一路逃亡，西太后除了历尽千辛万苦，身体受创外，更让她难受的是洋鬼子提出了令她难以接受的‘议和’条件。
光绪二十六年九月五日，各国公使一致要求严惩载漪、载勋、载澜、刚毅、赵舒翘、董福祥等“罪魁祸首”。
消息传到西安，西太后辗转反侧，她对自己说：“洋鬼子口口声声惩办战争的罪魁祸首，他们第一矛头指的是我叶赫那拉氏，可是，外国公使不可能直接说出这一点。我那拉氏若能侥幸逃过这一劫，也是祖宗在阴间保佑我也。不过，拳民和甘军的确攻打了东交民巷的各国使馆，并放火烧了外国教堂，若大清朝不惩办几个凶手，恐怕他们不会撤出北京城。
这时，李鸿章、刘坤一、张之洞纷纷来电，奏明皇太后，若大清朝不严惩载漪、载勋、载澜、刚毅、赵舒翘、董福祥等人，外国公使是不愿意‘议和’的。
西太后归銮心切，她想起了当年咸丰皇帝“巡行木兰”却死在热河，如今的她也六十六岁了，她生怕死在西安，所以，她只好找来一批“替罪羊”。
光绪二十七年一月初三（一九零一年二月二十一日）西太后以光绪皇帝的名义发布上谕，谕令载勋自尽，毓贤正、法。载漪、载澜为监斩侯，加恩发往新疆，永远监禁。英年、赵舒翘令自尽，刚毅斩立决，徐桐监斩侯……
西太后的一大批心腹死的死，撤的撤，流的流，最终换来了叶赫那拉氏的“女皇”宝座。
光绪二十七年七月二十五日，清廷与德、奥、比、西、美、英、法、意、日、荷、俄十一国签订了《辛丑条约》，共十二款“
一、对德谢罪。
二、严惩祸首：处以斩决、赐死、永远监禁者达一百二十多人；
三、对日谢罪；
四、在外国坟墓被挖掘处建碑，建碑费用用一万五千万两白银由户部拨出；
五、禁止军火运人；
六、赔偿白银四五亿两；
七、各国使馆驻军，中国人不准在使馆区界内居住；
八、削平大沽炮台；
九、各国驻军留守通道；
十、永远禁止军民仇视外国人，永远禁止仇视各国的各种会道门；
十一、修改通商、行船等各项条款；
十二、改变总理各国事务衙门，以及各国驻华使节拜见皇帝的礼节。
远在西安的西太后一心庇护载漪等人，她一时难以接受洋鬼子的苛刻条件，她点告奕劻，希望奕劻再与外国公使周旋，能否修改条约，奕劻三天后复电：“外国公使态度强硬，条约没有修改的余地，若西安行宫的皇太后不能接受的话，外国公使将立刻在北京另立清政府！”
接到这份电报后，西太后吓得手脚发抖、面色苍白，她逼着光绪皇帝复电：“条约生效，日后永远不再有任何异议。”
丧权辱国的《辛丑条约》换来了西太后晚年的“安宁与幸福”
自从仓皇出逃至西安，一眨眼，一年多过去了，六十七岁的西太后不愿再西安久居。一来，她怕洋鬼子在北京另外扶植一个清政府；二来，随着她年龄的增长，她越来越怕死，更怕死在行宫。
每当夜深人静之时，西太后失眠中，她痛苦地想：“当年咸丰皇帝就是死在热河行宫的，今日我那拉氏也是被洋人逼得掏出京城，眼看着一年多过去了，留京大臣尚无几人上奏朝廷恳请回銮。难道说我这把老骨头要抛在异乡吗？”
越想，她越难过。
光绪二十七年八月初的一天，西太后对光绪皇帝说：“皇上，你瞧，秋风起，黄叶飘满地，眼见着冬天就要来临了！”
自从到了西安，光绪皇帝很少开口说话，他早已麻木。爱妃之死令他心如死灰，他不再去品尝悲哀和痛苦。对于西太后的客套话，他即便听了出来，他也不会去附和的。
“皇上，又出神了？想什么呢？”
西太后有些心酸，毕竟皇上是她的亲外甥，一个好端端的青年，如今呆呆傻傻的，叫她如何心安！
“皇上，该回銮了吧！如果现在不启程，一旦来了大风雪，恐怕又要在这儿过冬了。”
“怕什么，有火车坐，亲爸爸担心什么。”
皇后开了口。西太后叹了口气说：“皇城使皇上的家，哀家在宫里也生活了五十年，故土难离呀！”
说着，西太后落下了几滴眼泪。
光绪皇帝应付了一句：“那就回京城好了！只是回京后应厚葬珍儿，行吗？”
