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且说方腊亲至，大元军和永乐军即将展开最后的决战。
虽然已经到了穷途末路，可方腊仍旧心气不失，他当即就要遣方杰出战，还想要成为主动出击那一方。
大元军这边，石宝、鲁智深等人也在商量，准备派杜壆出手，一举拿下实力不弱的方杰。
就在这时，永乐军方面，只听得飞马报道：“御林都教师贺从龙总督军马去救歙州，被大元军大将卢俊义活捉过阵去了。军马俱已漫散，大元军已杀到山后。”
方腊听了大惊，急传圣旨，便教收军，且保大内。
当下方杰殿后，方腊罢战，御驾回至清溪州界。
可这时，只听得大内城中喊起连天，火光遍满，兵马交加。
却是石秀、张顺等在清溪城里放起火来。
方腊见了，大驱御林军马，入城混战。
石宝等见永乐军退去，知道必是韩世忠率军来合围以及石秀、张顺等建功了，紧随其后追杀。
赶到清溪，见城中火起，石宝急令众将招起军马，分头杀将入去。
不多时，韩世忠等也杀过山来，两下接应，化做一路。
四面全是大元军，夹攻打清溪大内。
永乐军哪里能敌，只能败走。
大元诸将，四面八方杀将入去，各自去搜捉永乐军，打破了清溪城郭。
方腊得方杰引军保驾防护，率领十几万精锐，撤到帮源峒中。
大元军的大队军马，很快就全都杀入清溪县来。
众将杀入方腊宫中，收拾违禁器仗，灵器、灵石，搜检内里库藏，然后就殿上放起火来，把方腊内外宫殿尽皆烧毁，府库钱粮，搜索一空。
石宝亲自率主力大军屯驻在清溪县内善后，让鲁智深、韩世忠各率人马直抵帮源峒口围住。
且说方腊只得方杰保驾，走到帮源峒口大内，屯驻人马，坚守峒口，不出迎敌。
鲁智深、韩世忠把军马周回围住了帮源峒，却无计可入。
却说方腊在帮源峒如坐针毡，亦无计可施。
不得已之下，方腊决定跟大元军殊死一战。
方腊以永乐军精锐离开帮源峒再一次向大元军发起进攻。
摩尼教的教众再次吟颂起他们的圣歌：“焚我残躯，熊熊圣火。生亦何欢，死亦何苦？为善除恶，唯光明故。喜乐悲愁，皆归尘土。怜我世人，忧患实多……”
伴随着圣歌，这些摩尼教教徒，不顾伤亡，用密集的队形冲向大元军，两方展开了最血腥的厮杀。
如今还在方腊身边的永乐军，大多都是摩尼教的死忠，他们悍不畏死，给大元军造成了巨大的伤亡，甚至一度差点撕开了大元军的阵型。
暮霭沉沉，天色已晚，可狂热的摩尼教教徒仍在疯狂的进攻。
鲁智深和韩世忠（尤其是后者）见此，沉着冷静的利用骑兵机动性强的优势，改变硬攻正面的战术，分为东西二阵，鲁智深指挥东阵，韩世忠指挥西阵，利用骑兵急驰，不断改变东西两侧的兵力配备，一会儿集中兵力攻东，一会儿集中兵力攻西，一会儿又东西分兵同时进攻。
战术节奏的变化，使得永乐军来回奔跑不迭，一会儿援东，一会儿援西，十分疲惫。
最后，大元军以付出了不小的代价打退了永乐军的进攻。
转天。
永乐军由于兵力消耗太大，将士也全都因为前日的大战疲惫不堪，而躲在帮源峒中没有再向大元军发起进攻。
大元军也借此机会舔舐自己已经露骨的伤口。
又过一日，激战再起。
这回，鲁智深和韩世忠总结上次战斗的经验教训，觉得不能再跟悍不畏死的永乐军硬碰硬了。
——这样下去，哪怕大元军赢了，也得付出不小的代价。
永乐军的战术还是没有发生改变，依旧是使用他们最擅长的人海战术。
可大元军却在韩世忠的指挥下，改为发挥骑兵和地利的优势，不再正面决战，而是主要以游斗和靠着神臂弓、床弩、投石机来远程射杀永乐军。
