确实束手束脚，如果再失去了木叶的庇护，我的实验恐怕更难以进行下去，所以我思来想去，都没有任何拒绝你的理由。”大蛇丸仅仅思考了几息时间，就痛快的答应了团藏的合作请求。
“很好，希望我们能够合作愉快，共同为村子的壮大而努力。”听到大蛇丸同意了合作，团藏心中轻轻的松了一口气，然后主动伸出手与大蛇丸握手。
“合作愉快。”大蛇丸也伸出白皙的手，与团藏握在了一起。
于是属于木叶两个最黑暗的人，就这么狼狈为奸的勾搭在了一起，而魂叶则作为一个旁观者，在一旁亲眼见证了这一幕。
“话说团藏大人真是好有魅力，竟然连魂叶君这种人才也能被您收服。”大蛇丸与团藏达成合作关系后，突然将目光投到了一直保持沉默的魂叶身上，然后微笑着说道。
“团藏大人的远见博识是我远远不能及的，只有跟随着团藏大人的脚步，我才能将所有力量更好的发挥到保护木叶的作用上。”魂叶一听就知道大蛇丸在挑拨她与团藏之间的关系，于是立马脸不红气不喘的给团藏拍了一个马屁。
“魂叶君真是有趣，每次都能给我带来很多惊讶。”大蛇丸饶有兴趣的盯着魂叶说道。
“好了，今天的事情就先到此为止吧，后续老夫会派人协助你建筑新的实验室。”团藏主动出言打断了大蛇丸对魂叶的试探，不管怎样，团藏对于自己施展在魂叶身上的封印还是十分放心，暂时不会担心魂叶的忠诚问题。
说完这些，团藏就带着魂叶和暗直接离去，只留下大蛇丸一个人继续留在实验室，眼神闪烁不定的陷入了沉思。
接下来的日子中，团藏开始指挥根组织全力给大蛇丸建设的新的实验室，不过对外他只是宣称是建设根的基地，所以其他人暂时都不知道他已经与大蛇丸达成了合作关系。
而为了替大蛇丸寻觅实验素材，魂叶等在根组织负责当打手身份的人员，都被派出去收集素材，而这所谓的素材，其实更多是一些活人。
要收集这些活人的渠道有很多，可以从邻国抓捕一些忍者，或者从火之国境内的土匪窝中抓捕所有土匪，而这些素材中，团藏最在意的确实那些不到五六岁的幼童。
这些幼童有些即听话又有资质的被团藏挑选出来进行培训，作为以后根组织的爪牙，但大部分的却被团藏留下来做为了大蛇丸的实验体，而这项实验就是柱间细胞的移植实验。
就在根组织与大蛇丸在木叶地下进行着惨无人道的实验的时候，木叶村中却是喜事连连，先是朔茂与迈特戴接连生了儿子，而他们的儿子自然就是日后大名鼎鼎的拷贝忍者卡卡西，与凯皇迈特凯。
只不过美中不足的是朔茂的妻子生下卡卡西后，就因为难产大出血去世了，于是卡卡西刚一出生就失去了母亲。
而他们生了儿子后又过了不久，朔茂就在雨之国的战场上遭遇了幸吾夫妇，也就是蝎的父母，最终两人还是逃脱不了宿命，死在了朔茂的手中，而朔茂也凭借这场战斗成功打响了名号，木叶白牙的名号开始渐渐传开，成为了战场上令敌人闻风丧胆的存在。
雨忍村的半藏见到雨忍村的坚持不但没有给木叶带来任何麻烦，还成就了木叶中越来越多的天才，无奈之下，他终于答应了木叶的和谈，于是雨忍村与木叶的战争在历经了两年的时间后，终于彻底结束。
似乎受到木叶与雨忍村战争结束的影响，雷之国与土之国的战争在持续了两年后，也终于以两败俱伤收场。
于是这场涉及到五大国与雨之国的第二次忍界大战，就这么以所有国家都互有损失的结果落下了帷幕。
在第二次忍界大战中，雨之国可谓损失最惨重，国家基本处于被摧毁的状态，就算木叶的部队撤走了，但雨之国中依然有着各方势力进行着混乱的厮杀，最终受苦的只有那些贫苦的百姓。
不少的百姓都在战斗中失去家园，流离失所，甚至被活活饿死。
至于五大国虽然国土都没有变化，但却都损失了很大一部分兵力，而水之国虽然一直没有进行大规模的战争，但派入火之国境内的暗部部队却基本死伤殆尽，除此之外，他们还丢失了两把重要的忍刀。
不过各个国家在这场战争中损失惨重的同时，也得到了很多意外的收获，因为在这场战争中，很多年轻一代经过了战火的淬炼后，已经逐渐成熟，并渐渐成为各自村子中的中坚力量，其中以火之国最为明显。
火之国木叶村前有魂叶大战半神半藏，几乎是一夜成名，后有三忍再次借着半藏成名，而在二战的后期，朔茂的木叶白牙名号也逐渐显现，成为了令敌人闻风丧胆的人物。
与火之国状况相反的则是风之国，他们在这次的战场上虽然部队损失不大，但好不容易培养出来的三个年轻精英，却一下损失了两个，最终只留下伊铁这个独苗，导致风之国青黄不接，二战过后国力开始越来越弱。