西太后点了点头：“当时也是迫不得已呀！把她留在宫里，万一洋鬼子闯进来把她糟蹋了，皇上不是更加难过吗？”
光绪皇帝的情绪一下子激动了起来：“当时完全可以带她一起走！”
西太后自知理亏，她小声的说：“珍儿就是脾气太犟，不然，亲爸爸也不会惩罚于她。”
“亲爸爸，孩子最难过的就是珍儿之死，所以，孩儿不想回京。”
西太后想：“皇上，对于这件事情，一年多来你耿耿于怀，看来不找个‘替罪羊’难平你心头只恨。”
于是，西太后说：“当时，亲爸爸正在气头上，说惩罚珍儿，难道真的要惩罚她吗？都是狗奴才崔玉贵害了珍儿。”
皇后也附和道：“珍妃死的好惨，亲爸爸，应严惩崔玉贵，以告慰珍妃的在天之灵。”
光绪皇帝也知道西太后不会自咎的，他说：“亲爸爸，今日就严惩那狗奴才！”
西太后立刻说：“好，立刻把崔玉贵逐出宫，发配新疆为奴！”
光绪皇帝急得大叫：“应斩首！”
西太后厉声道：“皇上，你是一国之君，应以慈悲为怀，怎可动不动就杀人！”
光绪皇帝不敢再说什么，他心底悲哀的默诵道：“珍儿，朕无能，不能为心爱的人儿报仇雪恨。朕只求一死，到阴间去陪你。”
光绪二十七年八月二十四日，两宫启銮，从西安向洛阳进发。
到了洛阳，西太后心头大喜，因为，她来的时候狼狈不堪，而今日回京，一路风风光光不必说，沿途大小官员的进贡让她眼花撩、乱、有古玩字画、奇珍异宝、地方特产、绫罗绸缎；更有堆积如山的银子、令人眩晕的珠宝；还有叫她赞不绝口的西洋玩意。
西太后五十年来拥有大清的江山，但她一直没感到满足，如今数不尽的宝物映入眼帘，她竟然欣喜若狂：“小李子，快清点一下，登记造册，全带回宫里。！”
李莲英高兴地回答：“嗻。”
自从二总管崔玉贵被逐出宫，小李子更勤快了。虽然，他也参与了谋害珍妃，但崔玉贵替他顶了罪，无论如何，西太后也舍不得把宠监李莲英加以治罪呀！
李莲英脸上挂着笑容，他像耗子一样窜来窜去，乐不可支。他忙着为主子敛财，而西太后忙着笼络人心，她召见了河南巡抚于荫霖。
于荫霖，一个思想守旧，但为官清廉的老臣，他于咸丰九年进士，曾任广东按察使、湖北巡抚。对于西太后的召见，他受宠若惊。
“皇上圣安！老佛爷圣安！臣于荫霖叩拜皇上、皇太后！”
六十六岁的老臣几乎跪不下去了，他艰难的跪在地下，西太后微笑着说：“爱卿免礼平身！”
于荫霖长跪不起，西太后纳闷儿了，她说：“爱卿快起身！”
于荫霖还是不动，李莲英凑近西太后，说：“洛阳人喊他‘于聋子’，可能他真的有些耳聋。”
西太后大叫：“免礼平身！”
于荫霖站了起来，他笑着说：“臣有些耳聋，请皇太后说话大声一些。”
西太后笑着说：“哀家这种声音，能听得见吗？”
“勉勉强强听见一点儿。”
西太后对小李子说：“哀家小声说，你大声喊。”
李莲英也笑着说：“今天遇到个聋子，奴才只好大喊大叫了，之时别震着老佛爷。”
“没关系”
于是，李莲英当起了‘翻译’。
西太后问：“爱卿，你那天到的洛阳？”
“初五就来了。臣本住在南阳，为迎驾圣驾，觐见皇上、皇太后，臣特来洛阳。”
西太后故作悲哀，她悲悲切切的说：“皇上与哀家离京一年多了，哀家无时无刻不在想念着皇宫。那日，洋鬼子闯入北京城，哀家本想组织官兵反抗，无奈，几个狗奴才硬是拉拉扯扯把哀家与皇上带出了京城。现在回想起来很是心痛。”
于荫霖连忙磕头，说：“幸亏皇上、皇太后出了京，不然，后果难以想象。”
西太后惨淡的说：“爱卿能理解就好！”
接着西太后又安抚了几句，她问长问短，于荫霖感动的流下了眼泪。他想不到高高在上的西太后竟然如此的体察民情、体恤臣子。于荫霖感动的说：“老佛爷，臣愿为大清捐了我这把老骨头，只要老佛爷一声令下，臣赴汤蹈火，在所不辞！”
于荫霖又扣了三个响头。西太后心想：“原来我那拉氏不是骂名一片，我还有些人缘。”