崇祯六年九月十八日傍晚，刚插上大清旗帜不足一年的北京城，再一次响起了震天的喊杀声。
打着“援救辽东”的旗号，声称要赶往山海关布防的三万关宁军，在路过京畿之时突然发动兵变，对北京城发起突袭。而京中预先安排的内应也打开了城门，让关宁军一路杀进了北京城的各条胡同里。随即城内驻扎的汉军，也相继溃散或倒戈，跟随关宁军对盘踞内城的满洲八旗发动猛攻！
一时间，北京城内仿佛乱成了一锅沸水，街巷间燃起了成千上万的火把，将整个城市照得一片通明，各种口音的士兵发出杀气腾腾的呐喊，城内数十万百姓的哭喊声震天，而北京城头原本对外瞄准的大炮，此刻居然全部掉转了方向，一发一发地朝着内城猛烈轰击，将那些精美奢华的宅邸，全都砸得砖石迸飞。
在这一片硝烟弥漫、刀光剑影之中，大清帝国对北京城不足一年的短暂统治，终于宣告结束。
虽然自从入主北京以来，清廷一直都在提防汉人势力坐大。无奈女真八旗的人口有限，政治头脑和文化水平则更是悲剧，如果不依赖明朝留下来的官僚系统，就根本无法统治这片广袤的江山。尤其是在皇太极御驾南征之后，就连北京城的一部分日常防务、治安巡逻，也不得不交给投诚的汉军来负责。
如果是在大清帝国节节胜利、凯歌高奏的情况下，这些汉奸部队的忠心，应该还是很有保证的。但是，当辽东全境瞬间失陷，血淋淋地撕掉了女真八旗那层光鲜的外衣之后，除了少数铁杆汉奸之外，恐怕任谁也都会觉得这些成了丧家之犬的辽东蛮族，在中原的下场多半是兔子尾巴长不了。
于是，随着关宁军的再一次倒戈叛乱，整个北京城内的文武汉官全都不肯为大清王朝陪葬，不是躲在家里袖手旁观，就是一块儿加入进去反攻倒算，准备趁着大清帝国的覆灭再捞上一笔好处。
大约三千名奉命留守北京的八旗兵，倒是进行了殊死的抵抗，但由于事发仓促，只能各自为战，而且各处城门从一开始就已经失守，满洲八旗一向引以为傲的骑射之术，在极度混乱的夜间巷战之中也发挥不出任何优势。所以，无论他们再怎么舍生忘死帝拼命搏斗，也还是被蜂拥而来的关宁军杀得步步后退。
于是，在一番绝望的抵抗之后，北京的内城也宣告失陷，城内的六万多名八旗眷属，只得仓皇退入紫禁城皇宫。尽管这些人多为老弱妇孺，但在如今等绝境之下，依然表现出了非同寻常的勇气，哪怕是小孩和老人，也拿起了棍棒刀枪，哲哲皇后和大玉儿皇妃更是亲自披上了铠甲，号召众人厮杀到最后一刻！
不过，作为历史上著名的变色龙和墙头草，吴襄和祖大寿纵然已经把大刀朝鞑子砍去，却没有把事情做绝的意思，反而很懂得“做人留一线，日后好相见”的道理因此，正当困守在紫禁城内的“女真余孽”，满心悲凉地准备集体赴死之时，却没有迎来关宁军的大举猛攻，而是等到了祖大寿派来的劝降使者。
按照这位劝降使者的说法，虽然眼下双方已是兵戎相见，但上天有好生之德，凭着过去的交情，关宁军并不打算将八旗眷属斩尽杀绝，而是准备让开一条路，将北京城内的满蒙旗人一律“礼送出境”，其随身财物也可以保留。在出城之后，无论他们是打算返回老家，还是去山东找他们的皇帝，都悉听尊便。
只有皇太极的嫔妃和子女，还有满洲八旗各位旗主的妻妾，得要被暂时扣留下来。因为吴襄和祖大寿需要用她们作为筹码，跟清廷交换目前正随驾在皇太极身边的关宁将门子弟。为了让她们能够安心，吴襄和祖大寿愿意当众指天发誓，一定对她们以礼相待。当然，如果紫禁城里的八旗家眷硬是不肯接受关宁军的“好意”，那他们也没办法，只好让八旗就此灭族了。
