超级细菌怎么来? 英国研究团队发现新线索

(示意图/Shutterstock)

抗生素治疗可以抑制细菌生长,但当抗生素滥用、具有抗生素抗药性(antibiotic resistance)的微生物数量增加繁衍,会使得抗生素治疗策略效果降低。根据英国政府委托研究估计,2050 年全球可能有 1,000 万人死于抗药细菌感染,例如院内感染常见的金黄色葡萄球菌(MRSA)、艰难梭状芽孢杆菌(C. difficile)。

近期一项由伦敦帝国学院(Imperial College of London)团队发布于 Nature Microbiology 研究,不仅确认细菌之间会透过接合作用(conjugation)交换获取具有抗药性的 DNA,团队也找到了参与接合作用的主要蛋白,对于未来预测研究传递抗药性基因的高风险细菌提供许多线索。

●以冷冻电子显微技术 观察蛋白接合作用

尽管科学家从 1940 年代起,就已经得知细菌之间的接合作用与基因交流有关,但细菌之间是如何进行紧密附着,使得粒线体 DNA 或质体(plasmid) DNA 可以借此途径传递、交换或者重组,详细机制仍所知有限。

为了观察细菌的接合作用如何产生,研究团队采用冷冻电子显微技术(cryo-electron microscopy),用于观察细菌之间蛋白分子接合过程。

●TraN 蛋白促成细菌交换基因

该研究发现来自基因供应细菌的 TraN 蛋白,是促成接合作用的重要关键。TraN 在供应基因的细菌表面像是扮演「插头」,可以附着在细胞膜表面有对应「插座」的受体细菌上,让质体基因可以有效率在两细菌间交换。除此 TraN 蛋白有四种变体,每一种构型都有对应的受体细菌,也就是表现出与特定细菌接合(conjugation species-specificity)特性。

在了解细菌接合作用如何发生后,团队再运用 AI 与生物资讯分析 TraN 蛋白与人类常见的抗药性微生物种,比对结果发现与此类微生物带有抗药性质体的特性吻合,例如肠道菌科(Enterobacteriaceae)中的​​沙门氏菌(Salmonella)、大肠杆菌(E. coli),反映出多带有含抗药性基因质体的现状。

本研究揭开细菌抗生素抗药性与接合作用的关系,并指出主导该作用的重要蛋白 TraN,对于未来预测微生物产生抗药性机制是一大突破,尤其在已知带有抗药性质体 DNA 的微生物种中,可借由介入接合作用防止基因交换、与加剧的抗药性反应。