初平三年四月，正逢天子大病初愈。朝廷百官在未央宫集合，恭祝天子龙体安康。
事前，吕布派同郡骑都尉李肃等人，带领十多名心腹亲兵。让他们穿上宫廷侍卫的服装，潜伏在宫殿侧门两边。
董卓出现在侧门外时，立即遭到李肃等人的突然袭击。董卓急呼吕布，吕布手捧圣旨，大呼：“奉旨杀贼！”
随后，董卓被吕布所杀，并且诛连三族。
长安城，李府。李儒这两日，总是感到心绪不安，每日亦是有些昏昏沉沉。
忽然之间，他听到了门外的喧哗之声，顿时脸色一变。
李儒的一个家仆，跌跌撞撞的跑了进来，脸上带着惊慌的神色。他对李儒喊道：“主人，吕布联合王允反叛，已经杀掉了太师。”
“现如今，李肃又带着兵丁前来李府，要抓走主人啊。”
李儒闻言，先是一愣，而后叹息一声：“我早知会有今日，却不想这一天来的如此之快。”
话毕，他整理了一下衣着，对那个家奴说道：“某之头颅在此，你可以将其取走，拿到吕布那里请功。”
那个家奴闻言，骇得面无人色，急忙跪在地上，说道：“主人待我恩重如山，我又岂能做出如此事来？”
“还请主人乔装打扮一番，我这就率领家中的奴仆，为主公断后。”
李儒听到家奴的话，欣慰的笑了起来，他说道：“这样的话，咱们谁都活不了，你还是拿着我的脑袋，献给吕布吧！”
长安城中，乱成了一锅粥。
这次诛杀了董卓，李肃心中感到十分兴奋。当初他投奔董卓，说降吕布，本来以为是件大功，能够得到董卓的重用。
却没想到，之后的董卓，并没有重用他，这不仅使得李肃一直郁郁不平。
“这次帮奉先杀掉董卓，为国除贼，我一定能够闻名天下。若是再抓到李儒，必定又是大功一件。”
想到了以前高高在上的李儒，将会被他狠狠踩在地上。李肃的脸上，就忍不住露出了狰狞的笑容。
“将军，前面就是李府！”
一个士卒来到李肃面前，向他汇报。李肃挥了挥手，说道：“你等将李府团团围住，休要放走了一人！”
众军士听令，顿时将李府围得水泄不通。
“哐当！”
李肃一脚踹开了李府的大门，带着一些士卒冲了进去。他正要让众人散开捉拿李儒，却发现有人提着一个血淋淋的脑袋，向他走了过来。
来人正是方才李儒身旁的那个家奴，他跪到李肃面前，说道：“将军，李儒这厮助纣为虐，方才还想着逃走。”
“好在小人眼尖手快，这才一刀结果了那厮的性命。”
“还请将军念在小人识相的份上，放过府中的佣人，他们都是无辜的。”
李肃接过李儒的脑袋，细细打量了一阵。虽说死者的脸庞显得非常狰狞，但是依稀之间，仍旧能够看到李儒的模样。
既然李儒已死，李肃的任务自然就已经完成。
他挥了挥手，说道：“就依你所言，除了李儒的亲人，其他人我就饶了他们的性命。”
而后，李肃猛然拔出腰中的佩剑，将那个家奴的脑袋砍了下来。
那个家奴丝毫没有防备，被杀死的时候，眼睛仍旧睁得很大，一脸的不可思议。
李肃将剑上的鲜血，在那个家奴身上擦了几下，不屑的说道：“其他人我可以放过，但是像你这种卖主求荣之辈，却没必要活在这个世上。”
话毕，他对着身后的士卒高声喝道：“诛杀李儒家眷，拿走他家中的财物。至于其他的人，就放他们一条生路！”
一时间，整个李府之中，李儒的家眷被诛杀一空。
诛杀掉了长安城所有的董卓党羽，王允为了撇清与董卓的关系，辞掉了董卓封给他的所有职务。并且将温侯的爵位，封给了吕布。
他自己却是领着录尚书事的职位，总揽朝政大权。
录尚书事是汉昭帝时期设立，当时大将军霍光柄政，与金日磾、上官桀共领尚书事。历史上三国时期，蜀丞相诸葛亮，也曾担任录尚书事的职务。
由此可见，录尚书事的职位，是何等的显赫。可以说，王允现在的职位，哪怕比起当初独断朝纲的董卓，亦是不逞多让。
大权在握，以及百姓、士人们的称赞，使得王允不禁有些飘飘然。
以前王允为了图谋董卓，所以不管面对何人，总是一副折节下交的态度。但是现在，每逢在别人面前，他总是摆着架子，板着一张脸。
下面的人稍微有些不如他的心意，他也不会像以前那样，好言抚慰，反而肆意责罚。
