那个程序员在随后的日子里，不眠不休的用所学的知识进行着自己的计划，但是他很快惊讶的发现了自己身体的变化。
首先是双腿逐渐麻木不能行动，然后是在耳后时不时出现的瘙痒和疼痛。起初他只是以为这是长期操劳和动脑的结果，并没在意，但随后的日子他就发现自己的想法错了，而且是大错特错！
在身体首次出现异状后的没多长时间，他就发现自己的双脚已经彻底不能行动了而是渐渐的双腿并拢在一起再也分不开。耳朵后面的疼痛虽然减少了，但是却像漏气一样觉得空荡荡的非常别扭。
他只能坐在机械轮椅上来行动，但是当有次他在照镜子的时候却发现自己的耳朵后下方竟然出现了两道裂纹，狭长而且被一层金色鳞片覆盖着的裂缝。
他不知道自己的身体出现了什么变化，也不知道这到底怎么回事。他只是个程序员，而不是主攻生物学的科研人员，随后的日子只能在恐慌中慢慢度过。
终于有一天他醒来后发现自己的双腿皮肤渐渐融合在一起，表面也出现了和头发颜色一样的金色鳞片，这让双腿看起来更像是某种爬行动物的尾巴一样。而且耳朵后面的两条裂缝也停止了疼痛和瘙痒，表面被一层金色的鳞片密集的覆盖住，看起来更像是鱼类的腮。
他疯了一样的把实验室检查了一个遍，最终发现了导致他身体异状的罪魁祸首。原来是当初磁欧石爆炸的时候虽然没对实验室造成致命伤，但是仍然把某些放置着海洋生物改造基因的一些液体药品打碎了。
那些药品挥发后散布在空气里，幸存下来的人全都吸入了不少。但是他们要么走了要么死了，所以并没发现身体的异常。但是这位幸存下来的可怜的程序员却因为时间的关系被那些药物中的海莽和鱼类基因慢慢的改造了身体，变成了这种半人半蛇的怪物。
最终调查出这个原因后的程序员丧气不已，不仅家园被毁，甚至自己都变成了这种怪物。但随后就从悲痛中回过神来，既然事情已经发生了，那再伤心也没用，这种变化是单向的不可逆转的，而且虽然双脚变成了蛇尾，但是双手却仍然能按动键盘。
他慢慢的学会了用新生成的尾巴走路，而后的日子他也发现了耳朵后的两道裂缝竟然真的是鱼类的腮，可以在水里自由的呼吸。这个发现让自己枯燥的发狂的生活变得有乐趣起来，偶尔跑到实验室外面的大海里不借助任何工具来畅游一番却也别有一番风味。但是然他伤心的是尽管每次都游很远很远，但仍然没发现任何的人类生命迹象。
此后这个程序员更是把所有的经历用在自己当初设定的计划上，而这个计划竟然和当初伏羲所做的竟然的相似，那就是时间机器！用来逆转时间，回到磁欧石爆炸的前夕，来说服当时的国王带着民众全部迁徙出去。
不过这个程序员自然没伏羲的那种专业技术，所以他只用余生编绘了一段程序。当最终的代码完成的时候，这个伟大的程序员已经因为脑力精力过度的使用而变得比原先苍老得多，但是最终他成功了，而且非常完美的做完了自己的计划。这个程序就是后来的扎尔西斯——一个人工智能！
当时那个程序员自认为虽然实验室里电脑上保存着当时亚特兰蒂斯研究院所掌握的一切关于时间倒流试验的数据，但是自己并不是专业的人员，有生之年跟本不可能全部学会而且靠着自己也不可能制造出那么庞大的机器。所以他就编成了这段人工智能，让它能控制实验室里原先派置的机械警卫，让它来为自己的设想而工作下去。
毕竟人脑再聪明，寿命再长也都有个极限，而电脑却不然。只要有能源供应，实验室的自动更新系统可以让其在能源充足的前提下所有电子元件可以一直使用下去。当初为了方便而设计的潮汐能源系统就产生了巨大的作用，理论上这个人工智能可以拥有非常非常长的时间来把电脑里储存的数据学透，然后操控着实验室里的机器人来制造出那个时间机器，回到磁欧石爆炸的前夕。
