天启三十一年三月初，九州再次讨伐幕府，八万大军在绫部藩的九鬼隆常和山家藩的谷卫政的协助下一路势如破竹，到三月十一日，九州大军便兵不血刃地拿下了京都。拿下京都之后，郑芝龙的军队并没有对天皇一族动手，甚至还依然将天皇一族留在了京都。
天皇在这个时候只是一个象征，无兵无权，不管是对郑芝龙还是对幕府都构不成威胁，反而如果动了天皇一族的话，会使得整个东瀛的民心向背发生根本性的变化。郑芝龙不会去做这种费力不讨好的事情。
不过如此平稳地拿下京都不但出乎郑芝龙等人的意料，更是让王赛儿的计划全部落空。
“京都必须乱，还必须大乱，此事关乎皇上的计划。”王赛儿冷静道。
“娘娘，既然京都没有如期地出现混乱，那我们可在京都制造混乱，到时候娘娘的计划便可实施了。”说话的是东瀛东厂这边的掌班。
“王掌班，东厂新派了一批人手过来，这批人大多都潜伏在近畿，他们此行的目的就是为了协助我完成计划的，你速速联系上他们，负责在京都制造混乱，趁乱将天皇一家斩尽杀绝。”
“娘娘，九州的大军现在正在前往纪州藩的路上，留守京都的军队，虽有三名军官是我们的人，但职位都不高，其中官职最高的是一名千总。”王掌班道。
“那也必须实施我们的计划，一旦九州完全平定近畿，到时候我们的计划实施起来会艰难百倍，不除尽天皇一族，良仁如何能够登基？”王赛儿果断地说。
“娘娘，如果不惜一切代价的话，此事一定能成，只是有可能会暴露我们在军队中的人手安排，甚至会导致九州王对军队进行清洗。”王掌班担心地说。
“现在顾不得这么多了，而且就算我们这么做了，我也相信郑芝龙一定不敢清洗军队，第一，郑芝龙虽然称霸东瀛，但他面对大明，犹如蚍蜉撼树，必定不敢做得太过分；第二，郑芝龙一定不敢大规模的清洗军队，如果他敢清洗军队，势必会给幕府以机会，说不定会痛失大好局面。”王赛儿分析道。
“那臣立刻去安排此事，一定在近畿决战结束之前，解决京都的事情。”王掌班也明白现在的局面是箭在弦上不得不发。
“此事不能有任何闪失，不惜一切代价做好。”王赛儿叮嘱道。
“诺。”
……
三月十三日，京都城内突然出现九州军要屠城的流言，而且这个流言像病毒一样迅速传遍了整个京都城。刚开始这个流言还非常简单，只是有九州军有屠城的可能，但经过数天的发酵，这个流言开始传得有鼻子有眼，甚至连屠城的具体时间都出来了。
对于屠城这样的事情，九州军做了不是一次两次，而是经常在做。京都的百姓对于九州军会屠城的这个流言刚开始还半信半疑，但渐渐地相信的人越来越多，这使得整个京都都陷入恐慌之中，甚至有人开始逃离京都。
京都迅速陷入了混乱之中。驻扎在京都的五千九州军面对逐渐陷入混乱的京都，也进入了高度紧张之中。
三月十七日深夜，外京突然发生大火，火势极其凶猛，逐渐蔓延到了左京。
“九州军要屠城了！”城内隐隐约约有人喊道。
“九州军要屠城了！”这个声音逐渐在城内开始清晰起来。
凶猛的火势，将整个京都城都有些乱，而不明真相的人根本不知道发生了什么，听到从外京传来的声音，他们以为这是九州军已经在屠城了。
“九州军在屠城！”
“九州军在屠城！”
……
左京首先混乱起来，紧接着右京也陷入了混乱之中。而此刻负责京都的防卫九州军也不知道发生了什么事情。
“京都骚乱，传令全军进入京都。”千总刘大用下令道。刘大用就是东厂在九州军的番子。
“大人，没有参将的军令，全军进入京都的话，恐怕会受到军法处置。”
“难道你没有看到京都城内火光冲天吗？参将大人此刻就在城内，城内只有一千守军，而城内的情况我们又不知道，我军如果再不进城，贻误战机这个责任谁来负责？何况我军本就是驻防京都的军队，到时京都失守，你我皆有责任。”刘大用呵斥道。
“大人，这……”
“如果参将怪罪，我一力承当。全军立刻进城。”刘大用不耐烦地说。
见刘大用如此说了，他人也就不好阻拦了。
城内的一千的守军只是负责京都城内的防卫工作，驻扎在城墙周围，而当刘大用的军队进入京都之后，使得京都的骚乱迅速恶化。
看到全副武装的九州军进入城内，京都城内间谍高喊道：“九州军杀来了，大家和他们拼了。”
而此刻城内的浪人在间谍们的鼓动下，居然率先对九州军发起了攻击。浪人的攻击虽对九州军造成的伤害有限，但却给了刘大用以借口。
“凡是攻击我军者，杀无赦！”刘大用下令道。
进城的九州军进入了杀戮模式，不是屠城也变成了屠城，整个京都的骚乱达到了顶峰，在这样的形势之下，城内的九州军此刻也被卷入其中。很快城外的九州军也进入了城内。整个京都顷刻间变成了人间地狱。
一将功成万骨枯！王赛儿为了让良仁登基，她将整个京都都献祭出来了。
趁着夜色和京都的混乱，东厂的三百余人也杀向京都御所。此刻京都御所已经是大门紧闭，处于高度戒严之中。
“速战速决，使用火药炸掉朱雀门。”王掌班一边组织人进攻御所，一边用日语下令道。
“轰”地一声巨响，京都御所的朱雀门被东厂番子炸塌。东厂的番子从朱雀门冲入了御所。
“一个不留，全部杀掉！”王掌班用日语下令道。
有着上千年历史的东瀛天皇一族遭到了有史以来最沉重的打击，整个御所之内被杀得血流成河。东厂的番子见人就杀，绝不留一个活口。