与他人议事，他甚至连做下样子都不愿意，一直都是正襟危坐，面无和悦之色。慢慢的，所有人都开始疏远王允，并不像以前那么亲善他。
就连献帝刘协，心中亦是惧怕不已，深怕王允成为第二个董卓。
王允的行事，越发飞扬跋扈。以前就连董卓，都不敢擅杀那些德高望重之辈。但是王允，却因为蔡邕的一句话，就将他斩杀。
当时蔡邕与王允对坐，谈到董卓被杀之事。想到了董卓对他的器重与尊敬，叹息了几声，脸上有不忍的神色。
王允见状，顿时勃然大怒，斥责蔡邕道：“董卓国之大贼，几倾汉室。君为王臣，所宜同忿，而怀其私遇，以忘大节！今天诛有罪，而反相伤痛，岂不共为逆哉？”
王允随即将蔡邕收付廷尉治罪，想要杀他。
蔡邕乃当世大儒，满腹才华，在士林之中非常有名望。就连董卓这个出身西凉的武夫，都对他敬重有加，更何况是其他士人？
蔡邕虽然不怕死，但他当时正在撰写《后汉书》，不想半途而废。所以就递上辞表道歉，请求受到刻额染墨、截断双脚的刑罚，以求继续完成汉史。
却不想，王允断然拒绝了蔡邕的请求。
太尉马日磾对王允说：“伯喈旷世逸才，多识汉事，当续成后史，为一代大典。且忠孝素著，而所坐无名，诛之无乃失人望乎？”
王允答道：“昔武帝不杀司马迁，使作谤书，流于后世。方今国祚中衰，神器不固，不可令佞臣执笔在幼主左右。既无益圣德，复使吾党蒙其讪议。”
马日磾退去，而告知众人曰：王允必不能长久于世。有道德的人，是国家的纲纪；写书，是国家的典籍。废弃了纲纪与典籍，他难道还能长久吗？”
依照蔡邕的所作所为，完全符合汉代士大夫的道德观念。董卓虽然令人厌恶，却对蔡邕有着知遇之恩。
若是董卓身死，蔡邕拍手称快，那才会让人瞧不起。
一代大儒，就这样死在狱中。他死的那日，满朝公卿，以及长安士子，全都痛哭流涕，为蔡邕鸣不平。
王允见状，感受到了巨大的压力，追悔莫及。
除此之外，王允在商议是否赦免董卓部曲的问题上，反复无常。
当时吕布就劝他说；“此辈无罪，从其主耳。今若名为恶逆而特赦之，适足使其自疑，非所以安之之道也。”
吕布又想以董卓的财物，赏赐给满朝公卿、将校，好得到他们的支持。但是王允，却是不从。
而且，王允认为吕布是一介武夫，心里非常瞧不起他。常把吕布，当成家中蓄养的剑客。
吕布却认为，这次能够诛杀董卓，他占据了首功，所以常常自夸自擂。王允与吕布之间有了矛盾，自然开始貌合神离。
四月，是个多事之秋。
在王允诛杀董卓的时候，公孙瓒联合刘备、陶谦、单经。让刘备屯高唐，单经屯平原，陶谦屯发干，准备攻打袁绍。
结果，袁绍与曹操联合，大破公孙瓒几人。从此之后，陶谦对曹操怀恨在心。再加上曹操新得兖州，对徐州虎视眈眈，使得陶谦坐立不安。
董卓被杀时，他的女婿牛辅屯兵于陕地。吕布派李肃前去征讨牛辅，被牛辅击败。吕布心中大怒，就斩杀了李肃。
却不料，由于董卓的身死，牛辅营中军心大乱，不少士兵半夜背叛出逃，造成内乱。
牛辅以为整营皆叛，于是带着金银珠宝，独与亲信胡赤儿等五六人出逃。胡赤儿等人谋财害命，于途中将其斩首送往长安。
吕布却恼怒胡赤儿卖主求荣，将他斩首示众。牛辅这一路的叛军，就这样被平定了。
五月，李傕、郭汜，以及董卓一些以前的部曲，见董卓身亡，就向朝廷上表请降，希望朝廷能够赦免他们的罪过。
王允却是执意要杀掉他们，几人就在贾诩的建议下，散播谣言，说王允要斩杀所有的凉州军。凉州军闻言，顿时人心惶惶。
李傕等人，趁机鼓动众人反叛，带兵围困长安。
初平三年六月，吕布军中叛徒引李傕、郭汜入城，吕布率数百骑冲出长安，王允身死。
李傕等人攻陷长安，俘获天子。
他们威逼当朝皇帝，加封李傕为车骑将军、开府、领司隶校尉、假节、池阳侯；郭汜为后将军、美阳。
樊稠为右将军、万年侯；张济被封为镇东将军、平阳侯，外出屯驻在弘农。又以贾诩为左冯翊。
自此以后，李傕、郭汜把持朝政，欺凌幼帝。他们的所作所为，丝毫不下于当时的董卓。
大汉再次经此浩劫，汉室越加威严扫地。