中小企业被忽视 彭明辉：设「研发基金」助扶植
全国中小企业总会理事长林秉彬感慨，中小企业占台湾企业总数的97.7%，吸纳台湾78%的就业人口，是对经济发展贡献最大的族群，但目前三位总统候选人都未提出对中小企业实质的「照顾」政策。对此，清大动力机械系教授彭明辉提议，可以成立「研发基金」扶植中小企业。
彭明辉在部落格上写了一篇《一个「研发基金」的倡议》，指出「政府给大财团的钱，到底有几％流注到中小企业？假如把这些钱直接给中小企业，是不是可以创造更多的就业机会？」他提出当全球普遍发生青年失业潮，有必要思考：「台湾的首要目标是追求GDP的成长而牺牲就业率？还是要发展中小企业来促进就业？甚至培植优秀的中小企业来从事研发，以便同时提升GDP与就业率？」
彭明辉指出，台湾政府以为中小企业没有研发能力，但在亚洲新兴国家和韩国的竞争下，没有研发能立的中小企业将很难生存，「政府并没有积极在检讨如何修改相关政策，以便让有能力且有心于研发的中小企业得到必要的挹注。」
他提出三合化学股份有限公司负责人周治忠，以个人经历提供的具体案例。周治忠是清大工化第一届毕业生，留学美国后回台服务，后来自创三合化学，十几年前，他大幅投入研发，希望取得关键技术的突破性发展后，可以得到政府协助，取得转型所需要的资金，「后来该公司发展出生质燃料关键技术的酵素转酯化技术（ET Process; Enzymatic Transesterification Process），并取得美国专利（US 7473539）与欧洲专利（EP1637610），但是在进一步向潜在金主证实其专利之商业价值前，他必须要建造一示范工厂（Demonstration plant）。偏偏，在这阶段他的资金已经用罄。」
而经济部各种研发补助，对于中小企业设定额度都太低，无法支持难度较高、资金需求也较高的研发，周治忠想以专利向银行贷款，但是国内智财评估制度和专业能力尚在起步阶段，无法解决他的困境。
彭明辉举出英国的例子，「英国皇家学院（Royal society）有募集而来的非营利基金The Royal Society Enterprise Fund，专门协助有商业潜力、科学卓越性，且友善环境的小公司，让他们可以用基金去发展与成长。而且靠着皇家学院各领域的杰出专业人才，来评估与遴选有潜力的小公司，有机会比商业化的创投在更早期看见这家公司的潜力，也有机会加速科学研究成果的商业化」，重点是「造福人类，而不是造福财团或创造GDP」。
彭明辉表示，周治忠希望能在台湾发起如英国的这样一个「私人合资的非营利公益基金」，奖励中小企业从事有助于台湾社会发展的研发。他呼吁有兴趣或意愿者可与他或周治忠联系。