何五通的平安归来让大部分漕帮帮众都喜出望外，李彦直在漕民间的公信力因此又增强了两分。
回到高邮后，何五通召集帮中所有堂主，香主，众头目问此行如何，何五通叹道：“李都督确实是一个仁义的人，但他说：‘自古造反，没有能善终的，我就算要替你们开脱，对朝廷对皇上也得有个交代！你们就算要来投降，也只能饶了从犯，所有涉事的头目都得死！香主以上灭九族，副堂主以上灭三族，只有普通帮众，才可绕了。’他又取出一张名单来，却是我漕帮所有堂主、香主的姓名。也不知他哪里得来。”
众堂主、香主听了脸色都是一变，纷纷叫道：“有奸细，有奸细！”
“未必是奸细。”周得业说：“咱们漕帮又不是白莲教，堂主、香主分处各处码头，在地方上都是有头有脸的人，都督府的人只要派人到各处一打听就知道了，未必需要奸细。”
众堂主、香主都觉有理，但听说要灭族杀头，还是不免战栗恐惧，欧阳信怒道：“他们既然要杀尽我们，那咱们就死战到底！难道还真的任人宰割不成？”
“死战，死战……战是一定要死！”何五通叹息说：“我这回到他寨中，他让我瞧了许多佛郎机大炮和大员鸟铳，那真是无与伦比的利器！咱们虽然占了地利之便，但真斗起来，必败无疑，拖的日子越久了，也不过是平添伤亡罢了。”
李彦直驱逐蒙古、平灭海盗，战功赫赫，漕民们也都怕他，听了帮主的话后都沉默了。
欧阳信叫道：“那难道就这么等他们来杀不成？”
“那倒也不然。”何五通说：“其实他还给了我另外一条路，只是不知大伙儿愿意不愿意。”
众堂主、香主慌忙问是什么路，何五通也不说流放，却说：“迁帮。”
“迁帮？怎么迁？迁去哪里？”
“迁去南洋。”何五通说道：“听说这位李都督在南洋开了几十个港口，几百个码头，生意倒都挺好，就是缺人，他们也雇一些南洋土番，可那些番人好吃懒做，生性又愚蠢，都不济事！所以问我肯不肯迁徙过去，每个堂口，各往一个海港去，做的仍然是以前的营生，只是由河港码头，变成海港码头罢了。我觉得这倒也是条活路，只是此事干系重大，一时未敢答应。但他只给我三天时间，三天之内若无消息，他便要动兵。我连夜赶回高邮，又召集大伙儿，如今已过去两天了。”
几十个头领面面相觑，一时都做不得声，欧阳信大不愿意，怕被骗了，周得业道：“我看他不像骗人，他若要杀尽我们时，拿大炮鸟铳轰过来就是，何必这么麻烦？”
一时议论未决，次日便有消息传来，说官军已经进驻扬州府，并大炫佛郎机炮，排排鸟铳在城头、岸边巡来巡去。原驻扎于江都一带的漕帮堂主三个里投降了两个，欧阳信愤恨无比，但不久就听李彦直对他们颇为善待，帮众听说便都心向往之。
与此同时，王牧民部早已在海州登陆，截击宿迁一带的乱贼，这次造反的三股漕民中，聚集在淮安一带的人数最多，但组织散漫，不过是乌合之众，高邮党有漕帮做底，组织力、战斗力都最强，聚到宿迁一带的却多地痞流氓，其起事不过是因时因事，并非如另外两拨人马一般基于义愤，而且所到之处奸淫掳掠，破坏甚大。
王牧民登陆海州之后派出五队鸟铳手，五队倭刀手，在当地保甲的支持下西进围剿，北面山东的卫所兵将又压下，两相夹击之下，宿迁盗众很快便溃不成军。王牧民本人杀气甚重，连带着下属也凶狠起来，这一仗杀戮颇酷烈，消息传到高邮、淮安，那些作乱的都怕了。这时又传戚继光将进兵，漕帮众堂主大恐，纷纷支持何五通投降。
戚继光领兵进入高邮，卸了他们的武器，仍有一些剽悍之辈对颇为敌视，但兵器既已缴上，心里便有愤怒也再无能为了。
宿迁的乱党一杀，高邮的漕帮一平，聚集在淮安的作乱漕民便如鸟兽散，李彦直命殷正茂进入淮安善后，处理漕运总督衙门遗留下来的事宜。
而对于那些已经投降了的漕民，李彦直倒也没有失信，他下属文官清点口数，分作十五批，让他们前往南洋，第一批却是何五通的家眷，除了留下三个有办事能耐的儿子之外，其余都被率先发配往新加坡。船只和路上的口粮，都由海军都督府承办。
