也就在被革除了三边总督职务，以戴罪之身来南京，准备协助曹越练兵的孙传庭抵达南京后的第三天，曹越收到一个消息，代孙传庭出任三边总督平定流寇之乱的洪承畴，因为染了风寒，再加上长途旅行的劳累，竟然在西安一病不起，最终不治身亡。
这消息传来，曹越差点被惊呆了。
历史上的洪承畴，不是最后兵败投降满清，还得以善终了吗？现在，这一切都没发生，这个历史上著名的汉奸，并没投降满清，依然还是大明的顶梁柱般的大臣。曹越还在想着，因为他的出现，松锦之战胜利了，这家伙会不会投降满清？却是没想到，现在洪承畴竟然因为染了风寒而亡，这也太出乎人意外了吧？收到消息后，曹越好半天回不过神来。
消息传来的时候，曹越正和刚刚抵达南京不久的孙传庭在讨论事情，知道这消息后，两人都呆以了那里。“完了，”这是曹越和孙传庭同时的惊叹。洪承畴病亡，孙传庭又被朝廷贬到南京来，西北战事将无人统帅。曹变蛟走后，陕西、河南、四川的兵马就无多少精锐，再没有强有力的人物统领，还怎么和李自成的农民军打？无论是曹越，还是刚刚到南京的孙传庭，都知道事态的严重。
朝廷免了他的职，孙传庭心里有怨气，但对陕西、河南的形势并不太担心，他知道洪承畴的能力。因此他也没多少牵挂就离开了西安，哪知道他离开西安才几个月，却传来消息说洪承畴挂了。这对天下局势一直忧心忡忡的孙传庭来说，不亚于致命的一击。
还是曹越镇定一点，手中握有近十万兵的他，马上就做出了决定：“孙老头，我觉得，南京新军要马上有所动作，不让流寇有倾力攻击陕西、河南的机会。我也要向朝廷上奏，请陛下重新启用你。让你到西安任职，统领三边兵马。”
“老朽马上向朝廷请奏，回西安去领军!”孙传庭并没否定曹越的意见，虽然他认为曹越有点冲动。两人也没耽搁。马上就以急报的形式，向北京请奏。
但出乎意外的是，崇祯皇帝并未听从曹越及其他一些大臣的请奏，不同意让孙传庭返回陕西任职，而是以新任的工部尚书范景文为三边总督。总领陕西、河南、四川、湖北、山东等地的军务。他还下诏批驳了一番想重回三边总督位置上的孙传庭，说朝廷没有治他的罪，已经是格外开恩，现在竟然还想趁机官复原职，太异想天开了。崇祯皇帝以非常严厉的口气斥责了一番孙传庭，再令其好生反省，一心一意助曹越练兵。
曹越请求率新军到河南、陕西一带作战，与其余人马一道抗击流寇的请求也未得到崇祯皇帝的同意。崇祯皇帝令曹越好生练兵，南京新军怎么安排，他会有旨意来。在朝廷没有最新旨意下达前。南京新军不得离开防区，不得私自调动。
“孙老头，咱们的皇帝陛下，这是为自己自掘坟墓啊!”看罢崇祯皇帝的回批，曹越苦笑着冲孙传庭嚷嚷，“天下危局，不知人善用，把你这样的人才贬到我之下，助我练兵，这是天大的笑话。我麾下这近十万最具战斗力的人马。也不派上用场，光凭那些没办法完全统属的军队，怎么平叛？要是再这样下去，大明很快就会被流寇攻灭。不需要建奴的力量就可以被流寇消灭。”
孙传庭也很沮丧，他没有因为曹越的大胆言语而吃惊，而是顺着曹越的意思说道：“小子，你所说不错，如今局势危急，要是朝廷不做出强力的应对。那很快就回天乏力。唉，曹越啊，这事我们也没办法，说不定不是陛下的本意，而是朝中那般家伙轮番劝诫皇帝后做出的决定。”
曹越听了默然，朝中那般只知道争权夺利、相互倾扎的大臣，在朝堂上会做什么，能想象的出来。勤勉但昏庸的崇祯皇帝，最终做出这样的决定，也并不出人意料。要不是这样，原来历史上，大明不会那么窝囊地覆灭，崇祯皇帝也不会走投无路最终上吊自杀，自杀时候身边只有一个王承恩。
“这样的政权，还是让他覆灭吧，一切推倒重来，大明才有希望，”曹越轻轻地叹了口气，心中又升腾起曾经有过的念头，并很快就调整了自己的心态，沉默了一会后，对孙传庭说道：“孙老头，朝廷既然这样决定，我们也无力改变，那还是做好我们的本份之事吧。”
曹越转瞬之间态度就发生了改变，让孙传庭非常吃惊。
“小子，为何这么说？”孙传庭有点恼怒了，“难道你就这样听任陕西、河南、四川陷入贼手吗？”
“孙老头，我已经向朝廷请命了率南京新军驰援河南、陕西，但朝廷不同意，并且令南京新军不得私自调动，我还能做什么，只能继续练兵!”曹越一脸的无奈，“我可不想因为违抗朝廷的令，落了一个和你一样的下场。”
“小子，别和老夫耍花招，这不是你的本意，”孙传庭却严肃了眼神，收起了平时在曹越面前经常流露的嬉笑神色，一本正经地说道：“你小子不是这样的人，你不会听任局势变坏而无动于衷，你老实告诉老夫，是不是起了什么心思？”
孙传庭竟然会这样说，让曹越心中一凛，但他却没有丝毫惊慌，而是很恼怒地回答道：“孙老头，我认为我会和李自成、张献忠一样起兵造反，或者像左良玉、刘泽清一样拥兵自重吗？”
“你敢说你没这样心思？”孙传庭的眼神变得咄咄逼人了，但这样的眼神只持续了一会，马上就收住，说话的口气也变了，“小子，在老夫面前你就不要隐瞒什么了，你如果有什么想法，可以和老夫说出来。也不瞒你，老夫同样对朝廷失望，对陛下失望。不破不立，如今唯有迁都南京才有可能救大明，但陛下和朝中大臣都不答应，也就是说，如今大明的危局，无人可解。”
曹越有点接受不了孙传庭瞬间的态度改变，怔怔地盯着对方看了一会后，压低声音说道：“孙老头，你的意思是，听任北京被流寇攻破，然后我们拥立新君，迁都南京？”
“我什么也没说，这是你说的!”孙传庭马上又恢复了一副臭面孔，也不再理会曹越，顾自走出屋去了。留下曹越一个人在屋里发呆了半天。(。)