中科院曾爆2起共谍案 叶文渊潜逃
商人叶文渊涉嫌窃取中科院军事机密，弃保逃亡遭通缉。（摘自调查局官网）
中科院曾发生2起重大共谍案，其中艾伊喜科技公司负责人叶文渊，涉嫌勾结中科院人员窃取台湾评估TMD战区飞弹防御、国军建制计划，并替大陆搜购美制红外线夜视摄影机、飞行员夜视镜等战略性高科技管制品，他弃保潜逃遭通缉，逃亡大陆期间，并试图跨海渗透昔日中科院旧识，欲窃取机密，被调查局列为「追缉外逃要犯」。
据指出，前中科院雄风作业室技正小组长黄正安被控2003年搜集「凤凰遥攻精灵炸弹」、「擎天计划」机密，透过与中共军方熟识的大陆女子，与中共军方联系，幸未完成交易。
黄另与埃及空军联系，亲赴开罗向埃及空军高层简报，协议以6600万美元销售250套「凤凰遥攻精灵炸弹」予埃及空军，但尚未交付即被捕。黄被判刑8年确定，已经出狱。
原名叶裕镇的商人叶文渊，曾在中科院第三所设计中心受训，后赴大陆经商，受陆方指示返台，叶自2002年10月起透过任职中科院电子系统研究所旧识陈士良，搜集台湾评估战区飞弹防御等机密文件，制成光碟携往大陆。叶一度遭羁押，羁押期满获30万元交保，2004年高院审理期间，偷渡逃亡大陆，高院2004年7月通缉叶。
叶逃到大陆后，续受中共国安单位指使，与曾任职中科院第一所及工研院汪姓旧识联络，2008年2月叶寄3封电子邮件给汪，要求搜集雄风导航模组、A400M军事运输机10项机密。