马习会档案未移交？总统府：应由前任政府来说明
根据媒体报导，国安单位对于2015年的「马习会」如何成形？双方会前如何秘密接触等最重要部分，相关档案却付之阙如，质疑马政府有隐藏未留给下任政府。对此，总统府强调，该专案之执行为前届政府执政期间，应由前届政府主责者与相关人员澄清说明。
前总统马英九曾在2015年与中国国家主席习近平举行两岸多年来最大突破的「马习会」，引发国际关注，如今却传出国安单位在分析过去习近平与台湾打交道过程，对于马习会如何成形、双方会前如何秘密接触等最重要部分，相关档案却付之阙如，质疑马政府有隐藏未留给下任政府。
针对媒体报导，质疑有关前届政府办理马习会相关档案移交一事，总统府指出，据查，国家安全会议在2016年5月20日进行政权交接后，获移交有关「马习会」专案档案，主要内容涵括有本专案大事节略、办理期间行政协调记录、「马习会」当天会议记录以及相关国内外舆情简报等四个部分档案在案。档案记述期间自前陆委会主委夏立言揭露2015年10月14日「夏张会」起至「马习会」会谈结束。
总统府表示，由于当年该专案之执行为前届政府执政期间，上述期间及前后，是否有其他文件、纪录应依档案法等规定列入档案并移交，应由前届政府主责者与相关人员澄清说明。