此番通告一出，退守到紫禁城内的六万八旗家眷，立刻就开始人心动摇。
之前大家以为这回是死路一条了，这才满心悲壮地准备垂死挣扎，即使去见阎王也要拖几个垫背的。可是既然眼看着似乎还有活路，又为什么不试一试呢？跟举族全灭相比，就是再坏又还能坏到哪里去？
再说，眼下几万人都困守在紫禁城里，内无粮草外无救兵，连兵器都做不到人手一件，而外面的关宁军已经把红夷大炮都架了起来，就算大家拼死抵抗，又能支撑上几时？还不是白白送死？
最终，在求生的渴望之下，紫禁城内的八旗家眷还是同意了关宁军的招抚，心惊胆战地打开了宫门，期盼着对方的守信履约。而关宁军居然也真的履行了诺言，在软禁了皇太极的后宫嫔妃和一部分八旗显贵的妻儿之后，便下令打开城门、让出通道，甚至还搜集了一些船只，让这些旗人可以从运河上撤离。
至此，这场短促的“北京之变”，彻底尘埃落定。次日清晨，随着满街张贴的《讨虏檄文》，在喊杀声和爆炸声中躲进床板下颤抖了一夜的北京市民，终于得知这座城市又一次更换了主人。
“……昔年明廷无道，苛待良臣，盘剥万民，天下民不聊生。吾辈奋而起兵，不得已与鞑虏歃血订盟，暂借夷兵数万，欲挥师入京，肃清奸贼，匡正朝纲。孰料狡虏逆天背盟，乘我内虚，雄据燕都，窃我华夏神器，变我中国冠裳，吾辈方知拒虎进狼之非，莫挽抱薪救火之误，只得姑且饮泣忍隐，未敢轻举。
而今，伪清鞑虏宠奸臣，贪敛赋，重刑罚。不能救民于水火，反倒日罄师旅掳人钱财，吸髓剥肤，奸人妻女，与禽兽何异？故而前有黄将军犁庭扫穴，尽除关外妖氛，还辽东一个朗朗乾坤，足见鞑虏气数已尽。后有我军急兴仁义之师，拯民涂炭。今已定京师，故遣牌知会：士民勿得惊惶，各安生理。尔民有弃暗投明，检举满洲蛮夷藏匿民间者，立得重赏。其余毋得戎服，玉石难分，悔之不及。此檄！”
紧接着，在关宁军四出弹压，捕杀了少许趁乱抢劫的青皮流氓之后，北京城的秩序便再次安定了下来。
另一边，虽然北京城里的数万八旗妇孺老弱，最终都平安地出了城，而关宁军也没有毁约追杀的意思。但这并不意味着这些家伙就真的逃出了生天。因为在得知了北京之变的消息后，北直隶各府县的缙绅地主们也是弹冠相庆，随即群起而响应，纷纷组织乡勇扯旗反清，争先恐后地打起了落水狗。
当穿越者在各处占领区杀缙绅搞土改的时候，八旗大爷们同样也在京畿周边一带大肆跑马圈地，同时把那些土地上的缙绅佃农统统贬为包衣奴才。虽然皇太极身为一代豪杰，不会看不出这种破坏性掠夺政策的危害，但不管怎么说，他也首先是满人的君王，必须首先满足自己人的利益。毕竟得到利益的都是作为大清朝廷统治根本的八旗贵族，哪怕是皇太极也只能睁一只眼闭一只眼地表示默认。
于是，那些在“八旗跑马圈地运动”之中深受其害的缙绅乡民，很快就变成了最坚定的潜在反清分子。
结果，仓皇逃亡的八旗妇孺，刚刚离开北京不过二十里，就遭到了京郊乡民的袭击和抢劫，一度损伤惨重。幸好，同样是由于跑马圈地的缘故，如今的北直隶乡间也散落着不少小股的八旗兵马，此时闻讯纷纷赶来汇合，经过一番厮杀，总算是打退了乡民和土匪的进攻，护送着八旗妇孺逃进了天津城。