何五通见李彦直如此安排，却也无奈，只好选择相信他，带着几个儿子认真帮他办事，希望这位都督看在自己勤谨的份上不要为难自己的家人。
这次是大明成祖朝以后，由政府主持的最大规模的主动移民了。移民的行动一开始只是限定在作乱的漕帮帮众及其家眷总共六万五千余人，其中有两成人在事前或者途中逃跑，但仍有约五万人通过海船前往南洋。
在此之前，李彦直已派胡宗宪南下，带领江浙福建的卫所官兵进驻南洋二十余个港口，其名义是“搜捕王直”，但王直这时已经被送到麻逸以南，在南海搜来搜去，自然搜寻不到，所以那约四万人的卫所官兵也就滞留于彼。不久后李彦直又出台了“探亲政策”，许卫所官兵在大陆的亲人前去探访，并为之安排船只，只是去南洋的船只多，且由官方公费，又有海军保护。从南洋回来就少了，且需自费，因此渐渐的就有了卫所官兵在南洋安家的事情。
南洋的自然环境本来不错，若是粗经开发的港口，生活条件也不算差，且这里商业繁荣，物产丰富，奸猾的中国人到了这里真是如鱼得水，所以很多人便都不愿意回来了。
而这次为了维持沿途的治安，江北、山东一带又有约两万会所官兵被征调去“押送”漕帮，但这两万人去了南洋之后也不回来了，其处理手段与江浙卫所官兵略同。
这三大拨的人口迁移，大部分集中于吕宋、巴拉望、飞龙寨、新加坡，迁移的人口总数高达二十万人，而且人口的流入是集聚的，吕宋、新加坡等地方很快就形成了以华人为主体的社会，并开始同化本地人。
这真是一项极其浩大的运输工程，为此海军都督府耗费了将近一百万两白银，把去年的盈余都耗光了，甚至部分透支来年的预算。但有了这帮先行者以后，就像一个被堵住的大湖破开了一个缺口，第一波的潮水冲开以后，跟着来的移民就源源不绝，却不是由官方督促，而是民间慕利前往。在接下来的几年里，大陆本土前往南洋的移民每年都数以万计，新兴的港口、码头如笋如林，多不可数。
随着海外领地的大增，东南的士林的领土观念也大起变化，先前还被视为边荒之地的大员，这时早被视为近土，就是吕宋也被福建士人视为“邻省”——海军都督府的吕宋草图出版后，许多人都已知道吕宋幅员之广大，作为一个县实在是太委屈了，因此不等李彦直开口，闽籍御史便已在建议升级吕宋为府，甚至有人认为应该升之为布政使。
而新加坡、巴拉望也都开始设立市舶司征收关税，飞龙寨也升为飞龙县，其所开发出来的土地位于湄公河三角洲，盛产稻谷，如果说前往新加坡、巴拉望的多是商贾、挑夫、贩子，那么来到飞龙的便多是在大陆失去土地的农民，他们到了这里之后努力播种耕田，渐渐稻香遍野，看来假以时日，必能与吕宋、大员并列为三大新粮仓。
当然，隐忧也是有的，比如飞龙寨西临暹罗，北接安南，几个东南半岛国家都对之虎视眈眈，只是震慑于大明的威势一时不敢动而已。主持此处军务的张琏又是一个极有魄力的人，他背靠大海无后顾之忧，便四处出击，除了向原始森林要土地之外，更渐渐将势力延伸到占城境内，占城国王温和软弱，又慕大明国威，因此对他倍加容忍，在听说吕宋酋长内附后成为大明贵族后，也有了举国内附之意。
李彦直看着不断从上海海关走出去的移民，对陈羽霆道：“这扇大门总算是真正打开了，以后我再不用担心它会关上了，就是关上，也不是在泉州、上海关上，而是在新加坡、巴拉望关上了。南海成为我中华内海已成必然，安南再次回归也是迟早的事了，莫氏挡不住我的。”
“那么，是否该把王直抓回来了呢？”商行建问。
“抓他回来干什么？”李彦直笑道：“从巴拉望往南是麻逸，麻逸往南还有一个很大的大陆，那片大陆养羊养马似乎不错。我想是不是能把那里也收了，那样我们以后要打蒙古时也就不缺马了。”
就在这时，新加坡方面传来了紧急军情——葡萄牙宣布新加坡附属于马六甲，要驱逐华人了。