广州发生变故后，福建也出了情况，
李厚基在自己的领地有两支部队他不能掌控：一支是第二师，师长、汀漳镇守使臧致平，另一支是二十四混成旅，旅长王永泉。
王永泉旅原是徐树铮的西北参战军的一部。早在民国七年九月，王永泉以“奉军补充旅”名义，实际受小徐指挥由洛阳南下，经蚌埠、浦口，转乘建新、福州两轮开至福建。
臧致平和王永泉对李厚基态度一向傲慢，李当然视他们为眼中之钉。
直奉战后，奉系战败，而南方由于陈炯明部兵变，南方政.府大总统也离开了广东。墙头草的李厚基，本来是属皖系，现竭力献媚吴佩孚以求保全自己。
吴则因为福建濒海，鞭长莫及，正好利用李作为分化皖系和对付广东的倚重。
李得到了吴的支持，就先对臧致平下手。
一九二二年年六月五日，他突然到漳州解除臧致平的第二师长兼职，改由自己兼任，令臧专任汀漳镇守使。臧忿而离漳去沪。
接着他请北京政.府调开王永泉。
李厚基背叛皖系不过是自求生路，但事做得有些不近人情。
他和徐树铮是表亲，又是同乡。在皖系得势的时候，小徐曾经是李的依仗。
在皖系失势后的一九二一年的春天，徐曾秘密到福州，劝李必须与卢永祥忠诚合作，又托李代致陈树藩一个密电。
李收了电稿并未替他照发，对小徐的态度也很冷淡。
一九二二年八月十八日，徐树铮在上海曾有一函致吴佩孚，劝他拥戴孙、段二老共谋统一。吴当然不会听他的。
与此同时，小徐也曾派人持函到福州去见李厚基，李竟拒而不见。
有人看不过去对李说：“你们是至亲，这样做不太过分吗？”
李大声说：“有什么过分，他是一个惯于兴风作浪的人，我惹不起他，还是少接触以免是非。”
一九二二年十月二日，徐树铮携带八十万元，由浙江偷越仙霞岭潜抵延平王永泉军中。随小徐同行的有曾任旅长的尹同愈、曾任团长的齐暗农和孙象震，以及曾任营长的汪某。
因为事先已商量好了，小徐抵延平的当天，就通电设立“建国军政制置府”，自称总领建国军政.府制置事宜。
宣誓“以至诚至敬，尊奉合肥段上将军祺瑞、中.山孙先生文为领导国家根本人，何日见此二老共践尊位，发号司令，树铮即当束身司败，俾听质讯。”
这个不伦不类的组织，应该是根据徐树铮所著《建国诠真》一书设立的。
徐树铮的《建国诠真》，大体与民初约法一脉相承。最大的特点就是总结了民初局势和大背景提出了“加权的责任内阁制”。这个理论简单来说就是在肯定国会、总统地位的同时，提出给内阁更多的权力而相机行事。
这个提法跟当时的大背景府院之争有关。袁世凯死后，北洋系群龙无首，很多人提出推举有威望的人当虚位总统，有实力的人实际把持内阁。
但北洋系是一个割裂的松散联盟，不在位的实力派往往会利用总统制约内阁，时常爆发府院之争，徐树铮就是第一波内阁——皖系内阁的核心人物。
这本书写于皖系被直系拱翻之后。徐树铮在这本《建国诠真》中提出的加权内阁概念，一方面可能是出于被拱翻后的不平，另一方面也可能是清醒地认识到了受国会和总统制约，内阁权力不大，确实很难履行责任。
十月三日，小徐电劝李厚基辞职离闽，限于五日以前答复。
同日，王永泉已和退入福建的北伐军许崇智商量决定，两部联合进攻福州。
许部担任左路由建瓯进攻古田，王部担任右路由樟湖坂进攻水口。
福州大为震动。李厚基勒令商会筹饷五十万元。福州发生挤兑风潮，官吏眷属纷纷避难，离开福州。
六日，许崇智部占领古田，会合王永泉旅进攻水口。并派黄大伟，李福林两部由古田经大湖向福州推进。孙本戎旅由大湖向白沙推进，包抄水口后路，并截断水口、福州间的交通线。
九日，李厚基派他的表弟，警务处长史廷飏率领留省部队开赴水口增援。