更要命的是，随着北京陷落，关宁军叛清自立的消息传开，整个北直隶的残余清占区，也都出现了一系列轰轰烈烈的连锁反应。那些被满清朝廷委任的地方官吏，不是被人武力驱逐，就是主动扯旗反清，整个偌大的华北平原上，到处都是一片树倒猢狲散的闹腾景象。
尤其是直接面临着未知强敌的山海关守军，在得知背后也变成敌境之后，更是立刻爆发了哗变由于满洲八旗基本都在中原腹地南征，此时的山海关守军主要由汉军旗和蒙军旗组成，在愕然得知盛京和北京相继易手之后，其对清廷的忠诚心立刻爆发了极大的动摇。最终，绝大多数蒙古人选择了打开营门，策马北上逃亡草原，而汉军旗和投降明军则集体剪了脑后的辫子，同时派人去跟关宁军联络投诚事宜。
九月二十八日，关宁军在和平接收了山海关之后，又掉头向着天津逼近。虽然无论是祖大寿还是吴襄，都无心跟八旗兵死磕到底。但天津乃是北京的门户，直扼京师之咽喉，沿着运河乘船旦夕可至北京、通州，一日未下天津，关宁军就一日不敢离开京畿，所以无论如何也得把这颗钉子拔下来才行。
幸好，之前北京的陷落，就已经意味着清庭在直隶统治的彻底瓦解。虽然天津卫城十分坚固，存粮也算丰足，但城内的人心却早就已经乱了。那些惊魂未定的八旗眷属，眼看着返回辽东无路，只得立刻又沿着运河继续向南方逃亡。而天津城内的守军也是暗流涌动，与逼近的关宁军之间使者往来不断。
接下来，在一个月黑风高的夜晚，祖大寿亲自率领一支关宁军，对天津发动了突然袭击。不过从军事上讲，这场夜袭其实并无任何必要，因为当时天津城内的大部分兵马，都在事前得到了消息，不是抓紧时间逃跑，就是预先做好了投降准备，所以城破之后的天津居然显得非常安详，民居街道俱是寂静无声。
总之，随着天津城头的悄然易帜，整个北直隶都永远地脱离了大清帝国的版图。
至此，在突然失去了整个辽东，又遭到登州镇的进攻和关宁军的背叛之后，短短两三个月之内，整个大清帝国已经从盘踞几乎整个北中国的庞大版图，一口气萎缩得只剩了北到德州，南到扬州，沿着大运河分布的一条狭长地盘，变成了一个极度奇葩的“运河帝国”。
虽然这条京杭大运河，乃是中国十七世纪的黄金水道，沿河皆是繁华城邑，如果用心治理的话，赋税收入足可以支撑十几万大军。然而女真八旗占领这块地盘不过短短半年，完全没来得及扎下根基。在如今这般局势剧变、人心叵测之下，谁也不知道这个史无前例的“运河帝国”还能维持几日。
或许，这个曾经如日中天的大清帝国，很快就会如昙花般迅速绽开，也如昙花般骤然凋零。
所以，虎落平阳被犬欺的皇太极陛下，在济南御营不幸得知上述噩耗之后，饶是他心志再怎么坚韧，也是当即又呕血三升，同时破口大骂祖大寿和吴襄脑后生反骨，将来必然不得好死。而八旗将士则是抱着各自的家眷亲人，齐声垂泪嚎哭，对失去的家乡和未知的前途命运感到无限悲伤。
只是在哭完了之后，皇太极还是不得不擦干眼泪，捏着鼻子跟关宁军的使者达成了协议，用之前随驾在身边兼作人质的关宁将门子弟，换回了自己的后宫嫔妃，以及诸位八旗权贵留在北京的家眷。再接下来，没等皇太极想好是否要立刻挥师北上，狠狠报复祖大寿和吴襄这两个反骨仔，新的灾难又已经接踵而至！
初步平定了青州府的缙绅叛乱，并且完成了民兵动员的登州镇，再一次对济南发起了大举进攻！