逾两成河川污染程度增加 阿公店溪恶化最严重
环保署公布去年河川水质检测结果，全台50条主次要河川，和前年（99年度）相较，11条水质变差，10条变好，其中阿公店溪流域最短，却有高达9成6河段严重污染；北港溪严重污染长度高达38.7公里，两河川污染程度最严重。环保署表示，严重污染的5条恶化流域将进行源头减量并积极推动污水下水道建设。
环保署指出，河川环境的维护与民众生活息息相关，为推动河川流域复育及再生，环保署自97年起积极推动「河川及海洋水质维护改善计划（第2期）」，就行政管理、工程技术等各个面向，全面推动河川水质的维护改善工作。
环保署表示，目前已完成新北市中港大排与湳仔沟、屏东县万年溪、高雄市凤山溪、台中市柳川等5条都会型河川的阶段性整治，相关截污措施(包括污水截流、现地水质净化等)每日共可处理约34万4,800公吨之废水排入河川，等今年基隆市田寮河截流工程及桃园县老街溪新势公园砾间氧化工程完成后，处理水量将可提升至每日43万2,800公吨，削减河川中生化需氧量(BOD)每日达2万7,900公斤，如果以每人每日污染当量40公克估算，共可减少约70万人产生的污染量。如将提供民众亲水游憩、提升居住品质及促进地方观光等附加效益纳入考量，受惠民众可达172万人。
环保署也指出，全国各地已完成98处以上的现地水质净化处理设施，总面积达521公顷，总处理水量每日达56万5,000公吨，削减水中生化需氧量(BOD)每日约8,500公斤。
由于公部门资源有限，环保署自91年起开始推动各地方政府成立河川巡守队，截至100年止，全国共已成立357队水环境巡守队，队员计9,863人，举发处理污染案件（发现不明排水管路、暗管、废水排放等）数150件，办理净溪、净川活动1,146场次。相关巡检成果、污染点通报等讯息，均可透过该署建置之「水环境保育网」(http://ecolife.epa.gov.tw/conservation/)查询，而善用资讯媒介，也为民众参与水环境巡守、关怀乡土的有效工具。
借由前述整合性策略及制度之推动执行，河川水质已有所改善。全国50条主次要河川严重污染河段长度由92年15.8％降至100年6.0%，未（稍）受污染河川比例，从92年的59.4%，改善至100年的63.3%。其中淡水河、南崁溪、老街溪、浊水溪、新虎尾溪、急水溪、盐水溪、二仁溪及爱河等9条重点河川的严重污染长度，从96年之12.8%下降至100年的11.7%；河川不缺氧（溶氧大于2mg/L）之合格率，从96年83.9%提升至100年的86.2%。