双方在香港的英国中国舰队司令部举行了友好的谈判，一上来，俄国代表就痛陈台湾潜艇采用不光彩手段，偷袭俄国舰队，造成了俄国多少多少损失，沙皇如何如何愤怒，俄国人民如何如何不答应，要求台湾如何如何做，才能平息这些损失、愤怒和不答应。
然后就是法国人提出1899年那支失踪的法国舰队，也是遭到了台湾的偷袭，也必须用各种诚意来补偿，否则就……等等。
最后是英国人、德国人在充分赞同俄、法两国提出的要求的基础上，又提出了需要对台湾的军事实力进行检查，并派出各国部队驻扎在几个重要的港口，以确保以后的东亚和平等等。
美国人到没提出什么检查和驻军要求，他们只是提出，台湾应该就地位问题和日本再进行谈判，以便解决一直都没有解决的台湾归属问题。
台湾的代表团秉承了刘芾要求的不退让，不承认，不负责的三不原则，对俄国和法国的指控概不承认，并指出，这些指控只是两国海军指挥官为了推卸责任而强加到台湾头上的，这种黑锅，台湾不能背。
对于英德两国的提议，台湾代表团也是一概拒绝，并声称，由于各国不承认台湾的合法地位，所以台湾没有义务接受各国的军事检察，也没有义务为保持什么东亚和平出力，除非各国政府正式承认台湾的合法地位，这些问题才能够继续谈。
对于美国的提议，台湾代表团回答的更干脆：台湾现在和日本正处于交战阶段，从1895年台湾队日宣战以来，两国从没有宣布过停战或者解除战争状态，所以，两个正在打仗的国家，不打出一个胜负来，就没法坐下来谈判，美国人的提议台湾可以接受，不过要等到日本投降的时候才能够实施。
就这样，你提指控，我要证据，你提检查，我要地位，你提地位，我要对方投降，反正是一句话也说不到一块去，这5个国家和台湾在香港一谈就是半个多月，连一个最基本的谈判构架都没谈出来。奇怪的是，就这种谈判居然还继续进行着，从这点看来，5国和台湾都没有拿这次谈判当回事，心里都打着自己的小九九。到了后半个多月，各国干脆不谈什么要求和条件了，反正能谈的都谈差不多而来，大家也熟悉，5国代表干脆和台湾代表拉起了家常，什么台湾的气候啦、台湾的特产啦，台湾的新政府啦；台湾代表也不含糊，立刻开始询问英国的**级战列舰、德国的克虏伯装甲、美国的从去年开始的永久性排华法案等等，一直扯到了1906年的春节，台湾代表团才以回台过新年为由，终止了这次漫长的扯皮会，回到了台湾。而5国代表团也达到了自己的目的，随着各国国会和皇帝批准了联合6国进攻台湾并最终占领台湾的计划，并从各自的殖民地或者国内派出了增援兵力，这种纯扯皮也就没有了意义。
1906年3月初，英国的第一波增援兵力抵达了香港，包括2艘邓肯级战列舰和3艘巡洋舰以及从印度抽调的2000名印度士兵。随后法国人从非洲抽调的1艘战列舰和一部分士兵，也陆续抵达越南。
就在英国军舰和运兵船通过马六甲海峡的时候，内务部就已经通过潜伏在当地的情报人员获得了英军增援部队已经抵达的情报，并及时送交了刘芾。刘芾立刻命令台湾的海陆两军，进入临战状态，取消了一切休假和例行巡逻护航的任务，全部人员按照事先制定好的计划，入驻自己的防区，随时准备对6国登陆部队的反击。
随后，台湾各个港口都被暂时关闭，港外由台湾的鱼雷艇部队开始布设水雷，任何进出船只都将由台湾海军带领，才能够安全出入。而台湾潜艇部队的基地，都实施了战时封锁，任何人未经国防部批准，都不能进出。
3月11日，6国联军在香港宣布成立，由英法德3国凑集的20多艘运兵船，开始从日本本土和海参崴把日本陆军和俄国陆军运往香港岛，头一批抵达香港的日本陆军就有1个整编常备师团，共计3万3千多人，其后，还将有1个日本师团和5000俄国陆军抵达。
3月15日，6国以联军的形式，向台湾政府发出最后的通牒，命令台湾政府解散非法政府和非法武装，向6国军队投降，而台湾将被6国接管，由6国统一管理，通牒的最后期限为3月20日。
在6国联军行程的过程中，还出了一个花絮，那就是美国政府的加入6国联军提议，在国会参众两院中未被通过，以美国西海岸和南部各州参议员和众议员为首的多数派，对于毫无利益的武力干涉一个岛国的军事行动，予以了否决。按照当时德州议员的话来说：与其动用宝贵的武力去干涉一个台湾，还不如投入到镇压菲律宾的独立起义中来的划算。就这样，美国海军和陆军无法正式参加6国联军，只得作为一个观察员，出动了一艘后勤舰和几十名海军军官，跟在6国后边权当几日游了。
最后通牒发出以后，台湾政府不仅没有回复，还宣布台湾周围海域30海里以内，为台湾领海，任何武装船只进入台湾领海，都将受到台湾海军的攻击。
这纯粹就是和6国对着干啊，6国联军见状也不等最后通牒到期了，在3月18日，就全军出动，以3艘战列舰3艘重型巡洋舰为主力，6艘巡洋舰和20多艘驱逐舰为先锋，浩浩荡荡的杀奔了台湾。
不得不说的是英国海军不愧为世界第一的海军，虽然他们也没有和潜艇正面交手过，但是仅凭着从日、俄两国海军幸存人员的描述中，就做出了一个非常正确的选择，那就是让驱逐舰和轻型巡洋舰游弋在主力舰队的四周，这样不仅能扩大舰队的观察范围，而且可以在必要的时候为主力舰船抵挡鱼雷的攻击。
而且，作为这次进攻台湾的杀手锏，并不是这只看似强大的海军舰队，而是另一支偷偷摸摸在深夜出发的运兵船队。这个方案是由日本陆军和海军提出来的，由于日本海军深知台湾潜艇的厉害，他们不太相信这只拼凑的貌似强大的6国舰队能一举突破台湾潜艇的防线，而深深的仇恨让日本人甘愿冒险，他们在6国军事会议上提出，让6国舰队带领着俄国的陆军为第一路进攻部队，而日本只需要借用20艘运兵船，且不动用以运抵香港的那一个师团的兵力，而是从日本本土再运一个兵团，分批抵达美国占领的菲律宾，然后再从菲律宾趁着夜色出发，在凌晨抵达台湾的南部海港杜寮，从杜寮港登陆，向台湾内陆发起进攻。
6国对于日本人的计划给予了充分的肯定，不仅提供了运兵船，还附送2艘驱逐舰担当护卫和炮火支援。在6国舰队出发的前一周，日本人就利用6国提供的商船，分批分波的把日本本土的常备第六师团运送到了美国占领的菲律宾，而且没有集中在马尼拉港，而是在菲律宾北部海岸的克拉维利亚附近建造了一个临时驻地。在这点上说，日本陆军很具有吃苦耐劳的精神，他们为了隐藏自己的行踪，到达隐蔽地以后，整整3万人，只带着随身的干粮，不用补给船运送补给，生生在一片被原始森林包围的海滩上熬了1个多礼拜，直到上船出发，才得到头一次补给。
日本人的苦没有白受，台湾间谍和潜艇，都只注意了各国的主要海军基地和作战船只，没有发现这些搭载着外国商船分批抵达的日本陆军，这也为日后的台湾陆上争夺打开了大门。