科学家新视野》基因检测技术的突破 台湾罕病新未来

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基于保障新生儿的健康,我国自1984年开始进行「新生儿先天代谢异常疾病筛检」(以下简称新生儿筛检),并逐年增加筛检项目。至2019年,筛检补助项目已增至21项,其中大多可由基因检测技术准确诊断。

传统新生儿筛检是测量血中代谢物是否异常,但新生儿的生理变化可能受到母体影响,不一定是疾病造成,必须搭配后续的追踪检测才能确认。新生儿筛检目的是在最短时间作出正确的诊断,并及时给予治疗,若延缓治疗可能影响智力发展或失去性命。此时,新世代基因检测技术就提供了很大的协助,能更精准判断疾病,把握治疗黄金时间并减少伪阳性家长与新生儿的冲击。以下为三项常用的新世代基因检测技术及应用:

1.基因变异热点分析

隐性遗传疾病「瓜胺血症第二型」(Citrullinemia Type II)为例,刚出生的新生儿患者,血中会短暂出现瓜胺酸轻微上升的现象,若错过此黄金检测期,就要等到2-3个月大时出现胆汁郁积症(neonatal intrahepatic cholestasis caused by citrin deficiency,NICCD)才可能被诊断出来。过去在新生儿筛检中,往往发现数量非常多的瓜胺酸异常上升个案,若能及时进行基因变异热点分析,即可确诊并进行后续追踪与治疗。此种方式,一来可以有效减少医疗负担,二来可以在新生儿出现胆汁郁积前给予预防指导。现有数据显示,在4万7千名新生儿的试验中,约有 300名需要进行基因变异热点分析,最后找出2名确诊个案。

2.次世代目标基因套组定序分析

在罕见脂肪酸代谢异常疾病中,新生儿可能短暂出现轻微的血中代谢物上升,如未给予正确诊断,之后可能出现急性代谢失衡、死亡等严重后果。但这类疾病没有好发的基因变异,因此需要使用特定目标基因的分析,才能全面检测,目前使用的次世代目标基因套组定序分析,可在3周后就得出报告

3.全外显子定序分析

以「严重复合型免疫缺乏症」(severe combined immunodeficiency,SCID)为例,已知这些免疫缺乏与100种以上的基因异常有关,一旦确诊需立即进行干细胞移植,最佳时机是在出生后3个月内。一旦被高度怀疑患病,要在最短时间内获得基因检测结果。基因检测也是个人化医疗的重要参考,因不同的基因异常,使用的移植疗程也不同。台大医院小儿部曾利用此分析,成功在一名患病新生儿出生后第12天得知基因变异的位置,此案也是全台首位因这变异而导致该病症案例

新世代基因检测技术可提高疾病确诊率,也争取到更多治疗时机。然而,若没有利用传统新生儿筛检协助判读,直接作为第一线检测,如英国正在进行的新生儿全基因体定序先驱计划,很可能成为一种「基因算命」,解码数千种遗传性疾病后,一种结果却各自表述,将会带来更多的冲击与争议。每种疾病的健康风险不同,同时发生代谢物异常与基因变异不代表一定患病,得出检测结果后,仍需由遗传专科医师给予适当解释,处置与后续追踪。

医师简介/简颖秀医师,台大医院基因医学部暨小儿部主治医师医学院临床教授