十二日，许、王两部占领水口，闽方唐国谟旅向福安、闽清方面退却。李福林、黄大伟两部遂乘虚由甘源里进至洪山桥，前锋由王懋功率领，轻骑进入福州。
李厚基先跑到台湾银行，随后又逃上海军军舰。
海军在萨镇冰指挥下，将李部缴械，并将李厚基软禁在马尾海容军舰上，逼迫李交出他在福州搜刮到的财富。
十三日，闽方史廷飏部从白沙败退下来，曾向福州城发动反。，李、黄两部因人数不多，仓皇退走。幸好孙本戎部由白沙衔尾追击史廷飏，李、黄两部回师应战，史廷飏腹背遇敌，所部三千余人遂缴械投降。
李厚基垮台后，福州各团体遂提出“闽人治闽”的口号。推举萨镇冰为临时省长，并通电拒绝“客军人闽”，阻止南北两军在福建境内作战。
萨镇冰和海军本是站在北京政.府一方，可是这次驱李战争中却帮助了南方的北伐军。不过他却不肯脱离北方。
而直系也想利用海军来驱逐北伐军，授意北京政.府于十月十五日任命萨镇冰为福建省长。
这样，萨镇冰这个福建省长既是福州各团体所推选，又是北京政.府所任命。
萨镇冰在给北京电报时，把扣留李厚基一事说成是“保护”，而吴佩孚则将计就计地请萨派遣军舰把李厚基护送到厦门登陆。
福州的易帜，是南方政.府、皖系、奉张三角同盟在直系全盛时期的一次尝试，北伐军也算找到了一个立足点。
此时，张作霖派奉天兵工厂督办韩麟春到上海，劝南方政.府出兵江西、湖南，并约卢永祥进攻江苏，而奉军即大举入关反攻。
国民党人也纷纷电请南方政.府大总统到福州组织政.府。
但南方政.府大总统坚持要先讨伐陈炯明，光复广东，清除后患，才能出兵北伐。
十月十七日，徐树铮、许崇智、王永泉进入福州。徐树铮便以“制置府”总领的名义，任命王永泉为“福建总抚”，统辖军民两政；并任命王永泉、许崇智、臧致平、李福林、黄大伟为建国军第一至第五军军长。
在此以前，南方政.府大总统曾任命许崇智为东路讨贼军总司令，下设三军。由许崇智、黄大伟、李福林三人分任军长。
许崇智、黄大伟、李福林都不肯接受小徐的任命令，从十月二十八日起，改称“讨贼军”。
萨镇冰已于十月十五日就任临时省长。
照理说，所谓的福建总抚，应该是具有督军兼省长的性质。但是王永泉、许崇智等并不否认萨的省长地位，他们都参加萨欢迎他们的宴会。
这个时期的福建竟成为南方政.府、皖和北京政.府三种势力和平共处的地区。
十月二十四日，北京政.府下令讨伐徐树铮，任命李厚基、萨镇冰为讨逆军总司令和副总司令，高全忠为闽军总指挥。
这个命令是在吴佩孚的一再催促下才发表的。
本来应该把北伐军一并列入讨伐之列，只因王宠惠内阁不愿与国民党为敌，所以把讨伐的对象只集中在徐树铮一人身上。
有意思的是，北京政.府所任命的讨逆军副总司令，这时却正在福州和被讨伐的人把酒言欢，而总司令却是一个失去自由的俘虏。
十月十八日，北京参陆办公处电派常德盛为援闽军总司令，这样，北京政.府对福建就派出了两个总司令。一个是援闽总司令，一个是讨贼总司令，两者各不相属。
李厚基虽然被俘，但他的直属部队王献臣旅在上杭、张清汝旅在泉州、高全忠师在厦门，因此，吴佩孚依然很看重他。
此外，吴佩孚还调动了几路人马，包括驻武穴的鲁军张克瑶旅、驻崇阳，通城的鄂军第二混成旅寇英杰、北洋第二混成旅胡念先两部和杜锡珪所属海军舰队以及在江西的周荫人、常德盛两师。
常德盛师已于十月十八日由南城开抵杉关。
粤军尹骥旅开抵平和后也拟向龙岩推进。
尹于十月十六日曾到上杭与北军会商作战计划，陈炯明希望取得指挥闽、粤、赣各军的军事全权，以便统一布置。
吴佩孚不愿把北军的指挥权交给陈，陈的态度便趋于消极，不肯单独进攻。
徐树铮奇袭福建，震动全国，可是不知他是怎么想的，组织了一个不伦不类的怪政.府，名不正，言不顺，引起了各方的反感。
