MiLaboratories 喜获千万美元,助燃基因组研究

DNA 测序技术的进步以及下一代测序(NGS)技术所产生的大量基因组数据,为面向生物学家的软件创建提供了一个创业机遇,以便他们能更轻松地分析这些大数据并实现新的跨越。这在开发新疫苗、癌症治疗等方面可能会有所助益。

在过去的四年里,MiLaboratories这家总部位于旧金山、在西班牙毕尔巴鄂设有研发机构的初创公司,一直在搭建一个计算生物学平台,以让生物学家更轻松地处理、分析和整合他们的数据。它融合了数据可视化和生成式人工智能等功能,以提高可用性。

其平台还被设计成其他科学家的一个市场,以便他们能够以应用程序的形式分发更专业的计算工具,持续扩大基因组研究群体的效用。MiLaboratories 以那些技能涵盖生物学、计算机科学和数学的人为目标——即所谓的生物信息学家。

首席执行官斯坦·波斯拉夫斯基告诉 TechCrunch:“对于生物学家来说,这是一种‘无代码’式的方法,并且我们还发布了一个[开源]SDK——软件开发工具包——允许生物信息学家构建真正的应用程序。”

他解释道:“在我和我们创始人的科学生涯中,我们看到了在现代疗法、现代药物的开发方式上存在着巨大的低效率……。因为在数据——由生物学家产生的大数据、测序数据——和他们无法获取的数据分析之间存在这种摩擦。”

虽然有“数千个”能够对 NGS 数据进行分析的软件程序和工具,但他说大多数是在学术界开发的,在那里重点往往在于实用性而非可用性。

他说,生物学家还需要汇总和整合来自多次分析的结果。“在一个统一的图景中,使您能够明白正在发生的事。”他建议道。

这家初创公司希望其平台能够让生物信息学家摆脱处理基因组数据处理这种苦差事,这样这些多学科科学家就能将他们的技能应用于构建可能有助于推进前沿科学的更复杂的算法任务。

波斯拉夫斯基说:“生物信息学家实际上花了很多时间,只是为生物学家运行软件做些单调乏味的工作。“要处理这些数据,您得有 Linux 机器,通过 SSH,运行复杂的软件工具来完成分析,从数据中获取见解。”

“[一位医生]没有在 Linux 上、在高性能计算集群上做这件事的技能,因为他有其他事情要做。而这实际上就是公司和学术界的大多数生物信息学家正在做的,只是每月运行这些工具的工作。”

周四,MiLaboratories 正式揭开了其 SDK——Platforma.bio的面纱,该平台允许第三方开发者贡献应用程序,尽管它已经进行了数年的 alpha 和 beta 测试。(波斯拉夫斯基说“大约 300 个实验室”一直在使用 beta 版,并且“大约 20 个”应用程序已经通过该平台提供,到目前为止。)

“该平台上首批可用的应用程序是围绕我们的生物学和生物信息学应用程序构建的,这些应用程序非常受欢迎……[在]参与免疫疗法开发的公司和人员中。但我们已经……有众多合作选择,也有很多人愿意将他们的应用程序带到这个平台上,既有来自学术界的,也有来自行业的,”他补充道。

这家于 2021 年成立的初创公司还宣布了一轮 1000 万美元的 A 轮融资活动,以继续发展,重点是投资于社区建设。

“筹集资金的关键原因只是为了让更多人参与到我们平台的开发工作中。我们正在招聘更多的工程师。我们正在招聘所谓的开发者倡导者,他们主要在——学术界——传播这项技术,因为大多数生物信息学软件都是在学术界开发的。”

“在接下来的一年里,我们将专注于在社区中传播这项技术,并吸引社区来构建他们的应用程序,包装他们现有的软件,通过平台交付,”他补充道。

MiLaboratories 的 A 轮融资由总部位于马德里的 Kfund 领投,Acrobator Ventures、EGB Capital、Courtyard Ventures、Somersault Ventures、Speedinvest 和 Ten13 参与其中。

Kfund 的普通合伙人米格尔·阿里亚斯(Miguel Arias)在一份声明中评论道:“投资那些能够弥合开发者(在此情形下为生物信息学家)与商业用户(在此情形下为生物学家)之间差距的平台,乃是我们基金的核心工作意向。”

MiLaboratories 免费为学者提供其软件,同时也通过付费模式从商业用户那里获取收入。波斯拉夫斯基(Poslavsky)称,该初创公司现阶段付费客户数量正接近 100 个。

“许多大型制药公司——如 Moderna、百时美施贵宝(Bristol-Myers Squibb)——都是我们的客户,”他指出,并补充道:“我们有收入——不错的收入——这使我们不那么依赖风险投资。”

2022 年初,该初创公司筹集了 250 万美元的种子轮资金。此前,它还从几位天使投资人那里获得了一小笔种子前轮资金。

在讨论开发计算生物学平台面临的挑战时,波斯拉夫斯基(Poslavsky)表示,新一代测序(NGS)所产生的数据量十分惊人,这意味着初创公司必须极其谨慎地关注并确保处理效率,以避免产生“高昂的成本”。

“在该领域生成的数据量实际上多得惊人,”他强调说。“大型制药公司,我们的客户……到目前为止,他们已经生成了数拍字节的基因数据。所以规模非常大。”

MiLaboratories 开发了波斯拉夫斯基称之为“非常复杂”和“经过数学验证”的技术,该技术允许以“非常优化的方式”执行多种计算。他表示,这项已获得专利的技术使该平台的效率比其他一些类型的计算工作流程高出 10 倍。

“这是非常重要的一点。这对生物学家来说是隐藏的——因为对生物学家来说,有价值的主张是‘我想点击按钮并获得见解’——但对企业主来说非常重要。”

在竞争方面,波斯拉夫斯基称Seqera(及其 Nextflow 软件)为最接近的竞争对手——就受欢迎程度和价值主张而言。还有用于 NGS 处理的开源工具,如Galaxy,但 MiLaboratories 认为其平台为研究人员提供了获取数据见解的更便捷途径。

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