统独立场变变变！李登辉从国统会主席到台独精神领袖
李登辉在总统任内倡议两岸定位应是「特殊的国与国关系」，让他赢得「台独教父」的称号，不过李曾在接受专访时强调，他从未主张过「台湾独立」，因为台湾已经实质独立。唯晚年又主张举行独立公投，并以台湾名义加入联合国。
李登辉长期被独派尊为精神领袖，但当年蒋经国担任总统，选择李作为接班人，却是因为他「反台独」立场。
追随蒋经国16年的前总统府副秘书长张祖诒曾在书中披露，担任台湾省主席时期的李登辉，曾在回答党外议员提出台湾独立问题时，铿锵有力地回答「中国历史没有抛弃台湾，台湾怎能脱离中国大陆」。次日蒋经国阅报时频频点头，连说「很好、很好」，不到两个月，就在国民党中全会通过提名李登辉为接班的副总统候选人。
1988年2月，李在继任总统后首次记者会上也宣布「只有一个中国而没有两个中国的政策。我们必须以三民主义统一中国」。1991年，李以国统会主席身分主持国统会通过的《国家统一纲领》，写着「台湾是中国一部分，大陆也是中国的一部分」。
1996年李登辉当选首任民选总统后，言论开始出现台独倾向。1999年接受德国之声专访，李登辉表示，两岸关系是「特殊的国与国关系」，也就是著名的「两国论」，至此被视为独派领袖。
不过李登辉晚年出版《余生：我的生命之旅与台湾民主之路》中谈到，台湾的现状是不属于中国，与中华人民共和国是个别存在，所以他未曾主张台独。
2007年李接受媒体专访时更进一步说，他不是「台独教父」，台独本身是假议题，因为台湾已经是主权独立的国家，「只是现在的名字叫做中华民国」。
他说，国家正常化才是接下来的目标，而正名、制宪、建立国家认同、加入联合国则是国家正常化的要素。
2018年「二二八事件」71周年时，李登辉在台独组织「喜乐岛联盟」筹组记者会上表示，台湾应举行独立公投，并以台湾名义加入联合国，「我认为现在已经是采取行动完成这个目标（台湾正名）的时候了。」