酵母菌没了必要基因能生存还能开发药物 中研院发现基因奥秘 

研究团队包括,台湾大学基因体与系统生物学程学生王宣凯、基因体研究中心博士董璐、博士张尚麟、副主任张典显(左至右)。(图/中央研究院提供)

记者崔至云台北报导

酵母菌可以用来酿酒与烘焙,而酵母菌6000多个基因中,其中1000多个基因是不可或缺的「必要基因」(Essential gene)。原本认为必要基因一旦被剔除,细胞必死无疑,但中央研究院研究团队发现,必要基因PRP28若删除,酵母菌还能活着,甚至在开发药物时,可协助调整整体平衡。

该研究第一作者张尚麟指出,在负责剪接RNA的剪接体 (Spliceosome)中,「PRP28」是一个不可或缺的零组件。当失去了「PRP28」,RNA剪接无法进行,细胞就会死掉。但团队发现,将「PRP28」搭配的零组件进行互补性的改变,细胞就可以不需要「PRP28」,但这种缺少「PRP28」的酵母菌因为RNA剪接效率低,导致生长得比较差。

研究团队利用酵母菌,做了一个缩时演化实境秀,让缺少了必要生长基因的酵母菌在实验室演化,产生适应性突变,并一路观察生长速度是否加快,最后达到最佳状态,失去「PRP28」的酵母菌经过了300个世代演化之后,出乎意料地回到了健康的状态,上演了绝处逢生的大惊奇。

▲▼研究团队利缩时演化实境秀呈现酵母菌的演变过程。(图/中央研究院提供)

深入调查后研究团队发现,演化后的酵母菌可借由降低上游转录(Transcription)的效率,让转录与RNA剪接(Splicing)再度同步化,像是一种负负得正的概念,借此重新优化细胞整体基因的表现。实验结果也显示,生物系统中有许多错综复杂的基因表现路径,不同步骤可以互相影响(例如:RNA转录与RNA剪接),让大众更了解细胞运转逻辑与生物系统的演化。这个观念可以被运用到生物系统的优化,提供未来设计调控生物系统的新路径,比如说,在开发治疗疾病药物。

论文已在今年11月登上国际学术期刊《自然生态演化》(Nature Ecology and Evolution),共同作者包括:台湾大学基因体与系统生物学博士班学生王宣凯,以及基因体研究中心博士后研究员董璐。