不过他的这番交代还没有传到清军前面的队伍那里去，明军的伏击便开始了。
明军居高临下，一阵猛烈的射击，清军猝不及防之下阵型大乱，张聪这时率领败退的明军从谷口往谷中反冲过去，清军抵挡不住，纷纷向山谷中败退。
明军稍稍追击之后立马脱离了战斗，迅速向着泉港的地方赶去。
明军的反击让谷中的清军一片混乱，前面的清军往后面撤退，后面的士兵还在前进，加上山谷中地形太窄，顿时整支军队乱成一团了。
李崔大怒，骑马赶上前军，这时明军已经撤出山谷了，清军前军将领将遭袭的详细经过报告给他，李崔叹了一口气，看了一眼明军撤退的谷口，下令清军先行整军，再行追击。
他心里明白，伏击他的军队应该是涂岭的守军，既然涂岭的守军出现在了这里，那么说明涂岭方向的清军攻击还是有点成效，明军应该是放弃了涂岭，只是这样一来明军肯定急于撤退，等清军阵型整顿妥当，只怕是追不上明军了。
这支明军看来很狡猾，李崔暗暗记在心中，将来要是再遇到这支明军，一定要将他们全部歼灭，再也不能让他们逃脱了。
项玉和张聪两军汇合之后马不停歇，快速的向泉港方向撤退，明军这时人数不到两百五十人，这时已经到了正午，涂岭方向的清军应该已经发现了山上的明军已经撤退了，那么他们可能立即出兵南下，袭击惠安，项玉并不关心惠安的防务，他担心明军在撤向泉港的途中会遇到南下的清军。
因此派遣了很多斥候在前面探路，好在他们运气不错，并没有遇到清军。
明军一路避开大路，直到傍晚时分才再次回到了泉港，不过海面上却看不到明军的战船了，项玉令士兵照旧点燃了几堆篝火，士兵们又累又饿，纷纷围坐在篝火旁边，过了没多久，海面上终于出现了两条船影，明军的船队终于来了。
明军两百多人花了进一个半时辰终于全部登上了战船，两艘战船向南行去，汇合着等候在海面上的另一艘大船向厦门行事过去。
此时，泉州府已经大部分沦陷，清军三面大军兵临**城下，北面的清军攻下了惠安，西边的清军从溪尾出兵直达**城下，李崔的军队也度过了安溪从后面迂回，切断了明军从陆上向南方撤退的道路。
周全斌一连发了七封告急信，请求厦门方向的明军从南边接应泉州府的军队撤退，但是厦门此时自己也是岌岌可危，海澄再次陷落，清军从三面陆地包围了厦门，在城外架起了上百们火炮日夜轰击，根本没有能力从陆地上去接应周全斌，唯一可行的是从海上派出舰队接应明军撤退，但是清军水师这时已经抵达泉州湾，清军的目的很明确，要从海上进攻，配合陆地上的清军打开局面，意图一句彻底歼灭南方最后一股抵抗势力。
在这样的情况之下，郑成功自然不会冒险派出自己手中的王牌水军，周全斌在**城抵抗了三天之后终于城破身亡，明军大部分战死，两千余人被俘，最后被清军残忍的杀死，清军的做饭激起了明军更大的仇恨，也断绝了明军投降的念头。
明军陈鹏部在高崎大败清军，斩杀清军五千余人，清军三路进攻其中一路已经被击破。
郑成功自己则率领明军水军主力出了厦门湾，布下阵势准备迎接清军水军，十月十日黎明，清军从海上出发开始进攻，明军将领周瑞、陈尧策奋勇抵抗，壮烈牺牲。清朝海军又攻击陈辉部队，陈辉令部下大发火炮，此时明军的火炮大多是西洋火炮，重量上面要毕清军轻很多，因此战舰上面一面就有多大三十六门重量在四百斤重的火炮，明军火力优势十分明显，炮击引起的大火点燃了大量清军舰只，清军抵挡不住，且战且退。中午，海上刮起大风，海浪汹涌，郑成功亲自率领巨舰冲杀清军船队，郑泰也率领浯屿方面军队加入战斗，明军越战越勇，清军溃败横尸遍海，达素乘坐小船狼狈逃回泉州。有两百名满洲兵乘船逃到圭屿，企图据守顽抗，明将马信将其诱降，然后在夜里将他们全部投入大海淹死。