这种很难碰到敌人、很难跟敌人正面厮杀的打法，让永乐军非常不适应，关键拼装备他们实在是拼不过粮草辎重充足的大元军。
没办法，方腊只能指挥永乐军，不畏生死的往大元军的营地里冲，寻求直接拼杀的机会。
可一直打到晚上，永乐军都没怎么有跟大元军正面厮杀的机会。
两天的激战，由于永乐军只会一味的猛攻，这使得永乐军的伤亡非常大，尤其是今天的进攻，不仅伤亡巨大，还没有任何建功，甚至就连郑魔王等大将都战死了，进而导致大量的永乐军的将士丧失了斗志，天一黑，就开始有永乐军的将士成百上千的逃跑。
时迁派出的走报机密特种营的将士探明了这一情况，并及时将消息报告给了鲁智深、韩世忠。
韩世忠敏锐的把握住了战机，下达了将永乐军彻底击溃的作战命令。
入夜，大元军死士潜入永乐军的营寨，然后在寨后放火。
看到火光，大元军擂鼓呐喊，全线出击。
本来就已经在跑的永乐军的将士，见此，跑得就更快了。
顷刻之间，永乐军的大寨便被大元军攻破，永乐军的将士纷纷溃逃。
方腊见大势已去，只得下令焚毁营寨，连夜逃回山上。
鲁智深和韩世忠亲自来到第一线指挥大元军随后掩杀，马不停蹄地追击永乐军。
二人此刻的目的只有一个：不能给永乐军喘息之机，必须穷追猛打，彻底击溃、乃至消灭永乐军！
永乐军的将士丢盔卸甲，逃回帮源峒。
韩世忠事先安排的埋伏起来的武松、颜树德、刘广、解珍、解宝等将，见永乐军逃来，一声令下，伏兵四起。
永乐军无心恋战，只顾拼命夺路而逃。
在这场战斗中，武松等军斩首近万级，生擒永乐军将士七万多人。
紧随其后赶来的各支马军无心打扫战场，踏着丢弃遍地的战利品，下令士兵抄小路实行平行追击。
很快，仗着马军的优势，大元军所部又抄到了永乐军的前头。
但是，面对着大群大群溃逃的永乐军以及崎岖的山路，大元军虽然人马众多，却也无力将其全部“吞”掉。
没办法，各支大元军只能尽力掩杀，追敌百余里，一直追杀到天亮，战马再也跑不动了，才鸣金收兵……
转天，有一个叫“方庚”的人前来求见，说能帮大元军捉到方腊。
鲁智深和韩世忠叫方庚过来。
方庚来了之后，对鲁智深和韩世忠说，当初，方腊准备起义之时，被帮源峒里正方庚父方有常察知，方有常派二子方熊告官，方庚又把方腊禁闭粮仓中。方腊得脱，杀方庚一家四十二口而举义，唯方庚越墙逃脱，指天说誓，必倾尽全力报仇雪恨。
如今，大元军打来，方腊败退，方庚所以前来投身军前，原为向导。
方庚还表示，他已经收买了方腊的侄子方琼，获悉了方腊躲藏的山洞。
鲁智深、韩世忠等大喜，分付诸将：“今日厮杀，非比他时，正在要紧之际。汝等军将，各自用心擒获贼首方腊，休得杀害。你众军士只看永乐军阵上方琼回马引领，就便杀入洞中，并力追捉方腊，不可违误。”
三军诸将得令，各自磨拳擦掌，掣剑拔枪，都要活捉方腊，建功请赏。
不多时，大元军诸将，都到帮源峒前，把军马摆开，列成阵势。
只见永乐军阵上，方琼立在门旗之下，他还特意在头上系了一根红色的丝带。
一同出战的方庚，对鲁智深、韩世忠等人言，系红丝带之人便是方琼。
只见方杰，立马横戟，出来挑战道：“大元狗贼，哪个出来送死？”
在这个当口，鲁智深、韩世忠等人已经传令下去，不要伤着头系红色丝带之人，跟着他追杀。
见方杰出来搦战，大元军阵上，杜壆、卢俊义一块出马，两人一个舞起丈八蛇矛、一个舞起银钢枪，来与方杰对敌。
三将交马，战不过十数合，方杰便被杜壆和卢俊义击败。
方杰见杜壆和卢俊义太过厉害，他一个都打不过，何况以一敌二？
方杰虚晃一戟，望本阵中便走。