当把自己制造出这个人工智能的目的告诉它后，又为他按照自己的样子制作出一个全息影像。这个程序员就带着一个生命探测仪独自离开了实验室。当初这个新生的如同婴儿般的人工智能曾问过他，为什么要出去。程序员看着空旷的实验室：“我不知道我在这里呆了多久，外面的世界变成什么样子。那些出去寻找幸存者的同伴怎么了，我的目标已经完成了，剩下的就是你的工作。而我现在就是想出去寻找一下有没有别的同伴幸存下来，我想在自己的生命走到尽头之前尽自己的一份力。”
当他拿着那柄长长的，头上有三个分叉的生命探测仪离开实验室的时候，那个人工智能喊了他一声爸爸。程序员愣了一下，对那个站在走廊尽头的全息影像说道：“好孩子，乖乖的按爸爸的话去做。再见……扎尔西斯！”说完钻入茫茫大海，再也没有回来。
扎尔西斯说到着声音渐渐地低了下去：“父亲啊，你给我起的名字，扎尔西斯——亚特兰蒂斯语里代表永恒的希望。但是我却让你失望了啊，多长时间了，我竟然还没有成功。”
扎尔西斯叹了口气对玄辰雨说道：“父亲给我的名字是让我代表他的希望，能回到磁欧石爆炸前的那一刻，来拯救亚特兰蒂斯。但是等我把电脑里的数据全都消化干净后，才发现这个工程是多么的庞大，而只靠我自己所需要的时间将是一个天文数字。尽管知道这个计划不太可能成功，但是我却仍然按照父亲的意愿坚持了下来。但是没多久，我就感受到了一种陌生的感情，孤独。”
说着苦笑一下：“没错，我是一段程序，但是我竟然感觉到了孤独。这是不是很荒缪，一个会感受到孤独的机器？”
玄辰雨说道：“这不可笑，你是个人工智能，自然和人类一样拥有感情。从你对那个程序员父亲的态度就能看出来，你和人类并没有什么不同。”
扎尔西斯没想到玄辰雨会这么说，低声道：“谢谢。所以我制造了他，莫费里奥。我的孩子，朋友，兄弟。因为……我害怕孤独，我想有个人陪我说说话，聊聊天，就算他只是复制了我的源代码而已，这也足够了。”
“当我和莫费里奥不知过了多长时间终于操控着实验室的机器人建造好一架时间机器的时候，外面的时间却已经不知过去多少岁月了，甚至出现了你们，这种新生的人类！但是我知道这不是父亲想要的，他想要的是他的家园，和他一样的纯种的亚特兰蒂斯人！所以我们还要坚持自己的试验，但是却一次次的失败了。我们不甘心，不断的用经过此片海域的船只做实验，但每次都无一例外的失败了。就算能把那些人类船只送回到数百年前，但是却和距离亚特兰蒂斯的毁灭差了无数岁月。”
“我们也知道希望渐渐渺茫，但仍然坚持下来，只因为这是父亲的愿望，也是我诞生的初衷。不过在此间我们可以找点别的事情做了，恐怕你已经想到了。那就是拥有一个身体，可以自由活动的，有血有肉的身体！”
“我们曾经试着把自己的程序放在那些机器人上，结果不是感觉无比的别扭，就是机器的芯片受不了如此强度的能量和数据输送而报废。所以我们就把目光转向了那些船上的人类来，不过很可惜，你们这个时代的人类身体实在让我失望，不过你的出现倒让我感觉希望真的来了。”
玄辰雨问道：“我很不解，你们即使拥有了身体又怎么样，有什么意义？”
扎尔西斯喊道：“当然有！我们是人工智能，拥有人类该拥有的一切感情！但是我们现在却占据着这个丑陋的外貌，而且因为这个样子是父亲他给我编写的源代码而无法更改！如果是你，你能看着自己拖着一条恶心的鼻涕虫尾巴呆上这么多岁月么！”
这时莫费里奥对扎尔西斯说道：“能量补充完毕。”
扎尔西斯看了看被锁在凹槽里的玄辰雨：“故事结束了，人类。现在准备长眠吧。”说完随着玄辰雨的不断挣扎扭动，凹槽上面的透明玻璃罩慢慢的落了下来。
看着里面挣扎的玄辰雨，扎尔西斯嘴角露出一丝狞笑：“父亲啊，你的计划我会继续毫无希望的执行下去。但在此之前就让我感受一下做人的感觉吧。我那亲爱的，让我感受了这么多岁月的孤独与冰冷的波塞冬父亲。”