尤其是他所谓的“总抚”，更是令人费解，颇似清朝的总督、巡抚。他所编拟的组织，是总抚之下设军政、民政、财政三署，这个制度也是根据他的《建国诠真》的官制篇所规定的。
十月三十日，建国军、讨贼军举行联合会议，选举福建籍的国民党人、广州国会议长林森为福建省长。
同日，王永泉取消“总抚”名义，改称福建总司令，并取消建国军名义，改称福建第一军军长。
徐树铮表示“建国军政制置府”的职权，类似国务院，将随军事之进展而迁移他处，不会长期设在福建。
这一表示仍然不能获得谅解，徐又打算取消制置府，改称建国军总司令。
十一月一日，徐树铮通电主张迎接段祺瑞到上海和南方政.府大总统见面，并在上海召开联省会议，解决组织政.府和各省共同出兵讨伐直系的问题。
但是很遗憾，徐的电报没有人响应。
就是这个时候，段祺瑞派王郅隆到福州来，劝小徐取消制置府，离开福州。
而王永泉这时已是福建的主人，也不愿意有一个不伦不类的太上皇，极力想把小徐赶走。
许崇智等认为这是皖系自己闹意见，不愿介入。
徐树铮在这种情势下只好黯然离开福州。于十一月二日乘轮去上海，他的建国军政制置府也就因此而寿终就寝了。
十一月三日，福州各界举行大会，宣布“闽人自决闽事”，阻止各方军队入闽。林森宣布就任福建省长，萨镇冰则取消了临时省长名义。
王永泉于十一月六日向北京政.府通电输诚，但是，暗中仍和国民党敷衍。
李厚基的母亲曾自上海送来一笔“赎款”，李遂被海军释放。
十月三十日，李厚基乘靖安舰到南京，和齐燮元、杜锡珪相见，共同讨论反攻福州的计划。
十一月五日，李乘舰到了厦门，当他看到臧致平与高全忠同在码头上欢迎时，不禁大吃一惊。
原来臧已由上海先到厦门，高全忠顺势推臧为闽军总司令。臧向李表示，此行是为安抚部属，保全地方而来，并不反对北京政.府。
这时，曹锟、吴佩孚都有电到厦门，召臧致平北上，李厚基也劝臧应召前往，臧也表示同意。
不料十一月七日，臧鼓动第二师官兵向李讨军饷，吓得李、高两人逃往鼓浪屿。
八日，臧致平有电给陈炯明云：“李督军五日莅厦，致平往谒，重卸仔肩，俟有替人，即当北上。七日闽有少数溃兵邀同驻厦军队向李督索饷，李督即偕同高师长他往。是时致平适在鼓浪屿候船，挽救无及，厦门绅商请致平维持地方治安，致平仍本在漳州宣布之宗旨，与贵军一致行动（意指维持闽粤两不侵犯条约）。”
十一日，臧致平又致电北京政.府，报告李、高离开厦门情形，并表示“服从中央”。
国民党方面汪兆铭等主张不要迫使陈炯明完全倒向北方，设法阻止陈炯明帮助李厚基援闽，极力促成南方政.府大总统和陈炯明言归于好。
曾经是共同作战的战友，本没有深仇大恨，这样做肯定是明智之举。即使不能壮大自己的力量，至少多了个同盟军。但南方政.府大总统对陈炯明芥蒂极深，坚持要陈炯明写悔过书才可以不究既往。
南方政.府大总统被困在军舰上时。陈炯明就几次派人讲和，但都遭他拒绝。徐绍桢被派到广州和陈炯明联络，陈炯明拒绝写悔过书，调停遂告失败。
福建变成了群雄逐鹿之地，曹锟、吴佩孚调豫军常德盛师于十一月中旬先后占领光泽、邵武、建宁、将乐等县。粤军尹旅占领上杭、龙岩、永定等县。
十一月二十九日，李厚基到上杭与尹骥等举行军事会议，即派张清汝、王献臣为第一、二两师师长，拟联合粤军大举反攻漳州。
臧致平意欲独霸一方，本来拒绝“讨贼军”开入闽南。由于受到两面压力，便又转而与讨贼军及民军合作。
十二月十六日，两路会师泉州，张清汝逃往南安，所部五营缴械投降。王永泉部开往闽北，抵御常德盛师，十二月中旬接连收复将乐、延宁、邵武。
豫军常德盛师退往江西境内杉关、黎川一带。这时，福建的局势总算稳定下来。