在段子羽努力提升实力的同时，外界也发生着许多大事，首先就是大蛇丸的死引发了不小骚乱，尤其是那一战引起的破坏之大实属罕见，后来其他势力去看过战场后，都倒吸了一口凉气，就算是几次忍界大战中，都没出现如此惨烈的战场。
大战期间引起的破坏就不说了，更重要的是因为那里死了许多恶魔的关系，充满腐化效果的恶魔之血已经将那些完全污染，方圆十几公里变成了瘴气弥散的腐化之地，生活在那里的生物全被污染，出现了许多可怕的怪物，以至于那里变成了无人区，除了那些被腐化的生灵外，其他的生物都没法生存。
这种状况就算是段子羽也没办法，只能靠世界本身的净化能力慢慢恢复，就像核污染一样，迟早有一天能变回原样，而在那之前，污染区只能保持现状。
除了木叶村外，其他势力都不知道那一战究竟发生了什么事，而木叶村也没有贸然传出燃烧军团的消息，只是尽力清剿大蛇丸的残余势力，防止燃烧军团利用大蛇丸的残余势力作恶。
不过，大家也都明白，对燃烧军团而言大蛇丸只是一个可以利用的对象，如今大蛇丸都死了，大蛇丸的残余势力也没多大用处，更有可能是会去找其他势力合作。
故此在清剿得差不多后，木叶方面就将燃烧军团的事暗中通告了其他忍者村，让各方势力千万别被燃烧军团诱惑。木叶一方也明白这样做实际上并不能防止所有势力都不被燃烧军团诱惑，所以他们只能尽力让其他势力知道燃烧军团的可怕与危害。
燃烧军团的事不出意外在忍者大陆引起了一场风波，人们第一个反应就是木叶在瞎扯，异世界的恶魔军团，这也太过虚幻了，妖怪军团还能理解，恶魔军团是什么东西？在忍者大陆可没有关于恶魔的传说。
然那被腐化的地带却骗不了人，木叶之所以没有一把火将那片地区全部焚烧正是为了有说服力，当各方势力纷纷前往腐化之地看过之后。也就对木叶的话有些相信了。
再后来，当千手兄弟与四代火影公开表露身份，并出现在公众场合后。顿时引发了新一轮骚乱，当这三位在整个忍者大陆都威望极重的火影表示恶魔军团真的存在，他们就是为了对抗恶魔军团而成为一位神祗的英灵后，忍者大陆沸腾了。
死者复活。神祗现身！
这两件事无论哪一件都能引起疯狂，但偏偏两件事都出现了，要知道在忍者大陆，就算是传说中的六道仙人都称不上神，神是只存在于神话和故事当中的东西。可神祗却现身了，还复活了一大堆已经嗝屁的传奇强者，这对世人的冲击之大，无异于九条尾兽全部复活并在大陆上到处乱逛。
世人并不知道木叶所说的神祗是谁，但三大火影复活的事是不争的事实，虽然有过质疑，但当去给其余几大忍村传递消息的人正是几个火影的时候，则一切都变了。
要知道那几个忍村里。砂忍村是直接在中忍考试见过四代火影的。而其他几个忍村也多多少少会怀疑，怀疑之下就会试探，结果一试探就发现对方的实力甚至超过了生前的水平，这种情况下也由不得他们不信了。
那么，既然死者复活和神祗现身的事是真的，异世界恶魔军团入侵的事又会有假吗？
不管其余小势力信不信。反正几个大国和忍村是信了，并第一时间有了组成联盟。共同防备燃烧军团入侵的提议。
然因为某些顾虑的关系，除了木叶和已经快变成木叶附属国的砂忍村外。其余几国都不太想与木叶联合，原因无他，木叶现在太强势了，几个传奇强者复活，又得到神祗的帮助，木叶村的实力绝对冠绝忍者大陆，这种情况下进行结盟，难免不会和砂忍村一样成为木叶的附属国，这对他们而言是难以接受的。
所以，虽然提议出来，但大家都对此缄默以对，木叶也没有催促，几方势力便进入了一种诡异的结交状态。
除了这几方势力外，还有一个势力遭受了巨大冲击，那就是火影世界里最大的恐怖组织——晓。
对于晓而言，本来整个忍者大陆都是他们的敌人，因为他们的目的是收集尾兽然后弄出月之眼计划之类的东西，虽然本质上也是为了追求和平，但也注定要和各方势力为敌。
但燃烧军团的出现却彻底打乱了晓的部署，如果燃烧军团真的存在的话，那晓又该何去何从？与燃烧军团合作？开什么国际玩笑，燃烧军团那就是一群想毁灭整个世界的怪物，和它们合作除非脑残了。
