吴士存：蔡藉南海仲裁搞台独
「2016年海峡两岸南海问题学术研讨会」两岸与会学者合影。（记者张国威摄）
由中国南海研究院举办的「2016年海峡两岸南海问题学术研讨会─仲裁庭裁决后两岸关系的挑战与合作」，25、26日在海南海口举行，中国南海研究院院长吴士存25日于会上表示，总统蔡英文欲借由南海仲裁案裁决结果切割大陆，谋求台独；蔡从未主张南海断续线（U型线），大陆不用对蔡英文抱持太多幻想，他总结说，蔡将「切割大陆、追随美日、联合东协、谋求台独」。
吴士存表示，南海仲裁案裁决对蔡英文来说，给了她清晰阐明民进党立场与大陆切割关系的机会。蔡英文欲借由此次仲裁机会，把台湾在南沙的主权，仅限于使用太平岛的论述一次性确立。就他观察，未来蔡英文的南海政策可用4句话概括，那就是「切割大陆、追随美日、联合东协、谋求台独」。
吴士存指出，大陆学界目前正探讨要如何防止蔡英文的南海政策在仲裁结果出炉后急速后退，以致冲击两岸关系。虽然蔡英文在南海政策倒退是必然，但也不能退得太快，若因此让大陆联系到其台独走向，两岸关系势必也会加速倒退。
因此，吴士存表示，探讨两岸在南海如何合作，成为大陆紧迫的课题，目前大陆对台的南海合作方针是持续「学术交流、维持机制、聚焦仲裁、功能合作、等待时机、顺势而为」。
他指出，大陆学界即将与台湾方面的智库成立两岸学术指导委员会，委员会以应对仲裁裁决结果作为突破，组织两岸专家撰写研究报告，批驳仲裁案。
吴士存认为，两岸专家委员会可探讨划设太平岛及南沙群岛的领海基线，为挑战南海仲裁裁决做必要法律准备，目前台湾已考虑在这点上加以运作；同时并探讨两岸在太平岛、黄岩岛建立海洋生态保护区的可能性，目前大陆已经在做准备，台湾也可考虑加以仿效。
划领海基线 设生态区
政治大学台湾安全研究中心执行长刘复国则表示，蔡英文在南海主张上的退缩，并强调更多参与「多边机制」的政策作为，反而将导致台湾在南海问题进一步被边缘化。
刘复国认为，在当前两岸关系停滞的背景下，两岸多年来的南海学术交流机制，将在两岸南海维权中扮演更重要的角色，两岸专家学者应围绕重点议题，开展建设性的研讨合作，凝聚共识，保持两岸在南海研究上的同步，为两岸官方决策提供可操作性建议，以实际行动展现两岸合作姿态。