台湾民政府是独派吗？成员宣称台独反遭指控「叛乱」
洪素珠之乱延烧全台，连带其所属的「台湾民政府」也成为众矢之的，由于其名称很容易和台独做联想，导致有些人将其视为是台独组织之一，但事实上台湾民政府的主张并非台独，而是「美统」或「日统」。
台湾民政府官网中针对美、日对台关系的部分指出，台湾是从日本分离，依旧金山和平条约，并不附属任何一方，台湾之领土及人民，最先是因战败而被美国军事占领，后因旧金山和平条约规定，台湾地位之现状是已和母国日本「事实分离」，而美国依照和约继续占领。
针对台湾人民是否享有主权的部分则强调，台湾先民对政权并无概念及意图，未曾建构统一台湾之主权，「故本土台湾人并无资格称拥有台湾主权」。台湾主权是由日本天皇所建构完成的，因而无需以归还(return)之方式。
谈话性节目《新闻挖挖哇》也指出，台湾民政府的「阁员」曾在2013年前往华府办记者会，过程中提及「我们台湾是独立的国家」因此遭到台湾民政府视为是「叛乱内阁」。
针对民政府在网路上的评价，网友表示「他们算诈骗集团而已啦 」、「不过会被骗去买身分证的 大多是台独的」、「邪教」。