不过在不久前，当清军好不容易组建的水军在台南被中华军全歼以后，尚可喜就沮丧的发现自己引以为傲的先进武器在这个后起之秀的面前显得一文不值。
施琅的本事和手段尚可喜是十分清楚的，施琅派人在澳门和葡萄牙人进行的明里暗里的交易他都有所了解，但是就是这么一支规模庞大，装备精良的豪华舰队，竟然会被中华军给全歼了，这让澳门的葡萄牙人都感到万分吃仅，更别提尚可喜了。
所以在中华军派遣海军进剿他的水军的时候，尚可喜干脆就下令水军将士弃船登陆，直接就放弃了抵抗，水军提督梁标甚至是带头逃跑，搞的他还被清廷质问了一番。
尚可喜虽然不知道论持久战这个理论，但是他显然明白一个更加简单的道理，那就是等待，等待清廷和这个新崛起的国家之间的斗争，他相信以满清人强大的实力，再加上背后这么一个庞大国家的人力物力的持续支持，就算是耗也能将这个国家耗死，所以自己没有必要在这个节骨眼上当那个出头鸟，先把人保住，到时候再重新组建海军舰队和商队也是十分简单的事情。
就在这样的情况之下，中华军制定了对海南岛的作战计划，原本清军在海南岛的驻军超过一万人，想要解决这么多的陆军，中华军这边至少要出动五千人以上的军队，这可不是一个小数目了，几乎是调动了台湾岛上可以调动的军队的一大半了。不过随着清军的主力大军的撤走。海南岛这个时候几乎就像是一个不设防的地方了。而且尚可喜显然没有意识到重要的不是地盘，而是人口，因此根本就没有将海南岛上的居民向广东迁徙，仅仅就调走了自己的驻军。
既然如此，那中华军自然是毫不客气了，在十一月的时候，由十二艘战舰和五艘运兵船组成的特混舰队就从台南出发，直奔海南岛。
这一带的航线对于中华军来说已经是十分熟悉了。广东沿海这个时候已经见不到清军的舰船了，只要是吨位超过五十吨以上的船只，几乎全都被中华军这边派舰队摧毁了，以至于之前尚可喜从海南岛上撤兵的时候使用的都是小型的渔船，动用了数百艘之多，而且还不敢再白天撤兵，因为害怕被中华军发现而造成巨大的伤亡，所以放在了晚上偷偷进行。
好在琼州海峡的宽度不宽，最窄处还不到四十里地，几乎隔海相望。因此这些小型的渔船也能够比较安全的在海峡里面航行。
但是广东沿岸并不是完全没有大船，比如从澳门港口驶出来的欧洲的商船。中华军只是对他们进行例行检查之后，一般就放他们通过了，不过有一点必须要告诫他们，那就是不能在清朝的港口停靠，一旦他们违反这一个规定，那么中华军将毫不犹豫的将他们的战船击沉或者没收。
因此，这一段时间停靠在澳门码头的欧洲商船特别多，尽管马尼拉航线已经没有了，但是从巴达维亚、果阿等地驶来的船只还是络绎不绝，这些商船上面都装载有大量的货物，因此必须要出手，于是尚可喜便派人干脆进驻到澳门去，他利用自己是广东的主事官的身份，强迫葡萄牙人允许他在澳门设立商行，然后经由陆地运转货物，虽然这样要多转一道手，交接也显得比较麻烦，但是却也给他提供了绝对的垄断的便利，尚可喜可以在进货和出货两端决定价格，低买高卖，赚取巨大的利润。
本来能够在这里面分到一杯羹的葡萄牙人自然是一万个不愿意了，但是澳门的物资供给必须得依赖经由陆地通道进入澳门重要生命线，而这个生命线被尚可喜捏在手中，随时都可以切断，因此葡萄牙人也是无可奈何。
中华军自然是知道这里面的猫腻的，但是却并不想去管，这主要是因为日后中华帝国将要更多的和西方国家打交道，在这个大航海时代里面，想要走向世界，就必须遵循这个世界的规则，而且这些商船来往跑一次，利润相对于之前直接找广州城的商人代理出货来说，只能卖给尚可喜显然是要吃亏不少，这么一来等于是将大量的白银经由贸易留在了中国，这样的情况中华帝国自然是十分的乐见了。
十七艘舰船组成的舰队经过了七天的航行，终于抵达了海南岛，其实直接从台南出发一路上用不了这么多的时间的，主要是舰队一路上还要负责巡视附近的海域，侦查清军的动向，也顺带着检查过往的船只有没有违反中华军的规定。
大军在琼州府登陆之后势如破竹仅用了一天的市价就攻破了府城，岛上其他县城这个时候根本就没有驻军，城中最多只有数百人的衙役仆卒，根本就抵挡不了中华军的进攻，因此大多望风而降，不到半个月，整个海南岛就被中华军全部拿下了。
接下来从台湾派去了很多基层官员，开始接管海南岛的管理，军队这个时候也没有停歇，而是四处去剿匪，海南岛虽然人口不多，但是岛上的匪患是十分严重的，主要是海盗的数量众多，这也跟海南岛的渔民数量多有关，这些渔民平时是渔民，一见到有利可趁的时候就摇身一变成了海盗了。
舰队这个时候负责清理各处的零星海盗，而陆军则在岛上剿灭土匪，这一行动持续了两个多月，持续的时间比拿下海南岛的时间还要长的多，陆军一共击毙了超过一五百名土匪，俘虏了超过五千五百名土匪，这一数字简直让人不敢相信，一个只有十几万人口的地方，竟然有超过七千名土匪，基本上达到了二十个就有一个的样子，如果除掉妇女老人和儿童，这一比例高达4:1,再算上海盗的人数，几乎岛上有一半男人不是土匪就是海盗了。
这些俘虏自然不是教育一下就放了那么简单了，中华军目前在吕宋岛上发现了一处铜矿，这个时候正需要人手，因此这些俘虏被分批次的送到了吕宋岛去开矿了。(。)