真菌研究小帮手 影像变化一把抓

中央研究院分子生物研究所助研究员薛雁冰团队，开发一套影像分析软体工具「真菌形态追踪器」，可「定量」描述真菌生长，帮助科学家对真菌型态及其生长的定量进行分析。（中研院提供／李侑珊台北传真）

真菌于地球上几乎无所不在，包含酵母、霉菌等微生物以及菇类都属于真菌，跟人类生活息息相关。自然界中约有超过500万种不同的真菌，其中大部分为丝状真菌。

如果你曾经把面包放到发霉，有天蓦然回首，会发现面包长出一块一块的霉菌菌丝，但很难精准描述其生长速度、生长范围、菌丝长度。由于缺乏有效定量分析方法，尽管丝状真菌多样性极高且普遍存在于大自然中，科学家们对于大多数的真菌种类之型态、或其生长的了解十分有限。

中央研究院分子生物研究所助研究员薛雁冰团队研发「真菌形态追踪器」，可在单一影像中，计算真菌孢子的数量、量测孢子的形状大小，更能观察错综复杂的菌丝生长样貌，例如菌丝总长度、分叉数目、菌落面积等。同时，也能借由分析缩时影像纪录观察真菌菌丝随着时间所发生的变化；更重要的是，软体比起利用传统人工方式计算，可以更快速地收集到准确的量化数据。

这个电脑视觉技术可比较野生型真菌和突变型的真菌，两者菌株生长情况有何不同？并且可以非常精确的做定量的测量描述。

薛雁冰表示，当团队发现不同菌株之间，看似有生长差异，但是却很难用定量的方式来描述时，「真菌形态追踪器」便能够提供一个快速的方法，精准分析菌株差异，了解菌丝长度密度、菌丝分枝数量与菌落面积。当有了这些资料，就有机会了解真菌生长如何被基因调控。