学院各系差太大不适合不分系

不分系正流行，但不是所有学院都适合不分系：学科专业程度较高、学院内各系同质性不够高的都不适合不分系。

学科专业程度较高的例如语言学院，因为各语言差别很大，不适合不分系；又例如医学院各系的学习领域「泾渭分明」，扣掉大一必修，各系日后几乎各上各的，因此也不太可能不分系。

医学院还有一个理由不适合不分系。以台大医学系与护理系为例，虽然在同一个学院，但是各系招生录取分数相差悬殊，如果不分系招生将造成困扰，日后分流作业更麻烦。

以学院而言，同质性较高的学院比较容易不分系，因此各校多从管理学院试办不分系。但如社会科学院各系学术性质差异过大，如政治、法律、经济、社会系等其实没有太大交集，修读领域各自独立，且会读这类科系的学生本身目的就比较明确，所以不太需要「延后分流」，反而是鼓励双主修或辅系。

有些情况是学校课程问题。例如96学年度中山大学理学院大一不分系，规定在普通化学、普通物理、普通生物学、线性代数等4科专业科目中，至少选修二科。后来有分流进物理系的学生没修过普物，课程无法衔接。

还有一种情况是学院内各系规模差太大，或学生选择科系冷热差太多，也不适合不分系。如实施2年就「收摊」的中山大学管院不分系，学生日后分流时都跑到某个热门科系，造成该系师资不足，而其他系却开不成课。