花荣、庞万春见了，同时张弓搭箭，全中方杰。
方杰应声下马。
永乐军众将，惊得呆了，各自逃生。
方琼则趁此机会，引大元军杀入洞中。
方腊领着内侍近臣，在帮源山顶上看见大元军杀了方杰，三军溃乱，情知事急，一脚踢翻了金交椅，便望深山中奔走。
大元军分开五路，杀入洞中，争捉方腊。
不想已被方腊逃去，只捉住一些内侍文官，缴获了大量灵器、灵石。
大元军大纵军将入宫，搜寻方腊。
当日帮源峒中，杀的尸横遍野，流血成渠，斩杀永乐军七万余级。
当下鲁智深、韩世忠传令，让四下举火，监临烧毁宫殿，龙楼凤阁，内苑深宫，珠轩翠屋，尽皆焚化。但见：
黑烟罩地，红焰遮天。金钉朱户灰飞，碧瓦雕檐影倒。三十六宫煨烬火，七十二苑坐飞灰。金殿平空，不见嵯峨气象；玉阶迸裂，全无锦绣花纹。金水河不见丹墀御道，午门前已无臣宰官僚。龙楼移上九重天，凤阁尽归南极院。
随后鲁智深、韩世忠等众将，监看烧毁了帮源峒中宫殿器皿屋宇楼阁，引军都来洞口屯驻，下了寨栅。
计点生擒人数，只有贼首方腊下落不明。
这时，石宝也来到了帮源峒。
得知战况，石宝传下将令，让包括鲁智深、韩世忠在内的所有军将沿山搜捉。告示乡民，但有人拿得方腊者，奏闻朝廷，高官任做；知而首者，随即给赏。
却说方腊从帮源峒山顶落路而走，忙忙似丧家之狗，急急如漏网之鱼，便望深山旷野，透岭穿林，脱了赭黄袍，丢去金花幞头，脱下朝靴，穿上草履麻鞋，爬山奔走，要逃性命，连夜退过五座山头，走到一处山凹边。
这一日，方腊来到嵌在山凹里的一茅庵。
方腊肚中饥饿，却待正要去茅庵内寻讨些饭吃。
只见松树背后，转出一个胖大和尚来，一禅杖将已经饿得手软脚软的方腊打翻，取条捆灵索绑了。
这和尚不是别人，正是花和尚鲁智深。
拿了方腊，鲁智深将他带到草庵中，取了些饭吃，然后将方腊押解出山来，正好迎着搜山的军健，一同押解方腊，来见石宝。
一众大元将士见捉住了方腊，大喜，都问：“大师，你是如何捉到这厮的？”
鲁智深道：“洒家领兵去捉拿这厮，不想入乱山深处，迷踪失径，迤逦随路寻去。正到旷野琳琅山内，忽遇一个老僧，引领洒家到此处茅庵中，嘱付道：‘柴米菜蔬都有，只在此间等候。但见个长大汉从松林深处来，你便捉住。’夜来望见山前火起，洒家看了一夜。又不知此间山径路数是何处。今早正见这贼爬过山来，因此俺一禅杖打翻，就捉来绑了。不想正是方腊。”
石宝又问道：“那老僧今在何处？”
鲁智深道：“那老僧自引洒家到茅庵里，分付了柴米出来，竟不知投何处去了。”
众人都说：“那和尚眼见得是圣僧罗汉，如此显灵。今大师成此大功，回京奏闻朝廷，可以还俗为官，在京师图个荫子封妻，光耀祖宗，报答父母劬劳之恩。”
众人皆笑。
有人更是直言不讳，大师长子、次子皆已能从军打仗了，他一个花和尚，还还什么俗，就这样挺好。
随后，众人都点本部将佐，俱已数足，将方腊用陷车锁上，解上南京，面见江鸿飞。
同时石宝、鲁智深、韩世忠等催起三军，带领诸将，离了帮源峒，到了清溪县。
吴用、孙静知道，清溪县是摩尼教的大本营，这里的人，差不多人人信奉摩尼教，大多都是摩尼教的死忠，必须施展雷霆重手，永绝后患。
在这两个心黑、手黑之人的主持下，清溪县这里人头滚滚、鲜血将这里的清溪都染成了血红色。
早有神行太保戴宗将捉到方腊的消息、彻底消灭了永乐朝的消息报告给了江鸿飞。
虽说江鸿飞早就知道了，自己肯定能消灭方腊，完成大一统。
可是现如今，自己真的成为大一统的皇帝，江鸿飞还是觉得有些如梦似幻……
……