可若是不合作的话，燃烧军团降临后晓又该何去何从？按照木叶传出来的消息，燃烧军团绝对是能够毁灭整个世界的噩梦，就算整个忍者大陆联合起来恐怕也讨不了好处，这种倾巢之下焉有完卵的危机面前，晓也不能继续做他的恐怖组织了。
所以，晓的内部居然出现了与几大忍村联合抗敌的声音。
这个声音顿时让晓的两个首领——长门和宇智波带土心动了。
无论是长门也好还是宇智波带土也罢，都是因为重视之人死了才走上恐怖份子道路苦逼罢了，在听说居住在木叶的神祗能够令死了几十年的人复活后，他们就有了直接前往木叶，请求那里的神祗复活他们挚友的打算。
当然，也不是所有人都想和几大势力联合，还是有一些人对此不太感冒，其中以信仰邪神的飞段为最，其似乎已经和燃烧军团有过接触，认为燃烧军团就是他所信仰的邪神，晓不应该对燃烧军团抱有抵触，而是要迎接燃烧军团的降临。
这种想法对其他成员并不是好事，尤其是几个并不想世界遭罪的人，对于飞段私自与燃烧军团接触的事抱着深深的戒备，矛盾也不可避免的产生了。
恰逢此时，三个来自木叶的客人来到了晓的大本营雨忍村，他们就是自来也、卡卡西和波风水门，目的嘛就是为了见长门和宇智波带土。
现在燃烧军团已经把魔爪伸到忍者大陆，火影剧情全部乱套，段子羽也不打算按部就班的发展，所以就有了将几个**oss拉入阵营的打算。
无论长门也好，还是宇智波带土也罢，本质上并不是坏人，只是因为重要之人的去世而深受打击，所以就变得自暴自弃且愤世嫉俗了，对付这类人，最好的办法就是给他们弥补过去的希望，而这一点恰好是段子羽能做到的。
所以，段子羽就干脆让与长门和宇智波带土有深切关系的波风水门三人去雨忍村与他们交涉了。
面对波风水门三人的突然到来，正在雨忍村里的长门、小南和宇智波带土都吓了一跳，然后在考虑了一阵后，长门便用他的六道分身去与三人交涉了。
期间不可避免的斗了一场，结果，面对波风水门这个强势的英灵，原著中牛到不行的六道佩恩败得相当惨，因为水门直接通过英灵化后获得的气息感知能力找到了长门的本体，然后直接用飞雷神之术带着自来也和卡卡西去了长门的本体面前。
之后，三人就对长门和小南用了火影的标志性招式——嘴遁，也可以称之为忽悠！
虽然三人的嘴遁功夫都不如火影原著中的男主角漩涡鸣人，但加起来还是能顶上一两个鸣人，结果一番东拉西扯下来，长门和小南都被说服了，决定与木叶一起对抗燃烧军团。
恰逢这时，水门发现了躲在暗处的宇智波带土，然后又以师父的身份与宇智波带土来了一场深切的交流，途中卡卡西也加入，面对以一敌二的情况，宇智波带土最终被二人的嘴遁说服，决定回到木叶。
不过，无论长门和小南也好，还是宇智波带土也罢，都得到了一个承诺，那就是大家联合之后，必须请木叶的那位神祗——也就是段子羽复活他们失去的挚友与爱人。
这个承诺不是波风水门他们随口应付了事，而是段子羽点过头才能说的，虽然段子羽现在的英灵名额只剩下一个，但随着世界树成长，英灵的名额也会继续增加，而等到世界树彻底成长到完全体，英灵的数量上限也会解除，到时候多转化几个英灵也只是举手之劳罢了。
如此一来，火影原著中最大的反派势力被和谐了，如果不是燃烧军团的危机还在的话，那还真是皆大欢喜的结局。
不过，在长门三人答应与木叶联合后不久，晓的内部就出现了内乱，飞段带着几个主要脱离了晓组织，也不知道去了什么地方，连做了n年幕后黑手的宇智波带土也找不到那几个人了。
面对这种情况，晓和木叶都感到十分惊讶，并且皆有了一种不好的预感，那就是等飞段等人再出现的时候，或许一场大灾难就会随之降临。
就这样，又过了一段时间后，一个小道消息从水之国传了出来，说水之国那里出现了一些黑色的蜥蜴人，只是那些蜥蜴人有四条腿，背后有一对蝙蝠翅膀般的翼，会放出暗红色的炽烈火焰，实力十分强大，性格也非常凶暴，一般的忍者都无法与之匹敌。