这一战打完之后清军彻底歼灭明军的企图便被粉碎，海澄重新被明军夺回，但是明军自己也伤亡惨重，加上战场多在厦门附近，因此不仅军队基础设施破坏严重，而且各地的人口流失更是触目惊心，清军在福建一带烧杀抢掠带来的人口出逃，使得大批农田被荒废，大量的百姓逃亡广东、南洋。
战后的厦门，项玉走在厦门的街上，放眼望去满目疮痍，清军的炮击让这座本来就不算繁华的城市变得更加破旧，城中已经很少见到普通老百姓了，到处都是烧焦了的废墟，和一队队巡逻的士兵，项玉叹了一口气，明军在福建已经呆不久了。
在城西的一处大宅内，明军主要将领都聚集在一起，商讨今后的出路，项玉来的时候屋内已经坐满了人，他的军职比较低，有属于新晋的统制官，因此谁也没有在意他。
郑成功还没到，正堂的主座还空着在。
大堂内的将领吵翻了天，项玉留心了一下，见他们谈论的主要是明军的出路在哪里，有人说是退往金门依托水军跟清军纠缠，立马就有人反对，说金门岛地方太小，人口又少，养活不了大军，全部退到金门岛是不现实的，况且现在清军水军不行，不代表以后也不行，万一以后水战不利，金门岛就成了死地。
项玉微微点头，这人的说法不错，目光显然要比之前的一人要看的长远。
这人提起清军水师要比明军厉害，水军中的诸将自然是不满了，一人说道：“鞑子只在路上厉害，厉害的是八旗的骑射，到了海上还不是旱鸭子一个，你看看历次的鞑子水师，有哪一次是一鞑子人自己为主的？还不都是在江浙广东一带找了些回水的汉人充当水军，这样的水师怎么会是我们的对手！”
其他水军将领纷纷较好，附和他所说的。
项玉却暗暗摇头，他是知道历史的，明军最后败就败在水军上面，清军水师眼下的确不是明军的对手，但是随着施琅被重用，他训练出来的水师战斗力与日俱增，到了后来已经不亚于明军的水军了，两军在澎湖的海战当中，清军一举歼灭了明军水军的主力，台湾岛这才被康熙收了回去，虽说那是明军水军的战斗力确实是有一定的下降，但是清军水师的进步却是不可否认的。
水军方面有人出面，陆军自认不甘落后，大厅内在此吵作一团。
这时，郑成功终于出来了，将领们见他出来之后纷纷停止了谈话，目光投向郑成功，看他要说什么。
郑成功坐在正座上，向下扫了一眼，见诸将都来齐了，心里稍稍松了一口气，泉州府的周全斌战死之后，他一直担心底下的将领会心生芥蒂，因为他确实是可以救下周全斌的，不过最终他没有这么做，两人之间的矛盾也不是一天两天的事情，底下的人也都看在心里，他本以为周全斌会投降清廷，那样的话他要背负的压力就会减轻许多，不曾想周全斌竟然选择战死沙场，这样郑成功陷入了极大的被动，不得不担心下面的将领。
“诸位将军，此番我军大破清军，斩杀清军不下三万余人，大大的挫伤了清军的锐气，半年之内清军肯定不会再来进犯了，大军也可以稍微休整休整，只是诸位将领切不可心生懈怠，清军势大，我军暂时的目标就是保住福建一带的大明疆土，等待时机成熟再行挥师北上，一举荡平天下，还我大明故土！”