反核代价？火力发电排碳量 3年大增1200万吨
随着反核声浪逐渐扩大，自2015年核一1号机大修完重启遭立院杯葛起，陆续共有3部机组不能启动。据台电统计，虽说将这些暂停的机组改以燃煤、燃气取代，然而自2015累积迄今的碳排量也将增加1,200万吨，空气污染物氮氧化物（NOX）也会多排放将近千万吨。
2014年12月10日，核一1号机大修时发现燃料把手松脱，在隔年1月修复却未获立院同意重启；2016年5月16日，核二2号机发电机跳脱，同样遭立院杯葛无法再启动，两部机组停摆至今。今年核一2号机燃料池满，因新北市不发给干式贮存场水土保持完工证明，6月起等同提前除役，目前合计共有3部核能机组无法启用。
目前国内三座核电厂，一年会发400亿度电，若扣除停摆机组，每年至少少了100亿度电，迫使台电必须改以燃煤、燃气等火力机组取代。据报导，有台电主管表示，大概需以一半燃煤、一半燃气补足。
然而因燃煤每度发电排碳约0.8公斤，比燃气的0.4公斤足足高出一倍，加上原先使用核能的排碳量为0，使得国内发电排碳量大幅攀升。
据统计，2014年时，台电一年排放的温室气体为8,489万吨，自2015年起变大幅攀升至8536万吨，2016年更直接逼近9,050万吨。总计2015至2017的碳排放量，比起核电未停前多排出1,200万吨二氧化碳，台电主管便指出「多出来的量，是停掉核能机组，改以火力取代的结果。」
因截至目前仍有一半核能机组不能运转，据台电计算，排碳量仍会维持在9,050万吨上下，且不只温室气体，烧煤烧气也会排放氮氧化物，3年下来竟也累计了近千万吨。
台电主管表示，面对核能提前退场，台电希望能藉更新就有设备，以达到效率的提升，近几年目标是将排碳量维持在9000万吨出头水准，至少不要再持续增加。估计到2024年，当开始大量使用再生能源后，才有机会全面取代「2025年非核家园」后所减少的400亿度电。
对非核排碳量增加，经济部能源局局长林全能回应：「短期内起起伏伏难免」。他表示，我国减碳目标，一个是自愿性配合的国家自主减排贡献（INDC）：2030年要比2005年减排20%；另一个则是温减法明定的，2050年要比2005年减排50%。经济部将从「增加低碳发电」与「新节电运动」并进，达成法定目标。