在北京建立兵工厂、火药作坊、新式军营，这是北京局势基本被掌握后，曹越认为他最需要做的其中几件事。 北京距离南京有近两千里路，即使运河畅通，从南京过来的船，也要个把月才能抵达，从山东过来也至少有几天甚至十几天。走陆路时间更长，如果北方的军队军需供养都要靠运河或者陆路运输，那根本没办法支撑起更大规模的战事。
北方的军工制造马上要建立和恢复，并争取在较短的时间内，制造出火炮和火枪、弹药。
原本北京及北方其他重镇，都有火器作坊，建奴占领北方几省后，这些火器作坊并没被破坏，只不过其中一些被建奴接收了而已。虽然这些作坊没办法生产新式火器和火枪，但老式的火炮及火枪能生产，火药的制作更不在话下。火药是火器战争最必须的一种原料，有了它，火炮和火枪都没有，依然能进行战争，因此包括北京在内，那些被收复的城池内的火器作坊，都开始了大规模的生产。
曹越准备在接下来的时间内，在北京、大同、太原、武昌、济南等重镇，都建立新型兵工厂，制造新式火器及弹药。但曹越也知道，要想让北方的兵工厂生产出武器弹药，至少要一两年的时间，毕竟机器及各种原料的采买、安装，要耗费非常多的时间。
曹越最缺少的就是技术和工匠，他准备在局势平静下来后，想办法从西方挖掘更多这方面的人才过来，为大明所用。不只武器制造方面的人才，其他各种自然科学、人文科学方面的人才也都要想办法挖掘，并且要大力发展大明的科技生产力，要建造更多的新式学校，培养更多的人才。
建奴的威胁，可以说暂时消除了，狼狈逃跑的多尔衮和多铎所领的残部。很难再对盘居在北京一线的大明军队构成威胁。现在曹越最要提防的，就是死灰复燃的流寇。曹越想不到局势会变成这个样子，早知道的话，就让建奴再打流寇打的悲剧一点。让李自成再没卷土重来的机会。
人算不如天算，这是曹越无奈的感慨。那收拾流寇，平定陕、川叛乱的事，也只能交由大明近卫军去完成了。不过曹越并不着急，他没想过现在就发兵讨伐流寇。而是准备等一等。
待大明近卫军的实力更强大，强大到让流寇听了都害怕。把朝廷能控制的地方恢复好，让所有百姓都过上好日子，那流寇就没有造反、反抗朝廷的理由，他们即使继续作乱，也会逐渐失去民心，最终会走向衰败。说不定到了那时候，不需要进行派兵剿灭，流寇会自动散伙。
曹越把这意思告诉了曹变蛟，曹变蛟听了后。也认同曹越的提议，暂时不对流寇用兵，先采取观望和招抚的办法，利用各种手段瓦解流寇的军心，想办法把李自成和张献忠手下的一些能者挖过来，慢慢削弱流寇的实力。
现在大明朝廷要做的，就是先肃清北方五省的建奴和乱兵、土匪，稳固这片刚刚收复之地的秩序，恢复生产，让那些流离失所的百姓有家可归。有房住，有田种。
因为建奴的败走，布木布泰、哲哲和福临又宣布归附了大明，北方五省的形势在很短的时间内就发生了改变。建奴的残余力量土崩瓦解，大明近卫军过处，到处都是欢迎王师的官民，那些曾投向建奴怀抱的原大明官员，又摇身一变，把自己当作大明官员自居了。对于这些墙头草一般的官员。曹越下过密令，必须严惩他们，但在刚刚恢复占领之际，还要依靠他们来维持秩序。
曹越在密信给孙传庭，要朝廷马上派遣大量官员北上，治理这些收复之地的同时，也要孙传庭制定出如何处置这些变节官员的办法。当过汉奸的人，注定没有好下场，这是曹越给出的最低要求。至于怎么处理，就交给孙传庭和朝中那般大臣去讨论。
曹越要的是北方的稳定，还有就是给那些变节者以教训，用这些人的下场训诫后人，莫要再当汉奸祸害百姓，不会有好下场的。
剿抚结合的策略，收效还是非常大的，北方五省的那些重镇，在很短的时间内都回到了大明手中。大明近卫军北伐人马，分别在这些军事重镇驻扎，维持当地的治安，并提防建奴和流寇可能的偷袭。
在曹越抵达北京后，战事并未完全平歇下来。与建奴及吴三桂的关宁军之间的战争还在继续。北京收复后，山海关依然被建奴占领，后曹越派黄得功攻打山海关。建奴原本就打算放弃山海关，多尔衮也没派重兵把守，这座扼守关内与关内咽喉通道的重镇也很快就被攻下，黄得功亲自率军镇守。
吴三桂的关宁军在建奴入关的时候，充当了屠杀汉人的急先锋，吴三桂兄弟知道，曹越定不会饶他们，也就放弃了重新归降大明的想法，一条道走到黑，追随建奴出关去了。但关宁军中许多将领及军士不愿意离开故土，流离失所在草原上的游荡，他们选择了偷偷逃跑，逃回家或者向大明近卫军投降，最终跟着吴三桂兄弟出关的只有不到三万人马。曹越也没派兵追杀，任他们逃出关外去。
冬天将临，也不是出关作战的时候，再加上曹越也想让大明近卫军休整一段时间，整固后方，所以也就听任建奴和吴三桂的人马撤到关外。
而李自成所领的流寇，在追击阿济格的人马到河南后，因为畏惧大明近卫军，怕遭到大明近卫军的重创，很明智地选择了退兵，退回陕西境内。曹越也没令大明近卫军追击，只是让几个近卫师驻防河南，如果有敌来攻，坚决还击，但不主动进攻。
在冬天到来的时候，北方的战事基本平静下来，长城以南，再没有建奴的踪迹，流寇也都退到了陕西和四川境内，不敢轻易来挑事。一时间，好似整个天下都平静了下来，很多人甚至心生错觉，战争已经结束了，连驻扎在北方的大明近卫军将士也是这样。
而曹越在严冬来临之前，选择了离开北京，返回南京。(。)