担任中科院顾问？ 吴昆茂声明：仅短期交流没任职
行政院16日宣布由前东华大学校长吴茂昆担任教育部长，却爆出他过去曾赴中上课、甚至到中国国家科学研究院担任顾问。对此，他17日发布声明澄清，他只是赴中短期交流，并没有答应任何职位，一切都符合规定。
吴茂昆声明指出，台湾中研院物理所和中国国家科学研究院，自2008年起签署合作协议，双方研究人员彼此参与相关的学术交流与活动。与该院的合作也就仅在学术的、短期的、演讲交流等活动。该院部分年轻的研究员确实曾希望他能在部分的计划上给予更多咨询，但因时间安排及自己的研究规划，并未参与后续相关会议，亦未答应任何的职位。
吴茂昆强调，赴中国都是进行短期的学术演讲交流活动，中研院的研究员皆为公务人员，赴中国必须事先申请。「本人赴中交流都符合规定。」
针对此事，不少民进党立委也纷纷要求吴茂昆出面说法楚，立委许智杰表示，内政部长叶俊荣就会坦承，吴茂昆应该也要讲清楚，若是有赴中兼课就不允许，短期讲课就没问题；立委何欣纯也说，请吴茂昆亲自说清楚，只要没违规就尊重；赵天麟则说，用最高标准来检验吴茂昆，再检验管中闵，这不是不好的，如果吴有违背两岸条例违法担任顾问，相信在任命前就有厘清，如果有通过标准，再来处理管中闵案更好，他相信吴会通过考验。
中研院也说明，物理所分别在2008年和2017年与中国国家科学院物理所签署备忘录，「双方研究人员均会在此架构下进行学术咨询及研究交流活动」。